2019年初，尚未開工的滬通鐵路二期又遭遇了變數，在上海市政協，有代表提議要增加滬通鐵路二期的楊行站，這在滬通鐵路二期迫切需要開工的時候，似乎提議已經太晚了。
關於滬通鐵路是否有一個楊行站，這對上海鐵路樞紐其實並不是一個重要的問題，但如果到了2019年還要更改滬通鐵路二期的方案，對於這條城際鐵路的進度，將是影響非常大的。
另外一方面，滬通鐵路二期增加楊行站，與上海市寶山區總體規劃的定義也不相符，這個事情再變更規劃，已經太晚了。
下面就是滬通鐵路二期選定的走向。
滬通鐵路的建設計劃是：
一期：從太倉南站接入安亭站，然後接入上海虹橋站二期：另外的一個分支，在上海接入徐行站、從長江底通向浦東新區，接入上海東站滬通鐵路二期的最為關鍵的環節就是從長江底通向浦東新區，如果在楊行設置站點，對於滬通鐵路二期的設計將是顛覆性的。
下面就是代表對於滬通鐵路二期在寶山楊行設站的提議。
從代表的提議中可以看出，滬通鐵路二期在寶山區楊行設置站點，完全是為了拉動地區的發展，而不是處於滬通鐵路二期整體合理性判斷。
滬通鐵路二期主要的建設目標是上海東站，其實在楊行設站或者不設站，影響都是不大的，但是如果在2019年依然要更改滬通鐵路二期的計劃，那麼對於上海東站的建設進度，就是影響非常大的。
滬通鐵路一期佔了線路主要部分，還要設置長江大橋，二期其實只是上海市境內的一小段，最主要的收益就是支持上海東站的建設。
另外的一個問題，滬通鐵路在楊行設站的問題，也與上海市寶山區2035年總體規劃不相符：
按照上海市寶山區2035年總體規劃，楊行站是一個市域鐵路的小站如果滬通鐵路二期改線楊行， 這將是一個大站
從上海市寶山區2035年總體規劃地圖可以看出，此處的楊行站是一個小站，可能就是類似市域鐵路形式的軌道交通站點，而滬通鐵路依然是從江底通向浦東新區的。
綜上所述，對於迫切需要開工的滬通鐵路二期來說，在寶山區楊行設站實在是一個比較突然的變數，這個變數與之前的鐵路規劃、上海市寶山區整體規劃都不相符，可以說實施難度非常大。