日本神話中有關混沌天地形成過程有多種說法。《古事記》之記載，天地形成之初，在高天原最先形成了天之御中主神（《日本書記》中記為天御中主尊，後面神名後括號裡的表示意義同上），隨後相繼形成了高御產巢日神（高皇產靈神）和神產巢日神（神皇產靈尊）。最先出現的天之御中主神代表宇宙的根本、支配高天原中心的主宰；而後出現的高御產巢日神和神產巢日神相對為陰陽兩儀，此三神即為「造化之神」，形成之後便隱身於高天原。
此時大地尚未凝成，只是些漂在水面上的蜉蝣一樣的東西，如水母般漂浮不定。其中有物如春天的葦芽冒出，生命力極強，生長迅速，化作宇摩志阿斯訶備比古神（可美葦牙彥舅尊）和天之常立神（天常立尊）。此二神和前面的造化三神共五神，稱為別天津神，它們都是誕生時都是獨自一人，形象抽象也無性別之分，稱為獨神。
別天神命令兩位使者下界創造了日本列島。這兩位使者便是伊邪那岐和伊邪那美，他們是日本神話中的父神和母神，伊邪那岐的妻子是其妹伊邪那美。他們既是日本諸神的父母，也是日本神話的起源，並由此衍生出日本神話中諸神的出現，引生完國土後，伊邪那岐與伊邪那美又生諸神。最初生的神，名叫大事忍男神 ，其次生石土毗古神 ，其次生石巢比賣神 ，其次生大戶日別神 ，其次生天之吹男神 ，其次生大屋毗古神 ，其次生風木津別之忍男神 ，其次生海神，名叫大名津見神 ，其次生水戶神，名叫速秋津日子神 ，其次生妹速秋津比賣神 。自大事忍男神到秋津比賣神，共十神。
伊邪那美在生下加具土命之後便死亡。伊邪那岐思念難產而死的愛妻伊奘冉尊（《古事記》裡稱為伊邪那美），親赴黃泉國。但看見她腐爛而醜陋的身體後，因感到噁心與畏懼，遂逃離黃泉國。憤怒的伊邪那美派出數將追擊，但被他用計甩開，最後在黃泉比良阪用大石堵住陰陽兩界之路，才停止這場災難。這時疲憊的伊邪那岐停在日向國的橘小戶阿波岐原休息，他脫去身上的衣物跳入河流中遊洗滌，於是他脫掉的衣物與洗滌的部位頓時生出二十多位神祇。最後洗臉時誕生了日本神話中的「三貴子」，左眼生出掌管太陽的天照大神，右眼生出掌管月亮的月夜見尊（《古事記》裡稱為月讀），鼻孔生出素盞嗚尊（《古事記》裡稱為須佐之男）。伊邪那岐便令天照大神治理高天原，月讀治理夜之食原，素盞嗚尊治理海原。
天照大神（《日本書紀》）或稱天照大御神（《古事記》）、天照皇大神、皇大御神、天照坐皇大御神、大日孁貴、大日女尊、大日靈，天照是日本神話裡三貴子之一、高天原的統治者與太陽的神格化。她被奉為日本天皇的始祖（皇祖神），也是神道教最高神。
月讀（ツクヨミ、ツキヨミ），別稱月夜見（ツクヨミノミコト）、月餘美、月弓尊（ツクユミノミコト）、月讀壯士（ツキヨミオトコ）、月神以及月人。他是日本神話和神道的一位神祇，是月的神格化，「三貴子（月讀、天照大神、素戔嗚尊）」之一，伊邪那岐之子，掌管黑夜的神明。
素盞嗚尊（スサノオ），《古事記》裡記作建速須佐之男命，又記降馬頭主、素戔男尊、素盞鳴尊、素盞雄尊、須佐乃袁尊、神須佐能袁命、須佐能乎命、牛頭天王等。日本神話著名神祇，伊奘諾尊（伊邪那歧）所生的三貴子之一，素盞嗚尊被父親分配至滄海之原封為海神，但他沒有依言，後來動身前往高天原。其性格變化無常，時為兇暴，但時為英勇，因狂暴的性格而被視為破壞神。最著名事跡為斬殺八岐大蛇，他從其尾部取得「天叢雲劍（草薙劍）」，成為了勇武的英雄。