1967年1月1日，《人民日報》、《紅旗》雜誌發表經毛澤東審定的，題為《把無產階級文化大革命進行到底》的社論，宣布「1967年將是全國全面展開階級鬥爭的一年」，號召「向黨內一小撮走資本主義道路的當權派和社會上的牛鬼蛇神，展開總攻擊」。至1976年的這十年間,政協基本停止了活動。
人民政協在十年動亂中的活動
「文化大革命」中林彪、江青反革命集團的倒行逆施，使得我們的國家和人民遭到空前的劫難，統一戰線遭到嚴重破壞，人民政協陷於癱瘓，一部分政協委員和民主人士受到迫害。他們攻擊「人民政協是牛鬼蛇神的窩子」，胡說「政治豈容協商」，因而政協全國委員會被迫於1966年8月末停止辦公。但作為黨和國家主要領導人、全國政協主席的周恩來在異常困難的情況下，仍然指導全國政協做了一些工作。
周恩來一貫堅持統一戰線的優良傳統，堅持對各界人士執行統一戰線政策。在處境極其艱難的情況下，不僅保護了一大批被林彪、江青反革命集團殘酷迫害的共產黨內的領導幹部，而且為保護民主黨派負責人、無黨派民主人士和各界愛國人士作了極大的努力。「文化大革命」開始後，他就擬定了一份應予保護的名單，範圍包括：全國人大常委會副委員長和常委，國家副主席，全國政協副主席，國務院副總理、部長、副部長，最高人民法院院長和最高人民檢察院檢察長，各民主黨派負責人。具體名單中有宋慶齡、郭沫若、章士釗、程潛、何香凝、傅作義、張治中、邵力子，蔣光鼐、蔡廷鍇、沙千裡、張奚若、李宗仁等愛國民主人士。9月1日，他命令解放軍總醫院準備接收章士釗、程潛、傅作義、蔡廷鍇、李宗仁等人院，以住院醫療的名義保護他們的安全。周恩來為了保護民主黨派的領導人，1969年5月4日向駐政協全國委員會機關軍代表下達了「不要批鬥民主黨派領導人」的指示，明確指出各民主黨派機關的群眾「不要去批鬥民主黨派的領導人，即他們的中央委員、各省市黨部委員」。1970年春，周恩來親自部署對民主人士落實政策的工作。根據周恩來的指示，政協全國委員會機關與全國人大常委會機關聯合成立了一個專門小組，對在北京的部分民主人士被紅衛兵查封和抄走的財物的情況進行了調查，並在此基礎上起草了《對在京部分統戰對象被查抄財物的處理意見》呈報中共中央，經毛澤東審閱同意後，以中共中央文件轉發全國。儘管當時清退查抄財物的工作還不夠徹底，但其政治影響是很大的。1971年9月，周恩來又指示，下放到人大、政協機關「五七」幹校勞動的民主黨派中央委員，應讓他們返回北京，以免除他們去幹校的勞動懲罰和迫害。
1971年林彪叛逃摔死後，政協全國委員會在周恩來親自領導下，開始恢復一些活動。原來由政協全國委員會學習委員會領導的各民主黨派中央、全國工商聯和政協無黨派民主人士學習組，恢復了經常性的時事政策學習。1971年12月，政協全國委員會組織著名愛國人士宋慶齡、傅作義等數十人參加了中共中央召集的關於林彪反革命事件座談會。會上，周恩來、葉劍英傳達林彪反革命集團陰謀奪取最高權力、策劃反革命武裝政變的經過，座談會進行了分組討論。1973年後，政協全國委員會曾多次組織民主人士在北京和去一些省、市參觀工農業生產和文化教育情況等。 1973年10月，葉劍英代表中共中央召開座談會，部分政協常委應邀參加，就第四屆全國人民代表大會代表候選人中的愛國人士名單進行了協商。此外，政協全國委員會還組織部分委員和各界代表人士參加了一些紀念活動和節日慶祝活動。粉碎江青反革命集團後，政協全國委員會才恢復工作。
1976年10月，中共中央政治局一舉粉碎了江青反革命集團，結束了持續了10年之久的「文化大革命」。從此，人民政協開始恢復工作。
1976年11月，政協全國委員會常務委員列席第四屆全國人大常務委員會第三次會議，聽取並討論了關於粉碎「四人幫」反革命集團的報告。