在約克坦瑪雅印第安人1300多年前，他們把烘烤過的可可豆磨成粉末，再把粉末和水混合起來，然後把所有粉末混合到一起，做成了巧克力飲料。
只有貴族貴族才能喝巧克力飲料，這一習慣一直持續到16世紀，1526年，西班牙軍事家荷南多·科爾特斯在墨西哥看到當地國王正在喝巧克力飲料，他聞到巧克力飲料散發出的醇香，但嘗了一口覺得很苦，於是他將巧克力帶回家中，自己做了一杯，但是在原汁原味的釀造過程中，他加了糖，喝起來有點甜。
1868年，瑞士人彼得在荷南多的基礎上再加了一次牛奶，現代版的巧克力開始萌芽。在1642年，法國人把巧克力帶到了國內，但又把巧克力作為藥物引進了國內，而且巧克力也曾一度被法國人視為一種「珍貴的藥物」，作為治療心絞痛和肝病的第一種藥物。
直到19世紀中葉，人們才將巧克力視為食物。當巧克力被帶到中國時，是康熙年間，當時的康熙還把它當作藥來吃，他首先把它引入中國，他是第一個嘗試吃它的中國人。在康熙時代，中國經濟發達，物產豐富，他十分排斥異族，但在1693年的夏天，39歲的康熙突然患上了瘧疾，雖然在那個寒冷的夏天，他還是被凍得「打顫」，全身痙攣，宮中的太醫也無法醫治。
為保命，康熙向民間募集了大量藥方，最終由法國傳教士帶來的西藥「金雞納霜」治好了病，康熙因此事而不再盲目排斥西藥，也對西藥產生了興趣。在1707年，他從外國傳教士那裡得到了巧克力，便下令把巧克力交給負責西藥的西方人赫世亨去找。清代的巧克力並不叫「巧克力」，而是叫「綽科拉」，由英文翻譯而來。那時，赫世亨的好朋友、義大利傳教士鐸羅來到中國，赫世亨便向鐸羅要巧克力，鐸羅拿出了150塊，赫世亨從裡面挑出50塊給康熙，並為康熙準備了一套吃巧克力的茶杯。
康熙也是第一次吃巧克力，又沒人告訴他巧克力的藥效，萬一吃死他怎麼辦？為保險起見，康熙讓赫世亨寫下巧克力性狀，三天後交。赫世亨以前沒有吃過巧克力，只好拿著巧克力四處打聽用途，三天後大大咧咧地寫了900多字的說明書，把說明交給了康熙。
Hugheng在說明裡說的巧克力其實更像一種茶，「老者，胃虛者，瀉肚者皆可飲，助胃消食，大有益處。」Hughon的這段話是有科學依據的，科學家通過研究發現黑巧克力中的纖維素有助於腸道蠕動，對消化也有一點止瀉的作用。
康熙見赫世亨這900多字的說明只回了三個字，這三個字就是「知」康熙撿起巧克力喝了一口，喝第一口差點沒把所有巧克力都吐出來，因為巧克力實在太苦了，康熙第一次喝沒有經驗，喝了一大口就哭得他趕緊用水漱口。茶葉雖也有些苦澀，但苦澀的茶裡仍有些許清香，事後會覺得有點甜，可巧克力實在是苦得難以下咽。康熙從此就不再吃巧克力，直到清末，西式食品大量進入中國，國人才漸漸喜歡上巧克力。