歷史上蒙古人的剽悍勇猛是舉世聞名，無可匹敵的。13世紀成吉思汗的鐵騎橫掃歐亞大陸，所向披靡，憑藉著強悍無比的戰鬥力徵服了廣袤無垠的土地。所到之處無不望風披靡，被當時的歐洲人視之為「黃禍」。
即使後來被朱元璋趕回漠北草原老家，蒙古人依然保留著相當強悍的戰鬥力，飄忽不定地襲擊和騷擾，不時地給中原政權帶來難以解決的麻煩。終明一朝直至後來清朝入主中原後的前期，中原政權與蒙古各部的交鋒始終是互有勝負，最多只能擊敗而無法消滅那些戰鬥力強悍、作戰方式飄忽不定的蒙古騎兵，更無法對於蒙古各部佔有的領地實施有效的管轄。
可到了乾隆年間，為何一貫強悍的蒙古人忽然不行了呢？
因為喇嘛教搞垮了蒙古人！
首先，蒙古人本來是遊牧民族，居無定所，一會在東，一會兒在西，要想消滅他們很難，這是他們與眾不同之處。
其次，他們當時信仰的是薩滿教，搞的是萬物崇拜，也不需要修什麼廟宇，走到哪兒，想拜天拜地了，殺幾頭羊，宰幾頭牛，再點一堆火，就可以開始跳大神了。
所以，沒有什麼東西是蒙古人需要牽掛的，這就是他們力量的源泉！
可是當他們信了喇嘛教以後，他們開始修廟了，修廟可是非常花錢的，一下把他們的積蓄花光了，而且一旦修好了以後，他們東看看，西看看，總覺得可以把它再裝飾得更漂亮一點。
於是，信徒們開始不斷的捐錢，越修越氣派，越修越豪華，大家就越捨不得離開了。
這就造成了三大惡果。
第一，讓他們變窮了。因為對於蒙古人來說，遊牧生活只是保證他們有口飯吃，要想發財，卻要靠四處劫掠。
現在大家一旦出門打仗，老擔心自己修的那個廟，窗戶關好了沒有，門有沒有鎖，會不會有小偷，總是放心不下，所以越來越不願意出遠門，外出劫掠的機會少了，自然錢也掙不到了。
第二，人口增長速度降低。由於有了廟，所有的蒙古人，生活中的很多事，都要經常找喇嘛商量，請求神明的指示，所以普通牧民遊牧的範圍，也變得越來越小了，這樣就導致他們的草場退化嚴重，所以生計也日益困難，人口的增長的速度，自然也就放緩了。
與此同時，由於信教，大量的年輕男子都去當了喇嘛，一天到晚吃齋念佛，不僅僅導致他們的兵員減少，而且消磨了他們的意志，讓他們從一群兇猛威武的蒙古戰士，變成了一堆喋喋不休的唐僧，不僅佛系，還全部娘化了。
同時，大量的年輕男子去當喇嘛，也導致晚婚晚育，草原上本來出生率就比中原低，這樣一來，他們的人口弱勢就更加明顯。
第三，也是最重要的一點，由於喇嘛廟的大量興建，導致了在寺廟這周圍，誕生了大量的集市，於是各地的商人紛紛前來，在帶來了商品的同時，也帶來了疾病。
而乾隆恰好等到了這個時候，當他出兵進攻準噶爾，收復新疆的時候，蒙古準噶爾部，爆發了大規模的天花，根據魏源和其他清代資料的記載，有40%的蒙古人生痘而死，就是死於天花。
這原本是絕不可能發生的，本來蒙古人是不怕傳染病的，這是他們的生活方式決定了的，比如讓歐洲死了1/3人口的黑死病，就源自於蒙古。
但是蒙古人卻毫髮無損，對這個黑死病並不是很擔心，因為如果按以前的生活方式，大範圍的遊牧的話，只要不出兵徵戰，家族之間，一年到頭，都很難見一次面，所以即使有傳染病暴發，最多也就滅了一個家族，很難傳染到整個部落。
可是一旦有了寺廟，事情就不一樣了。大家隔三差五的，就來寺廟拜拜，有病了更是拜得勤，然後又在周圍的集市轉悠一圈，人挨人，人擠人，這樣一來，一旦爆發了傳染病，一個都跑不掉了。
而蒙古人的衛生水平本來就低，更缺乏相應的危機管理能力，所以一旦爆發疾病，立刻就會造成大規模的死亡。
所以當乾隆進攻準噶爾，收復新疆的時候，他所面臨的對手，根本就不堪一擊了，和清朝前期他爺爺和爸爸面對的，那些剽悍好戰的蒙古人，完全是兩種人，因為那個時候喇嘛教的廟宇還很少，所以大部分蒙古人，都還充滿了尚武好鬥的精神。
這場戰爭造成的一個可怕後果是，準噶爾部幾十萬戶中，有40%的人在天花中死亡，有20%的人逃往俄羅斯，剩下30%的人，被乾隆授意清軍屠殺殆盡，剩下10%的人被遷往內外蒙古，準噶爾就此被滅族。
1449年，明朝的正統14年，準噶爾人的祖先，也先率領5萬蒙古瓦剌騎兵，擊敗了明軍20餘萬人，俘虜了明朝皇帝朱祁鎮，那一刻，他們是何等的輝煌。
可是誰也沒有想到，風水輪流轉，300年以後，世間再也沒有瓦剌人了，蒙古的準噶爾部，就此消失在歷史的長河中。
乾隆的這個舉動，雖然無比的殘酷，但是困擾中原王朝幾千年的遊牧民族問題，就此徹底結束，新疆也從歷史上第一次被納入了中原王朝的直接管理。