天正十三年（1585年），豐臣秀吉建立了室町幕府滅亡後的第一個全國性武士政權。但讓人感到奇怪的是，豐臣秀吉不是像之前的武士領袖那樣通過出任徵夷大將軍建立幕府，而是出任朝廷的首座關白。
對豐臣秀吉不當徵夷大將軍的反常事情，流傳最廣的解釋是足利義昭拒絕收豐臣秀吉為養子，導致豐臣秀吉沒有獲得當徵夷大將軍必備的源氏出身。那麼足利義昭真的可以阻止豐臣秀吉當上徵夷大將軍嗎？
首先，所謂「足利義昭拒收豐臣秀吉為養子」的記載出自江戶幕府御用文人林羅山父子編撰的《豐臣秀吉譜》，其他史料沒有相關記載，屬於孤證不立。該記載很可能是江戶幕府建立後抹黑豐臣家的假史料。
其次，足利義昭之所以能拒絕授予豐臣秀吉源氏，靠的是「源氏長者」頭銜。但「源氏長者」是天皇賜予的，也可以被天皇剝奪。豐臣秀吉完全能讓傀儡天皇把「源氏長者」封給別人，足利義昭根本不能阻止。
第三，在豐臣秀吉之前，日本共出現了三十二任徵夷大將軍，而其中有十一任徵夷大將軍都不是源氏。可見所謂「當徵夷大將軍必須是源氏」的說法本就立不足腳，就連最看重血統禮法的天皇都不如此認為。
比如早在織田信長的安土時代，日本天皇和朝廷就明確同意自稱平氏出身的織田信長可以當徵夷大將軍。正親町天皇也曾經當面提出任命豐臣秀吉為徵夷大將軍，可見源氏不是當徵夷大將軍的必須條件。
最後，由於缺乏史官體系，很多大名武士的家譜都是混亂不清的。因此很多戰國武士都會偽造出身，比如冒認平氏的後北條。德川家康的源氏極有可能也是偽造的，因為史料中有德川家出自藤原氏的記載。
豐臣秀吉的時候更是編出了自己是天皇私生子的虛假出身，更不要說區區的源氏出身了。就算當徵夷大將軍的必須條件是源氏出身，豐臣秀吉也完全可以偽造一個源氏出身，根本不要經過足利義昭的允許。
綜合來講，以豐臣秀吉的實力和當時日本的觀念，足利義昭根本無力阻止豐臣秀吉當徵夷大將軍。豐臣秀吉不當徵夷大將軍是有更深層次的政治考慮，而不是簡單的血統出身問題。