打開植物光合作用大門 葉綠素合成關鍵酶三維結構被解析

2020-12-11 新京報

新京報訊(記者 周懷宗)10月30日,記者從中國農科院獲悉,葉綠素合成關鍵酶的三維結構首次被解析,這一成果由中國農科院、上海交通大學、英國曼徹斯特大學的相關研究機構共同完成,並於近日發表於《自然》雜誌。

萬物生長靠太陽

在生物進化的過程中,能量及物質的合成,經過了「黑暗-光明」的轉變。在生命誕生之初,大部分微生物都可以在黑暗中存活,引導它們合成物質和能量的,是一種名為DPOR(非光依賴型原葉綠素酸酯氧化還原酶)的蛋白酶。隨著生物的進化,葉綠體逐漸形成,進化出來的高等生物產生了光合作用,這是一個可以將光能轉化為化學能的過程,而光合作用中重要的光激發酶LPOR(光依賴型原葉綠素酸酯氧化還原酶)起到了光合反應途徑閥門的作用,誘導物質和能量的合成。

LPOR在光合作用中的重要作用。受訪者供圖

大約在百年前,科學家們就發現了這一物質,「它是葉綠素合成前一步反應的催化酶」,該論文的共同第一作者、中國農業科學院生物技術研究所助理研究員孫文麗告訴新京報記者,「在黑暗中,葉綠素的合成被原葉綠素酸酯所阻斷,當遇到光線時,受到光的激發,原葉綠素酸酯氧化還原酶將原葉綠素酸酯轉化為葉綠素酸酯,葉綠素酸酯再轉化形成葉綠素,從而啟動光合作用。」

找到光合作用的開關

然而,即便知道了基本的原理,但囿於技術原因,科學家們卻一直沒有能夠揭開LPOR蛋白結構的神秘面紗,只是通過電腦建模來模擬它的結構及運作的過程,孫文麗說,「LPOR蛋白是光激發的,穩定性不好,想要獲得其晶體並不容易。這一次我們不僅獲得了LPOR酶單體晶體,同時還獲得了LPOR-NADPH(光依賴型原葉綠素酸酯氧化還原酶-煙醯胺腺嘌呤二核苷酸磷酸)蛋白複合體的晶體結構,並在此基礎上,通過電腦建模,構建了更加精準的LPOR-NADPH-原葉綠素酸酯三元複合物結構。」

LPOR-NADPH晶體結構。受訪者供圖

據介紹,這一發現填補了國際上近一百年來光合作用相關領域的空白(葉綠素生物合成光碟機動型酶LPOR及其輔因子NADPH複合體的三維晶體結構),揭秘了太陽提供給地球上一切生命的終極能量來源的生物學轉化「閥門」的真實結構及其開關功能,具有「裡程碑」式的意義。

更精確的晶體結構能做什麼

孫文麗介紹,新的發現,可能會在多個生物學領域的研究中,起到更重要的作用。

「簡單來說,得到光依賴型原葉綠素酸酯氧化還原酶的晶體結構,以及其相應的複合結構,為更多領域的研究,提供了更多更準確的模型。」孫文麗說。

這一模型在光碟機動型催化劑及蛋白小分子抑制劑的設計研究中都有可能用到,「當我們需要開發新的光碟機動型酶,如光碟機動型聚合酶時,就可能使用到這種模型」。孫文麗說。

孫文麗介紹,「植物從發芽到幼苗,要經歷一個從黃變綠的過程,這個過程,就是從光依賴型原葉綠素酸酯氧化還原酶的工作開始的,我們了解了它的結構,以及它運作的過程,就能開發出更多的、有針對性的蛋白酶,幫助農作物更好地生長」。

新京報記者 周懷宗

編輯 張樹婧 校對 李世輝

相關焦點

  • 科學家首次解析葉綠素合成關鍵酶3D結構
    中國青年報客戶端北京10月30日電(中國青年報中國青年網記者 邱晨輝)記者今天從中國農業科學院獲悉,該院生物技術研究所微生物功能基因組創新團隊聯合國內外相關單位,首次解析了葉綠素生物合成關鍵酶——光依賴型原葉綠素酸酯氧化還原酶(英文簡稱LPOR)的三維晶體結構,揭開了光合作用終極能量來源
  • 葉綠素合成關鍵酶晶體結構首次揭示
    科技日報記者 馬愛平10月30日,記者獲悉,中國農業科學院生物技術研究所博士程奇帶領的課題組首次揭示了葉綠素生物合成關鍵酶——光依賴型原葉綠素酸酯氧化還原酶三維晶體結構,對認識蛋白質結構如何控制重要光碟機動酶的催化作用產生重大突破。
  • 光合作用能量轉化終極「閥門」長這樣
    LPOR-NADPH晶體結構 程奇供圖「萬物生長靠太陽」,地球上的生命所用能量均是通過光合作用直接或間接轉化而來。10月24日,《自然》在線發表葉綠素生物合成關鍵酶三維結構解析論文,首次解析了葉綠素生物合成關鍵酶——光依賴型原葉綠素酸酯氧化還原酶(LPOR)的三維晶體結構,揭開了光合作用終極能量來源的生物學轉化「閥門」真實結構。該成果由中國農業科學院生物技術研究所(以下簡稱生物所)微生物功能基因組創新團隊程奇課題組聯合國內外相關單位共同完成。
  • 植物葉子的結構與光合作用
    當然,太陽能不會直接變為肌肉收縮的機械能和發光生物發出的光能,在中間起聯繫作用的,便是綠色植物和某些細菌。下面簡單介紹一下,植物葉子的結構與光合作用。在陽光的照耀下,植物利用水和二氧化碳合成我們所需要的有機物質,這個過程就是大家熟知的光合作用。光合作用是地球上規模最大的太陽光能利用過程。
  • 研究揭示葉綠素生物合成酶促光催化的結構基礎
    研究揭示葉綠素生物合成酶促光催化的結構基礎 作者:小柯機器人 發布時間:2019/10/25 10:53:54 葉綠素生物合成中酶促光催化的結構基礎,這一成果由英國曼徹斯特大學Nigel S.
  • 中國科學家率先破解光合作用超分子結構之謎
    新華社北京5月21日消息,光合作用是地球上生命體賴以生存的基礎,對它的科學研究已持續了兩百多年,但仍有很多未解之謎。記者21日從中科院獲悉,該院生物物理所的研究團隊在光合作用研究中獲得重要突破,在國際上率先解析了高等植物(菠菜)光合作用超級複合物的高解析度三維結構。該項研究工作發表在最新出版(5月19日)的國際頂級期刊《自然》上。
  • ...前沿】上科大饒子和等團隊解析植物和真菌的乙醯羥基酸合成酶結構
    【科技前沿】上科大饒子和等團隊解析植物和真菌的乙醯羥基酸合成酶結構 2020-07-13 17:00 來源:澎湃新聞·澎湃號·政務
  • 【植物知識】光合作用
    光合作用|概念 光合作用(Photosynthesis),即光能合成作用,是植物、藻類和某些細菌,在可見光的照射下 對於綠色植物來說,在陽光充足的白天,它們利用太陽光能來進行光合作用,以獲得生長發育必需的養分。 這個過程的關鍵參與者是內部的葉綠體。葉綠體在陽光的作用下,把經由氣孔進入葉子內部的二氧化碳和由根部吸收的水轉變成為澱粉等能源物質,同時釋放氧氣。
  • 植物葉綠素測定儀及時發現病蟲害
    植物葉綠素測定儀是現代植物生理研究過程中的重要儀器,綠色植物生長過程中,葉片中葉綠素的含量是隨時發生變化的,除了葉綠素還有葉黃素、花青素和胡蘿蔔素。葉的顏色是由於這些色素的含量和比例的不同而造成的。 春夏時節,葉綠素的含量較大,而葉黃素、胡蘿蔔素的含量遠遠低於葉綠素,因而它們的顏色不能顯現,所以葉片顯現綠色。
  • 科學網—人工綠色:合成葉綠素
    人們都知道,植物的呼吸是通過葉綠體中的葉綠素。葉綠素實際上存在於所有能營造光合作用的生物體中,包括綠色植物、原核的藍綠藻和真核的藻類。 作為光合作用中最重要的色素,葉綠素將光能吸收,並使自身離子化,最終將二氧化碳和水轉化為氧氣和碳水化合物,為植物和藻類提供養分。 從19世紀到20世紀初的100多年裡,經過德國、俄國的幾位化學家的努力,發現了葉綠體的光合作用機制,並且弄清了葉綠素的複雜化學結構。
  • 植物所等解析綠硫細菌光合作用反應中心複合物冷凍電鏡結構
    綠硫細菌內周捕光天線FMO向反應中心的能量傳遞效率在35%-75%之間,顯著低於高等植物外周天線LHCI向PSI核心的能量傳遞效率(接近100%)。目前,學界尚未解析綠硫細菌的光合作用反應中心能量捕獲、傳遞和轉化的結構基礎。
  • 高三生物下冊光合作用知識點
    光合作用通常是指綠色植物(包括藻類)吸收光能,把二氧化碳(CO2)和水(H2O)合成富能有機物,同時釋放氧的過程。
  • 光合作用和化能合成作用
    2.填表比較光反應和暗反應 項目 光反應 暗反應 條件 需要光、色素和酶等
  • 生物物理所解析出植物光保護蛋白PsbS的晶體結構
    植物與太陽光的關係是「愛恨交加」,一方面光能對於植物進行光合作用是必需的,但另一方面過量的光能又會導致植物光合作用裝置的氧化性損傷,於是植物逐漸進化出了一種保護機制。早在2000年,已有報導表明PsbS在qE功能中發揮關鍵作用,但是對於PsbS是否結合色素一直存有爭議,其參與光保護作用的機制也並不清楚,因而解析其三維結構成為本領域期待已久的研究課題。
  • 葉綠素的合成一定需要光照嗎?
    在這一反應過程中穀氨酸共價地結合到tRNA上形成中間產物(這也是tRNA被用於蛋白質合成以外的極少數小分子生物合成過程中的一例)。之後,兩分子的ALA聚合成膽色素原(porphobilinogen,PBG)。PBG將最終形成葉綠素的吡咯環。下一階段是4個分子的PBG聚合形成卟啉結構。這一階段包括六步酶促反應,最終形成原卟啉Ⅸ(protoporphyrin IX)。
  • 科學家解析新冠病毒RNA聚合酶三維精細結構—新聞—科學網
    此前一天,上海科技大學免疫化學研究所饒子和/楊海濤團隊與合作者組成的「抗新冠病毒攻關聯盟」在Nature上聯合發表了新冠病毒的重要研究成果「Structure of Mpro from COVID-19 virus and discovery of its inhibitors」,率先在國際上成功解析新型冠狀病毒關鍵藥物靶點——主蛋白酶(Mpro)的高解析度三維空間結構。
  • 植物所等解析硅藻PSI-FCPI超級複合物2.38埃解析度的三維結構
    中國科學院植物研究所光合膜蛋白結構生物學團隊致力於光合膜蛋白三維結構和功能的研究,2019年,破解羽紋綱硅藻-三角褐指藻的FCP(Fucoxanthin Chlorophyll a/c protein)捕光天線二聚體的1.8埃解析度晶體結構(Science,2019),描述FCP中葉綠素a,葉綠素c和巖藻黃素的精確結構信息。
  • 第四節 能量之源——光與光合作用
    (2)結構:①外表:雙層膜 ②內部:a.基質含有反應所需要的酶,少量DNA、RNA和無機鹽等。b.基粒由類囊體堆疊而成,增大了膜面積,其上分布著與捕獲光能有關的色素和光反應所需的酶。(3)功能:進行光和作用的場所。
  • 專題2.2 細胞呼吸和光合作用過關訓練案 答案
    【關鍵能力答案】1\解析:選C 色素存在於葉綠體類囊體的薄膜上,而非內膜,A錯誤;在類囊體的薄膜上只能進行光合作用的光反應
  • Science:解析出嗜熱棲熱菌V/A-ATP酶的三維結構
    在一項新的研究中,奧地利科學技術研究所的結構生物學者Leonid Sazanov和博士後研究員Long Zhou如今解析出V/A-ATP酶家族代表性成員的首個原子結構,填補了這些必不可少的分子機器的進化樹上的空白。利用最新的低溫電鏡(cryo-EM)方法獲得的這些結果揭示了這種酶的結構類似於渦輪機或水磨機。