學科思想是一個學科的核心和靈魂，它與知識，能力一起構成了學科體系的三個方面。不同學科它所包含的學科思想也必然不同。化學作為一門自然學科，它既抽象又具體，其學科思想的內容豐富多彩。中學化學學科思想主要包括以下內容。
對立統一思想是哲學的重要內容，它在中學化學學科中無處不在。這一思想所體現的相互對立的同一問題的兩個方面的相互依從關係。運用這一思想對化學知識的理解掌握及應用很有幫助。高中化學中的氧化還原反應是這一思想的具體體現，氧化和還原是一個氧化還原反應的兩個方面，既相互依從又相互對立。換句話說，就是在一個氧化還原反應中既有電子的得失，又有化合價的升降，既有氧化劑又有還原劑，既有氧化產物又有還原產物，有氧化反應發生，必有還原反應發生等等。這一思想的建立，對學生學習氧化還原反應頗有幫助。另外在其他方面，如化學鍵的斷裂與形成，元素的金屬性與非金屬性，電化學中的正負極和陰陽極，等等都包括對立統一思想。
哲學中明確告訴人們，物質量的積累必然會達到質的飛躍。中學化學中涉及到的化學反應物的量的多少，如足量，適量，少量必然會引起生成物的改變。石灰水中通入二氧化碳氣體的多少，會引起生成物的改變。另外，如碳和氧氣，硫化氫和氧氣，鐵與硝酸，三氯化鋁與氫氧化鈉，偏鋁酸鈉和鹽酸，濃硫酸和酒精製備乙烯氣體時170℃和140℃會生成不同物質。P2O5與冷水和熱水反應的產物不同等等。這一思想的培養可以提高學生的智力水平，對學生能力的培養很有幫助。
矛盾的特殊性與普遍性思想在化學學科中體現得更為具體和直觀。普遍性是事物發展的一般規律，而特殊性使學科內容多姿多彩。化學中各主族元素原子結構，性質的相似性是一般規律，而其中所包含的許多特殊性更是不容忽視。滷族元素中氟元素無正化合價，氟單質與水反應產生氧氣，與二氧化矽反應等等。碳族元素中大多數元素的正四價化合物是穩定的，但鉛元素的正二價化合物是穩定的，正四價化合物很活潑。這一學科思想的滲透，對青年學生科學的人生觀和世界觀的形成很有益處。
化學是一門實驗科學，它的許多規律的發現，知識的形成都源於具體的化學實驗而非理論推理來推測產生的。化學反應速率的影響因素：溫度，濃度，壓強，催化劑以及其他條件的改變對反應速率的影響是通過化學實驗得出結論。又知Fe3+與SCN-產生紅色溶液，為什麼會有此現象？只能說是實驗結果，只能告訴學生這是客觀事實，通過科學實驗發現的，這必然會激發學生探究未知世界的興趣，增強學生的動手能力，培養學生學習的積極性，主動性和創造性。
（1）由現象到本質的思想。
在氧化還原反應的認識和學習中，先從得氧失氧，化合價的升高和降低來初步認識，最終上升到氧化還原反應的本質——電子轉移。這樣循序漸進的認識過程使氧化還原反應這一概念的理解更清晰，同時也擴大了氧化還原反應的範圍。
（2）從一般到特殊的思想。
一般性是物質的共性，特殊性是物質的個性。在化學中無色物質佔大多數，而有色物質則是少數物質的個性，如：F2，Cl2，Br2，I2，NO2，AgCl，AgBr，AgI，Na2O2，Fe2+，Fe3+，Cu2＋，MnO4-等有特殊顏色；又知非金屬氧化物大多數在固態時為分子晶體，但SiO2為原子晶體。這一分類思想的滲透會使學生對物質的認識產生濃厚興趣，從而培養學生的科學精神。
（3）由簡單到複雜的分類思想。
高中化學對電解質的教學採用了這一思想。先根據化合物在溶於水或熔化狀態下是否導電將化合物分為電解質和非電解質，對電解質的進一步研究發現，在同一條件下，電解質的導電能力不一定相同，這樣又將電解質分為強電解質和弱電解質。這樣從簡單處入手，層層深入，根據電解質的電離程度從本質上做了劃分。
化學問題的解決在絕大多數條件下有具體固定的模式，在認真審題的基礎上，應重視解決問題方法的選擇，這樣可以做到事半功倍的效果。在有機化學中物質同分異構體的書寫和判斷就有具體的防止重複、遺漏的科學方法。如判斷分子式為C4H10O的屬於醇類的同分異構體的種類，在本質上就是考查丁基（——C4H9）所產生異構的種類（4種）。因此，在實際教學中應根據問題的特點，尋找解決此類問題的最理想的，程式化的思路,給學生一個科學的方法。
化學是研究微觀世界物質的運動規律，許多物質是不能直接觀察的，只有通過想像和類比使抽象理論形象化，才可理解所接觸的理論知識。在原子結構理論中，原子，質子，中子，電子等微粒；物質結構理論中元素的化合價，化學鍵，晶體結構等知識就可通過形象具體的實物類比來認識學習。
物質世界是複雜多樣的，它們的發展變化必然遵循一定規律。化學中的平衡守衡思想就是這許多規律中的一部分，對這些規律的理解掌握能使我們更深層次地認識物質世界的發展變化特點。
化學中涉及到的平衡有：
（1）化學平衡
（2）電離平衡
（3）水解平衡
（4）溶解平衡
（5）結晶平衡。
這些平衡變化規律都可用勒沙特列原理來解釋。
化學中的守衡有：
（1）電荷守衡
（2）電子守衡
（3）原子守衡
（4）物料守衡
（5）能量守衡（熱化學方程式中）。
在實際教學中向學生進行守衡思想教育，可以培養學生思維的靈活性，創造性，為學生認識世界改造世界打下良好基礎。
總之，中學化學中的學科思想的滲透和引入，對學生學習化學幫助很大，同時，學生以後進入社會即就是長期不再接觸化學知識，但其所建立的化學學科思想，一定會對他們所從事的工作產生深遠影響，對青年學生形成科學的人生觀，世界觀，方法論會產生重大影響。