1661年鄭成功徵戰臺灣之時，為供應軍隊的需要，閩南漳州石馬等地提供了不少烏厚煙等菸草製品，此為臺灣輸入菸草成品之始。從那開始，福建菸草陸續進入臺灣供應給從福建移居而去的移民和臺灣當地人。
清乾隆年間，菸草製品開始大量輸入臺灣，輸出地自然是對岸的閩南地區，平和縣崎嶺菸絲銷往臺灣較多。而後，以平和縣曾明生為首的18人，在臺南開設煙鋪，經營菸絲；為了增加營利，他們將平和縣產的淨菸葉運往臺南加工出售。嘉慶年間，長泰縣林天定5兄弟，分別經營5個煙行，所產菸絲遠銷臺灣、南洋群島。
當時臺灣也有少量菸絲生產，工藝多向大陸學習，但由於臺灣菸葉品質不良，僅摻用少量在麟煙及土煙（當地人生產的菸絲）中，大部分的成品菸絲仍為福州、汀州、漳州、溫州等地產的菸葉製造，臺灣菸葉與大陸菸葉比例為2：8。
清代，臺灣人民所消費的主要絲煙有條絲煙、厚煙及土煙（又名熟煙）三種。次有大同煙（亦稱生煙或青煙）、水煙、粗絲三種，大部分產自福建。條絲煙產自福建永定，清同治年間傳入臺灣。在臺灣較著名的品牌有：永和能記、永和生記、東興喬記等20餘種。
厚煙產自福建長泰、平和、石碼、同安等地，又分為烏厚煙、麟煙及赤厚煙三類。烏厚煙隨鄭成功入臺，康熙年間起普遍銷售臺灣，乾隆年間達到最高峰。麟煙是由烏厚煙發展的產品，銷往臺灣的有石麟、麒麟、壽麟、建麟等四種。赤厚煙又是麟煙的進一步改良品，道光末年最初出現在平和、同安等地，銷往臺灣的有金勝春、金吉祥、麟人等品牌。
大同煙為福州等地產品，輸出臺灣的以福州殷志中的大同煙鋪產品為代表。水煙以福州輸入為最多。條絲菸品質最佳，厚煙稍次，二者與大同煙及水煙多由中上層人士消費；土煙、粗絲品質較差，大部分由下層階級購用。
中日甲午戰爭，中國以戰敗告終，1895年臺灣割讓給日本。菸絲原為福建輸臺重要商品，在日本佔領臺灣初期，其輸入量仍甚為可觀。1901年後，日政府對入境條絲煙課稅由50%提高到100%。由於售價提高而使福建運往臺灣的條絲煙銷量銳減。永定煙商改運菸葉至臺灣，再加工成條絲煙出售。日本海關再對進口菸葉課以各種重稅，煙商不堪重負，紛紛歇業回家，時間長達40餘年。
永定條絲絕跡於臺灣市場後，臺灣當局仿製永定條絲以供臺灣市場需要。為獲得優質菸葉，甚至在長泰開設洋行，專門收購漳州、永定等地的菸葉。洋行還委託臺灣、廈門商人來永定縣上豐、溪南仙師宮等處採購菸葉運往臺灣，年出口數約5～50萬公斤。