山葉首次豋場的YZF-R3早已在前幾年上市，其搭載的是即將在日本銷售的YZF-R25的引擎再升級版，把排氣量增加到321cc，水冷式並列雙汽缸引擎，最大輸出馬力可達42PS/10750rpm。
採用180度的曲軸，並透過1次性平衡減振器減少振動、降低引擎噪音，YZF-R3的主要特色是配有R系列累積至今的直接傳動凸輪軸、鍛造鋁合金活塞、滲碳連杆以及低摩擦汽缸等最先進科技配備。
車身骨架是採用堅固性極佳的高張力鋼材，軸距是幾乎與R6相同的1380mm，在追求前後重心50/50的平衡操控的同時，將坐墊高度設定在780mm，日常也可輕鬆騎乘。
除了新配備外，同時也維持從R1傳統所配備的加長型後搖臂，前後輪軸距比率也與R1相同採用supersports dimension設計，底盤方面前後懸吊避震系統分別是採用KYB制避震器，煞車是使用298mm和220mm的大尺寸煞車碟盤，再加上標準配備的ABS防鎖死煞車系統等正宗重型摩託車的配備。
車體外觀設計承襲自R1，配有剽悍的雙頭燈，以幾何型線條造就空氣力學性能優越的車體與R25相同，以修長輕巧的車體達到輕快敏捷的操控。
YZF-R3在以100～125cc為主流東南亞和亞洲摩託車市場，是嚮往賽道騎乘的騎士的高階車款，反之在以600cc以上的中大型款為主流的各先進國摩託車市場中，YZF-R25則成了年輕和新手騎士的入門車款，並企圖促使此車型進階到中大型車款。