許多人在雜誌上看到，長距離心血管運動會分解肌肉。有些私人教練說，在長距離訓練過程中，身體會使用在肌肉中的蛋白質。這二種說法是一致的嗎？
在心血管運動過程中，身體會使用糖原為主要能量來源，使用脂肪為次要能量來源。身體很少會分解肌肉作為能量來源。
大家知道，身體組織的分解是一個分解過程。例如，如果以脂肪為能量來源，脂肪細胞將被分解成脂肪酸和甘油。隨後，甘油可以作為能量使用。而蛋白質，存在於肌肉中，必須先分解成肽鏈，然後，胺基酸，最後，分解成作為能量的葡萄糖。
有氧運動的性質是分解，主要目的是分解和燃燒脂肪。在這個過程中，身體還會減少重量。在身體內，肌肉是密度最大的細胞。身體會試圖分解肌肉，數量達不到作為能量來源，只是為了減少負擔---正如電影描述處於絕境中的飛機那樣。這個分解過程的目的不是使用蛋白質為能量來源。
負重訓練的性質是合成，合成是分解的反義詞。合成的過程是生成物質。目的是使肝臟釋放所需的胺基酸，通過血液輸送至肌肉。胺基酸生成肽鏈，肽鏈生成構成肌肉的蛋白質。
在力量訓練之後，長距離跑會抵消這一合成過程。短跑將導致合成，而長距離跑導致分解。
訓練計劃不應該把長距離訓練和練肌肉的負重訓練安排在同一天。練肌肉的計劃應該包括短跑和增強型訓練，這些訓練應該一起進行。
以健康為目的，每周應該進行一或二次有氧訓練，取決於運動量大小。如果訓練計劃要求2或3天練肌肉的訓練，選擇2天。如果訓練計劃要求4天或4天以上練肌肉的訓練，1天足以。
另外，耐力運動員應該使用長距離有氧訓練和功能性力量訓練相結合的方法。這樣，通過提高關節穩定性和肌肉的平衡發展，可以降低損傷風險。
有時，負重訓練和有氧訓練不得不在同一天。如果是這樣，首先進行負重訓練。
通常，長距離有氧訓練不以肌肉為能量來源，但是，可以阻礙肌肉的增長（生成）。如果目的是增長肌肉，有氧運動應該是非常小的量，而且是在負重休息天進行。