烏幹達怨聲載道，阿明卻充耳不聞，繼續我行我素，過著與血為伴的生活。在不知不覺中，軍隊出現了裂痕，而且導致了後來翻天覆地的連鎖反應。事實上，軍隊中的裂痕在阿明剛剛執政時就已經出現了。
烏幹達軍隊中的大多數人都是來自一個名叫盧格巴拉的部族，因為這個部落是西尼羅河地區最大的部族，所以成為阿明招攬軍人和幕僚的最重要的對象。由於這個部落曾經受到過阿拉伯國家的奴役，所以盧格巴拉人十分痛恨伊斯蘭文化。
但是在阿明執政初期，為了能獲得阿拉伯國家的援助，不惜在烏幹達推行伊斯蘭文化。這一舉措，在盧格巴拉人看來，是對他們部族的侮辱，對阿明的不滿情緒也就由此而生。1972年6月，格巴拉族人阿達米上被殺害。該事件讓這個部族對阿明政府更是恨之人骨，甚至有人說要推翻政府。這件事情發生後不久，很多盧格巴拉官兵經常莫名其妙地失蹤，後來才被確定是被阿明政府暗殺了。
軍隊中的裂痕已經不可避免地出現了，而且還有擴大的趨勢。1974年3月4日，盧格巴拉族參謀長阿魯貝發動政變試圖推翻阿明政府，但是卻以失敗告終。參與政變的500多人不是被打斷雙腿後活活燒死，就是被綁住手腳扔到河裡餵鱷魚，那時的尼羅河流淌著的都是帶有碎肉的血水。
從這件事情以後，阿明對自己的軍隊也不像原先那麼信任了。他開始不停地撤換軍政官員，怕他們擁兵自重，起來謀反。內閣改組過19次，總參謀長更是頻繁更替。從執政開始到1977年，阿明殺害了6名內閣部長、3名高級官員，還有15名部長，另有8名常任秘書逃到國外避難。