仍在運作中的老牌威士忌酒廠
在經歷了經融危機以後，一些威士忌酒廠被迫關閉，但仍舊有一些堅持下來的老牌威士忌酒廠。
富士御殿場蒸餾所(Fuji-Gotemba)
富士御殿場蒸餾所位於富士山腳下的靜岡縣御殿場市。
富士御殿場蒸餾所原本是由麒麟集團Kirin在內的三個集團共同創立的，不過在2002年由麒麟集團取得完全掌控權。
由於富士御殿場蒸餾所擁有大型的裝瓶廠，再加上麒麟集團本身就就是很多外國酒品牌的代理商，所以很多外國酒品牌都是在富士御殿場裝瓶的。
富士御殿場蒸餾所生產的單一麥芽威士忌富士山麓18年也算是中規中矩，該蒸餾所生產的原酒主要用於製作調和威士忌。不過2000年後增多了單一麥芽和單一穀物小批次威士忌的產品，倒是給大家帶來不小的surprised。
Mars 信州蒸餾所Mars Shinshu
Mars信州蒸餾所是目前全日本海拔最高的威士忌酒廠，建廠於1985年，屬於本坊造酒Hombo集團。但實際上，本坊造酒早在1949年就已經獲得了蒸餾執照並在鹿兒島成立了威士忌蒸餾所，不過在Mars信州蒸餾所成立以後，鹿兒島的蒸餾所便關閉了，所有設備和原酒也都轉移至新廠。
90年代的金融危機，雖然沒有讓Mars信州蒸餾所關閉，但是也讓蒸餾所停產了，只是把成熟的原酒一點點裝瓶推出市場，直到2011年才恢復生產。
Mars信州蒸餾所出品的單一麥芽威士忌駒嶽（komagatake）最為有名，將近20年的停產，使得蒸餾所的原酒所剩無幾。這個系列的高年份酒款都已經停產了，偶爾出現一些限量版也都是被瞬間搶購完。
在酒廠恢復生產以後，相繼推出了多個系列的酒款，其中當屬Mars Maltage 3+25最為出名，其名字的含義則是在鹿兒島蒸餾所存放過三年，又在信州蒸餾所放了25個春秋。所以這是一款28年的酒，不過現在也已經停產了，已經很難再喝得到了。
明石蒸餾所White Oak
江井島酒造Eigashima旗下的明石蒸餾所是在山崎蒸餾所之前獲得蒸餾執照的老牌威士忌酒廠，只不過該蒸餾所直到60年代才開始商業化生產威士忌。
江井島酒造以釀造清酒發家，但由於釀造清酒有季節的限制，所以明石蒸餾所依靠便利釀造燒酒和威士忌來掙點外快。因為其釀造方法是由清酒的釀造中改良出來的，所以明石蒸餾所出品的威士忌十分有本土特色，口感清淡而微妙。
明石蒸餾所除了會用陳年威士忌常用的波本桶和雪莉桶外，還會用自家的燒酒桶來陳年威士忌，使其非常具有本土個性。
已經關閉的老牌威士忌酒廠
輕井澤蒸餾所Karuizawa
*這個屬於美露香集團成立於1955年的蒸餾所，可以說是十分的有特色。重金從蘇格蘭進口大麥和泥煤，並使用大量的雪莉桶使其慢慢熟成。在如此高成本之下，酒廠的產量並不多，最終在2000年停產了。
*2007年麒麟集團收購了美露香，但是並沒有讓輕井澤蒸餾所恢復生產，而是將蒸餾所裡的原酒拿去做調配威士忌。
*後來被看見商機的一番（Number One Drinks）公司，將輕井澤蒸餾所內所剩不多的幾百桶原酒全數買去，並每年發售一些限量的酒款。誰又能想得到，曾經被麒麟集團視為累贅的輕井澤，瞬間身價翻倍。輕井澤過硬的品質、逐漸減少的庫存，讓它慢慢地被列入收藏藝術珍品之中。
羽生蒸餾所Hanyu
由東亞酒造的肥土家族創立於上世紀40年代的羽生蒸餾所，在80年代專產威士忌，2000年因金融危機而易主，04年羽生蒸餾所被新主人關閉。羽生剩下的原酒被東亞酒造創始人買下，存放在笹之川酒造(Sasanokawa)。
2004年，東亞酒造創始人肥土伊知郎成立Venture Whisky公司和秩父蒸餾所。肥土伊知郎除了釀造秩父威士忌，同時他也開始著手將羽生蒸餾所剩下來的原酒裝瓶，並以Ichiro's Malt為名上市。
Ichiro's Malt其中有一個系列，是以撲克牌為靈感，作為瓶身的圖案。與輕井澤一樣，一上市便受到了瘋狂的追捧，甚至在收藏市場被炒到了天價。
新建的威士忌酒廠
秩父蒸餾所Chichibu
秩父蒸餾所在前面講解羽生蒸餾所的時候，曾提到過秩父蒸餾所和羽生蒸餾所都是由東亞酒造的創始人肥土伊知郎所創立的。
秩父蒸餾所很多員工都是在羽生蒸餾所工作過的，但秩父蒸餾所並不是單純地複製羽生蒸餾所，這是一間小酒廠，它擁有一個年輕的團隊。
但秩父蒸餾所與羽生蒸餾所仍有許多相似之處，使用小型的蒸餾器具，陳年用的酒桶也是各式各樣。但有意思的是，秩父威士忌在進桶以前，都要過一次日本特有的水楢桶。
當然日本的威士忌酒廠，肯定不止飲客介紹的這幾家，如果真要細數日本的威士忌酒廠。那可是花上大家一天一夜的功夫。
如今，日本威士忌的價格一漲再漲，其主要原因是日本威士忌的近年來的成就，其品牌越做越大，自然價格也會相應提高。
加之不少蒸餾廠的消逝，導致在市面上的原酒越來越稀少，這也給不少的商家提供了個漲價的理由。但是也有不少威士忌愛好者鍾愛日本威士忌，認為這點價格阻擋不了他們的購買熱情。