蒙古人殺光金國皇室，最終在滅南宋以後，卻把南宋皇室保留了下來，幾乎沒有殺過。這個問題，確實有些讓人費解。這看起來有些不太符合蒙古人的做事風格，究竟是什麼原因呢？
分析一下，我認為主要有以下幾個原因：
第一，蒙古攻打金國和南宋，目的不一樣。
成吉思汗之所以能從蒙古崛起，很大一個原因，就是金國對蒙古人的殘害，對成吉思汗祖上的傷害。這就相當於努爾哈赤發布「七大恨」，靠十三副鎧甲起事一樣，那也成為成吉思汗崛起的最主要動因。
金國為了防止蒙古人崛起，不但多次製造蒙古各部落的矛盾，挑撥各部落的關係，讓他們不能統一。而且每年還派出軍隊，深入漠北直接殘殺蒙古人，實行「減丁」政策，目的是防止蒙古人人數變多而做大。另外，金國還曾把成吉思汗的祖先俺巴孩汗釘在木驢上殺死，可以說這是世仇。
蒙古人攻打金國，有報仇雪恨的意思。他們對金國皇室，自然要採用極端手段。
蒙古與南宋則沒有這些仇恨，只不過有一些小摩擦。比如蒙古人借道四川攻打金國後方的時候，曾因為糧草問題和南宋有過摩擦。比如蒙古與南宋聯合滅金以後，南宋曾為了收復「三京」，在沒有劃定邊界的情況下擅自出兵佔領土。
但是，這些矛盾，都只是小矛盾。嚴格意義上說，蒙古攻打南宋，就是赤裸裸的領土擴張。
既然要強佔人家的土地，又還要殺人家的皇室，這不是顯得太不厚道了嗎？
第二，蒙古攻打金國和南宋，形勢不一樣。
蒙古攻打金國，是處在蒙古帝國擴張的上升期，打敗金國，只是萬裡長徵走完了第一步。那時候，蒙古只是發動了第一次西徵，南邊也只是拿下了西夏和金國。他們的目標還非常遠，他們的威脅還非常多。
所以，這種時候，他們還必須向世界昭告他們的規矩，或者說他們的法則。就是如果你願意自動滅國，加入我們，我們就不會殺掉你們。如果你們不願意自廢武功，自行滅國，敢於反抗，那麼，我們把你們滅了後，就要屠城，就要殺你們的皇室。
而蒙古人攻打南宋，則處於蒙古帝國擴張的末期。一方面，忽必烈自立為大汗以後，蒙古宗王們普遍不滿，在後方宣告獨立，並且和忽必烈打成一團。忽必烈根本就忙不過來。另一方面，忽必烈消滅南宋後，他的擴張基本上就宣告結束了。南宋人對於元朝來說，就是他們的臣民，他們沒有必要擴大仇恨，激起更多的反抗。而善待南宋皇室，就是不激起反抗的重要措施。
第三，蒙古攻打金國和南宋，文化不一樣。
在攻打金國的時候，蒙古人信奉的一直是薩滿教，其文化就是徵服世界，建功立業，全世界都應該是蒙古人的臣民。而且必須用殘酷手段，用高壓政策對待那些敢於反抗的人。
而在攻打南宋的時候，一方面，忽必烈已經明顯地漢化，接受了漢人的，用君王的道德徵服世界，而不是用武力徵服世界這樣的思想。另一方面，忽必烈已經接受了藏傳佛教，佛教的寬恕忍讓精神，也讓忽必烈放棄了沒有節制的殺人。
因此，受這樣一種文化的影響，蒙古人選擇善待宋朝皇室。
（參考資料：《蒙古秘史》《元史》）