科技論文中的參考文獻，是為撰寫或編輯論文和著作而引用的有關文獻信息資源。醫刊彙編譯從經驗總結來看，在科技論文中參考文獻主要有以下幾個方面的作用：
1.作為選題背景。科技論文選題的基本要求是新穎而有學術價值，即要研究解決、創立或提出前人沒有研究和解決的問題。要使選題新穎，就必須認清選題背景，廣泛查閱有關文獻資料，了解與課題有關的前人或他人的工作，並指出存在哪些不足或空白，從而確定新的論題和研究方向。
2.作為論題。在撰寫科技論文時引用參考文獻中的觀點、理論和方法作為本論題的論(證)述對象，目的在於指出或說明前人或他人對本論題已做的研究工作，並以此為基礎做深入研究，或研究的側重點及切入角度不同，或研究方法不同，或在論據、論證方面做進一步補充和完善，或引出新的解釋和闡述，或進一步證明其可靠性、正確性，或發掘其新的學術價值和推廣應用價值。
3.作為反論題。有的作者引用參考文獻中的理論、觀點、方法、結果或結論等，旨在將其作為科技論文中質疑、爭論或反駁的對象。作者以新的更充分的論據和更嚴密合理的論證過程，指出或證明前(他)人的觀點、研究方法、結果、結論等存在的謬誤或缺陷，得出不同或相反的觀點、結果及結論，或對其進行適當修正。
4.作為論據。在撰寫科技論文時可將參考文獻中的觀點、論斷、試驗觀測數據、研究方法、計算公式、實例、圖表、結果、結論等，作為本論文的論據和論述材料。這些論據和論述材料可在科技論文中起到驗證、借鑑、參照、對比等作用，並藉此表明本論文研究方法和結論的正確性。
5.有利於落實和保護作者的著作權。學術論文參考文獻不僅體現論文作者對他人勞動成果的尊重和自身嚴謹的治學態度，同時也是論文作者應盡的一項法律義務。合理、恰當地引用參考文獻對保證論文的學術質量，繼承文獻的科學價值和提供真實的科學信息具有重要意義。
有不少的作者由於輕視參考文獻標引的作用，因而對參考文獻的標引和著錄存在不少問題，主要體現如下：
1.有些作者對寫作科技論文時標註參考文獻的重要性認識不足，存在不標註或隨意標註的問題。其實，參考文獻在體現科技論文的創新性、科學性、可靠性、實用性方面有其不可或缺的作用。另一方面，在當今時代，也是尊重知識、尊重前人成果和保護智慧財產權的一種體現。
2.標識參考文獻的目的不清楚，標識文獻的地方較為隨便。如一些常識性的文獻資料，例如一般性的公理、定理不作為引用文獻。但有些作者卻把人人皆知的一些公理、定理作為參考文獻進行標註，或是在一些普通表述的地方，並沒有明確的觀點、數據和結論，卻出現了文獻標註，讓人不知所然。這就失去了標註參考文獻的意義，造成文獻引用的累贅。
3.將內部文獻也列入了文獻索引，儘管對此絕大多數學術期刊在「徵稿簡則」中都有明示，但此問題的出現還是較為普遍的。
4.參考文獻不是自己所閱讀的書目。按相關規定，參考文獻是作者寫作時所參考的文獻書目，即必須是作者為撰寫科研論文而所閱讀過的文獻，與論文主題無關或關係不大的文獻，不應該作為參考文獻。但有些作者的參考文獻是作者轉引別人的參考文獻，有的參考文獻甚至是三引的。
這裡值得強調的是，參考文獻也是現代科技論文的一個重要組成部分，任何不重視參考文獻標註，甚至將參考文獻從略的做法都是不正確的。尤其對於科技學術期刊，其所發表論文的參考文獻標註更是不能忽略。參考文獻標註不僅能夠反映論文的科學依據和作者尊重他人研究成果並向讀者提供文中引用資料的出處，也可起到節約篇幅的作用。