南科大校長薛其坤透露，根據發展規劃，南科大將分三個階段實現建設「紮根中國大地的世界一流研究型大學」的辦學目標——到2025年，特色學科達到先進水平，建成國際化高水平研究型大學，力爭進入國家一流高校建設行列；到2035年，建成與創新型國家、先行示範區相匹配的創新型大學，努力躋身中國高校第一方陣；到2049年，成為紮根中國大地、具有全球重要影響力的世界一流研究型大學。
薛其坤說，南科大在世界各大權威高校排行榜中表現亮眼，在泰晤士、QS世界年輕大學排名中名列前茅。南科大十年間取得了一系列卓有成效的探索：探索了具有中國特色的現代大學制度；形成了以學分制、書院制、導師制，國際化、個性化、精英化「三制三化」為核心的培養特色；探索了與國際接軌的全員聘用和準聘、長聘人事管理制度；探索了以獨立課題組負責人為核心的科研管理制度；構建了以理、工、醫、商為主，兼具特色人文社科的學科體系；構建了具有深圳特色的產學研和技術轉移體系；構建了全方位、立體式、高標準的國際化體系。
十年間，南科大從最初3名教師、45名學生發展到千名教師、7500餘名學生；打造了一支國際化、高水平的師資隊伍。其中，國家級人才計劃入選者佔比約60%，境外和國外教師佔比接近三分之一，引進、培育院士45人，其中全職院士23人，國際化和高質量成為學校師資隊伍的顯著特徵。
學校目前設置8個二級學院，下設28個系、院、中心，開設30個本科專業，2018年獲批數學、物理學、生物學、力學4個博士學位授予點。薛其坤透露，目前，南科大正在籌建創新創意設計學院、公共衛生與應急管理學院、深港微電子學院，學科結構日趨完善。(首席記者 吳吉)