光緒二十一年（1895年）甲午戰爭結束後，清政府割讓了遼東半島、臺灣島以及澎湖列島。《馬關條約》籤訂後李鴻章將文本傳達給世界列強各國，在列強中間引起了不同的反響。沙俄向來將中國的東北作為其勢力範圍，不想讓日本佔領，而德國和法國也想在中國的東北分一杯羹，英國人則傾向於日本。為了自身利益，沙俄、德國、法國等國勸誡日本不要佔領遼東半島。迫於壓力，日本放棄了遼東半島，由清政府贖回。
當時清政府的湖廣總督張之洞和臺灣巡撫唐景崧堅持寧肯賠償銀兩也不能割讓臺灣，並準備以臺灣島為抵押向英國貸款賠償日本，慈禧、李鴻章拒絕了這個提議。
臺灣民主國的建立和臺灣抗日。
李鴻章的兒子李經方是交割臺灣給日本的官員，他不敢踏上臺灣，光緒二十一年（1895年）5月18日在軍艦上與日本第一任臺灣總督樺山資紀完成交割臺灣事宜，匆匆回國了。日軍近衛師團開始登陸臺灣，以武力佔據臺灣。
樺山資紀
光緒二十一年（1895年）5月19日，一艘法國軍艦進入基隆，法國軍官告訴臺灣巡撫唐景崧，大清要回臺灣不太可能，但是可以自立保護臺灣人民，這是鼓勵臺灣獨立，對抗日本的佔領。
光緒二十一年（1895年）5月23日，臺灣民主國成立，唐景崧任第一任總統，黑旗軍劉永福任大將軍，丘逢甲任副總統，兼任義勇軍統帥，國會議長林維源。唐景崧只做了25天的總統，因為臺北失守，將臺灣庫銀裝上德國商船逃回大陸；劉永福接任總統，他擔任了125天的總統，也因為戰敗回到大陸；國會議長林維源在建國第二天就逃跑了。
大規模有組織的抗日主要是劉永福的黑旗軍、林朝棟手下的軍隊和丘逢甲等率領的臺灣義勇軍。光緒二十一年（1895年）10月21日，劉永福內渡，臺灣民主國滅亡，僅僅存在150天。
丘逢甲
當然，臺灣民眾自發的抗日活動一直堅持到抗日戰爭結束。
日本發現臺灣是燙手的山芋
日軍登陸臺灣，唐景崧、劉永福、丘逢甲等人建立臺灣民主國，建軍對抗日本的近衛師團。唐景崧手下有兩名得力幹將劉永福和林朝棟，他對二人有猜忌之心，讓他們分兵各處，自己組建新的軍隊，但這些軍隊面對日軍的進攻很快潰敗下來，他也匆忙逃回大陸，連臺灣的庫銀也帶走了。
林朝棟將自己的家眷送回廈門後，返回臺灣指揮軍隊，看到日軍迅速攻佔臺北，感到大勢已去，給手下的8營士兵發了軍餉，獨自返回廈門。而他手下的軍隊卻沒有跟隨，而是參加了抗日軍事行動。
劉永福率領黑旗軍，拒絕撤退到大陸，與日軍展開周旋。當地著名士紳丘逢甲變賣所有財產，組織義勇軍抗日。
劉永福
林朝棟手下的軍隊、劉永福的黑旗軍和丘逢甲組織的義勇軍組成了抗日的主要軍事力量，前兩者在抗法戰爭中戰績卓著，分別在臺灣、廣西重創法國侵略者。
日本在佔領臺灣時，短短五個月損兵折將30000人，連續換了兩任臺灣總督，日本天皇的叔叔，日軍陸軍中將北白川宮能久親王也在戰爭中被打死了。第三任是被稱作「日本軍神」的乃木希典，他最終平息了臺灣大規模的抗日運動，但小規模抗日活動不斷，他曾經稱：「臺灣就像一位叫花子討到一匹馬，既不會騎，又會被馬踢」。這位日本「軍神」希望把臺灣賣了，他接洽了英國人，英國人殖民地很多，認為臺灣作用不大，不購買；接著他又接洽了法國人，法國人同意用1.5億法郎購買臺灣。
不過伊藤博文上臺了，乃木希典賣掉臺灣的計劃，遭到兒玉源太郎等人的激烈反對，此事也就作罷！