參考消息網10月23日報導臺媒稱，臺鐵普悠瑪10月21日發生史上最嚴重事故，造成多起傷亡，宜蘭地檢署初步判定事故原因是超速，臺鐵則表示恐是因司機員關閉ATP才會出軌。然而有臺鐵司機員認為，列車在出發前與行進中皆有出現故障可能，司機員不太可能冒著全車生命危險超速趕點，認為可能是機械或列車傾斜裝置故障等多重原因，導致車速過快。
據臺灣中時電子報10月23日報導，臺鐵局長鹿潔身表示該輛列車的ATP遭尤姓司機員關閉，而火車上的列車自動防護系統ATP，就像是汽車的自動剎停系統一樣，除了會提醒司機員該路段速限多少，速度過快還會協助減速剎車。外界認為關閉ATP恐是關鍵，導致列車超速後出軌翻覆。
淡江大學運輸管理學系教授張勝雄表示，司機員關閉ATP想必有他的專業考量。一名在臺鐵工作不願具名的員工指出，通常在ATP當機時司機員會將其關閉後重啟，且關閉須通報附近的值班站長，再轉報調度總所，但因關閉ATP屬正常狀況，一般不會因此通報總局。
該名員工認為，尤姓司機員行駛期間曾向中心通報異常狀況，在此情況下，若誤點不會咎責司機員，因此尤姓司機員不太可能會冒著全車的生命危險超速趕點，而且司機員若被抓到超速行駛，臺鐵的處罰也是「毫不手軟」，因此不太可能故意「飆車」，所以很可能是ATP故障，加上其他機械也出狀況，一連串的問題造成車速過快。
另據臺鐵員工透露，當天司機員尤振仲為單人乘務，卻遇上車輛故障，原本到宜蘭表定應是下午4時21分到，卻延遲至下午4時35分到，停2分鐘後從宜蘭開出，誤點14分，沿路調度員催促，尤振仲須邊開車邊處理列車故障問題，恐加快速度，造成這起出軌事故。
據了解，因七堵機務駕駛人力少，很多二線主管常需支援第一線作業，10月21日逢假日人力不足，因此平時在辦公室負責排班的尤振仲支援，假日出勤開車，不料卻遇上車輛故障。
知情人士說，一般而言，在列車一出問題時，列車上應要再加一名工務段人員協助，變成雙人乘務，但該列普悠瑪在宜蘭車站時一度恢復正常，就沒派員上車，繼續往南開時又出問題，原本要在花蓮換編組，卻發生事故。
至於有旅客表示，由於車上廣播列車故障，因此在羅東站下車，但普悠瑪又開走，沒想到就出事。外界因而聯想司機員尤振仲在事故前多次回報剎車壓力不足，臺鐵表示普悠瑪發車前正常，剎車壓力不足確實是不常見的狀況，但提供壓力的「主風泵」剎車壓力不足，僅會導致降速和停車，不會出軌。
這是10月21日拍攝的列車出軌翻覆事故現場。新華社記者 金良快 攝