人的飲食和作息都是長期以以來形成的一套適應環境的規律。作息的相對固定對神經系統、內分泌系統、免疫系統等人體系統都有協調和控制。為了適應環境而形成的作息規律在醫學上就是生物鐘。生物鐘究竟是什麼到現在依然是個未解之謎，但科學家發現太陽對生物鐘的影響較大。太陽的出沒與褪黑素的分泌有很大的關係，而褪黑素主要由松果體分泌。
所以時差就是相對穩定的生物鐘被打亂了，本該休息的時候卻要上班或者上學，本該活躍的時間卻要休息。這樣就很容易引起失眠，所以人們一般需要調整時差，來把生物鐘調好，才能適應新的環境。適應能力強的人很快就能建立新的生活節奏，但有些適應能力差的人甚至要一個月才能調整好生物鐘。這段時間他們整天昏昏沉沉的，嚴重影響工作學習的效率。
克服時差的影響必須要提前做好準備，上飛機之前就要開始為新的生活調整好作息制度，上飛機之後儘量多休息，以免到了目的地之後不適應。