陰陽學說，是從事物矛盾著的兩個方面的對立鬥爭，依存互根、消長轉化，來說明事物的變化與發展。五行學說，是從事物矛盾屬性的五行歸類及生克乘侮等規律，來說明事物的性質及事物間的相互關係。
陰陽五行學說，應用於醫學領域，則是以經絡、臟腑等為客觀依據，用自然現象的變化來分析、研究、歸納、解釋人體的生理活動和病理變化，並指導著臨床的診斷與治療。在實際運用的過程中，陰陽學說和五行學說，又常常是相互聯繫而不可分割的。如論述臟腑功能時，概括地說，髒為陰、腑為陽，而具體分析某一髒或腑時，除某一髒或腑有著不同的陰陽外，由於臟腑之間存在著生克制化關係，所以，任何一髒或腑的陰或陽的變化，都會涉及到與之有關臟腑的陰或陽的變化，如腎陰虛可引起肝陽上亢或心火亢盛等等。
陰陽五行學說的結合，不僅可以說明事物矛盾雙方的一般關係，而且還可以說明事物間相互聯繫、相互制約的較為具體和複雜的關係，從而有利於解釋複雜的生命現象和病理過程。中醫界普遍認為，陰陽五行學說是祖國醫學理論體系的指導思想和說理工具。筆者認為這種評價還是較為恰當的。
陰陽五行學說，基本上符合唯物辯證法、符合客觀規律。其根據是：
①認為物質世界是客觀存在的，物質是第一性，精神是第二性。中醫學所談的陰陽五行，是結合精、神、氣、血、津液以及臟腑、經絡而言的，與唯心論的玄學絕然不同，它否定了神權迷信和天命觀。
②認為對立統一規律是宇宙的根本法則。
③對事物的運動和發展、促進與制約、以及發展過程的質量互變、否定之否定等規律，也有初步的認識。
但是，應該指出，古代的辯證法帶著自發和樸素的性質，限於當時的歷史條件，還不可能有完備的理論，因而不能完全解釋宇宙。對於陰陽五行學說，一方面要認識到它來源於實踐，屬於古代樸素的唯物論和自發的辯證法思想，在中醫學發展史上起到一定的進步作用，現在還仍然在一定的範圍內，對中醫的醫療實踐起著指導作用；另一方面也要認識到它的理論形成，由於當時的社會歷史條件，還不能擺脫唯心論和形上學的影響。
特別是五行學說，由於它採用直觀的「比類取象」的方法，有些是以不完全科學的抽象來代替具體的事物，以機械、呆板的五行生剋乘侮模式，代替事物的本來辯證法，因而不可能全面地反映臟腑及臟腑之間的生理、病理過程及疾病的發展變化。作為現代人還是應用馬克思主義的方法，給以批判地總結，繼承它的合理部分，揚棄它的不合理部分，這是我們對待陰陽五行學說的正確態度。
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