三昧耶戒是指，密宗的戒法之一，為真言修行者為止惡修善所持戒法，戒法通顯密諸大戒，即含攝五戒、八戒、具足戒等，而歸於『眾生諸佛智慧之戒法。
三昧耶戒有平等、本誓、除障、驚覺四義，故此三昧耶戒亦具此等諸義。即︰
1、行者初發心時，知三三平等之理，安住佛地三昧道，照見心、佛及眾生三無差別。
2、既以三平等之理為緣，乃起大誓願，修大悲，行四無量、四攝等，能利益眾生。
3、由本誓發得三三平等之戒體時，能除滅過去、現在、未來的惡業罪障。
4、自驚察身心，制止放逸懈怠。
吳明〈佛法戒律論〉（摘錄）如下
梵語三昧耶，義有多種︰
⑴時（一時佛在）會（大會經）宗（顯示論）平等。
⑵誓願。
⑶警覺。
⑷除垢障。
三昧耶戒，即平等本誓戒，意謂與佛平等誓願。密宗修行，在傳法灌頂前，須先受三昧耶戒。由傳法之師將水自頭頂灌下，稱『傳法灌頂』，以示永不違越。三昧耶戒，就是以三種菩提心為戒。
《金剛頂宗發菩提心論》云：
『若有上根上智之人，不樂外道二乘法，有大度量，勇銳無惑，宜修佛乘。當發如是心︰我今志求阿耨多羅三藐三菩提，不求餘果。誓心決定故，魔宮震動，十方諸佛，皆悉證知。常在人天，受勝快樂。所生之處，憶持不忘。
若願成瑜伽中諸菩薩身者，亦名發菩提心。何者？為次諸尊，皆同大毗盧遮那佛身。
（中略）凡人願為善之與惡，皆先標其心而後成其志。所以求菩提者，發菩提心，修菩提行。既發如是心已，須知菩提心之行相。其行相者，三門分別。諸佛菩薩，昔在因地，發是心已，勝義行願三摩地為戒。乃至成佛無時暫忘。惟真言法中，是說三摩地法，於諸教中，缺而不書。一者行願，二者勝義，三者三摩地。
所以三種菩提心，就是行願菩提心、勝義菩提心、三摩地菩提心，以三種菩提心為戒，即三昧耶戒。
此諸佛菩薩共同發心平等本誓之戒也。所謂行願者，如論雲︰『我當利益安樂無餘有情界，觀十方含識，猶如己身。』所謂勝義者，如論雲︰『觀一切法無自性。』
所謂三摩地者，如論雲︰『當知法爾應住普賢大菩提心，（中略）照見本心，湛然清淨。』
三種菩提心可分為大悲（行願）、大智（勝義）、大定（三摩地）三德。
東密胎藏界則分為佛部（大定）、蓮花部（行願）、金剛部（勝義）三部。
亦有分為觀音（行願）、文殊（勝義）、普賢（三摩地）三尊，或分為表德（行願）、遮情（勝義）與不二（三摩地）。
《大日經》〈具緣真言品〉所列舉之四重戒
『三昧耶戒』語出《大日經》〈具緣真言品〉所列舉之四重戒，即︰
⑴ 不應遠離菩提心︰因學密行人尚在因位，具有菩提心而未圓滿，時有遠離之虞。且菩提心為三昧耶戒之根本，菩提心存則三昧耶戒在；菩提心失，則三昧耶戒失，故首要告誡不應遠離。
⑵ 不離正法不（或起）邪行︰此條對出家在家行人有同有別。出家在家均不能離開正法，即不離佛法般若，此乃共同之點。但出家人為佛法常住，清淨梵行，故不能邪行，如淫事。在家人行菩薩道，需入世俗行事，有時難免邪行，如夫婦性生活。三昧耶戒於此開許，但前提是不能離開正法，即不能脫離般若，脫離菩提心而邪行，此乃差別之處。故出家人為不離正法不邪行，在家人為不離正法起邪行。
⑶ 於一切法不慳吝︰佛法為公，不得私有。菩薩行願，弘法利生。慳吝法施，是乃滅法。故於一切法，自人天乘以至佛乘諸法，皆應法施，不得慳吝。慳吝即失菩提心，違反平等本誓。然於此知，法施是為利人，說法施皆應當機。故對大乘根機，不應說小法令退墮；對小乘根基，不應說大法令疑謗；不應向外道輒說自具妙戒，自有大法，令其嫉恨退失。
⑷ 不得不饒益眾生︰此乃菩提心根本所決定，法爾如此；有『眾生有一不成佛者，我不成佛』之大定；有『觀一切法自性，法爾如是，我為法王，如法自在』之大智。有一不饒益眾生，即遠離菩提心，違犯平等本誓。
以上四重戒，即佛所說三昧耶戒。亦即諸佛之平等本誓。以後四重禁戒，具體發展成為十重戒，亦稱十波羅夷。此十重戒在顯密二教中又各不相同。
《梵網經》所說十無盡藏戒，顯教十重戒即《梵網經》所說十無盡藏戒，犯此戒律，則得波羅夷罪。即戒律中之嚴重罪。
顯教十重戒是︰殺、盜、淫、妄語、酤酒、四眾過、自贊毀他、慳惜加毀、嗔心不受悔、謗三寶。
密教十重戒有三種，其中二種是《大日經疏》所說，另一為善無畏三藏所說。
《大日經疏》第一種十重戒為︰
⑴ 不應舍正法。
⑵ 不應舍離菩提心。
⑶ 於一切法不應慳吝。
⑷ 勿於一切眾生作不饒益行。
⑸ 不謗一切三乘教法。
⑹ 不應於一切法生慳吝。
⑺ 不得邪見，撥無因果。
⑻ 於發大心人勸其深心，不令退息。
⑼ 於小乘人前，不觀彼根而說大法。
⑽ 菩薩常當行施，不得施他人以害物之具。
《大日經疏》第二種十重戒為：
⑴ 不舍佛寶
⑵ 不舍法寶
⑶ 不舍僧寶
⑷ 不舍菩提心
⑸ 不謗一切三乘教法
⑹ 不慳吝一切法
⑺ 不起邪見
⑻ 不阻止他發大心，亦不得見其懈退而不勸發
⑼ 不差機說法
⑽ 不施一切不饒益他物。
善無畏《無畏三藏禪要》之十重戒為：
⑴ 不應退菩提心，妨成佛故。
⑵ 不應舍三寶皈依外道，是邪法故。
⑶ 不應毀謗三寶及三乘教典，背佛性故。
⑷ 於甚深大乘經典不通解處不應生疑惑，非凡夫境故。
⑸ 若有眾生已發菩提心者，不應說如是法令退墮，趣向二乘，斷三寶種故。
⑹ 未發菩提心者，亦不應說如是法，令彼於二乘之心，違本願故。
⑺ 對小乘人及邪見人前，不應輒說深妙大乘，恐彼生謗獲大殃故。
⑻ 不應發起諸邪見等法，令斷善根故。
⑼ 於外道前不應自說我具無上菩提妙戒，令彼以嗔恨心求如是物不能辦得，令退菩提心，二俱有損故。
⑽ 但於一切眾生有所損害及無利益者，皆不應作及教人作、見作隨喜，於利他法及慈悲心相違背故。
以上所有戒律，以眾生為本，菩提為根，饒益有情為業，守持本心，與佛及眾無二差別。