演員希斯萊傑的驟逝令這部電影得以關注，但是真正令這部電影大賣的是希斯萊傑超越以往的演技以及黑暗騎士的劇本，接著要介紹黑暗騎士的故事。
故事在開戰時刻的一年後，由小丑的銀行搶案作為開頭，迅速卻又不失獨創安排的計畫，既能表現劇本的獨創又能介紹出小丑的犯罪手法。而且小丑搶的銀行是黑幫銀行，高壇市黑幫們存錢的地方。
當晚，蝙蝠俠持續的打擊黑幫，同時抓到了上一集的稻草人，打擊犯罪的過程中發現到自己的裝備還是不夠，有了將配備升級的想法。
在這一年來，黑幫的狀況變得很慘。
在這一年來，女主角瑞秋也變了，除了變成別人演外，瑞秋跟新的檢察長-哈維丹特走得很近，他在這年也努力的打擊犯罪，有白色騎士之稱。
哈維丹特知道高登隊長似乎得到了別人的幫助，在對談的過程中彼此都覺得對方的人馬中有黑幫的臥底在裡面，哈維丹特也暗示說他自己有別的綽號。
在韋恩、瑞秋、哈維丹特」意外」撞見的一場晚餐中，哈維丹特講了很重要的一句話，」你不是當英雄而死，就是活著看著自己變成壞人」，韋恩此時默默決定，認為自己該把這個城市的安全託付給眼前的白色騎士。
此時，小丑也跟黑幫有了一場會談，黑幫正因為銀行的錢差點被高登找出來而煩惱，香港人劉從警方的臥底中得知消息，提早把巨款運去秘密的地方，自己躲到香港去。小丑認為劉不可信，要他們把一半的錢給他，他負責把蝙蝠俠宰掉，談判當然是失敗的。
不過當蝙蝠俠用很誇張、前所未見的手法，直接把劉空運回美國，這下子黑幫就慌了，跟小丑達成共識，拜託他收拾蝙蝠俠，回復以往的邪惡高譚市。
於是，小丑開始行動了，瞬間! 小丑就秒殺掉高譚市的警察局長還有起訴黑幫的法官，差點連檢察長哈維丹特也被小丑除掉，幸虧蝙蝠俠先將哈維丹特藏了起來，這也是蝙蝠俠與小丑的第一次交手。
在那晚之後，韋恩覺得黑道這次的行動越過界了，智慧老人阿福反而說是蝙蝠俠越過界。韋恩一直認為罪犯很容易對付，只要理解他們想法就夠了，阿福說這次的你無法理解，甚至用了一個故事來說明，又一次精確地預言有些人不想要錢、名聲，就只想要看到世界亂成一片。
因為小丑丟出預言，要在警察局長的葬禮上暗殺哈維丹特，韋恩透過預言留下的線索，以幾乎不可能的方式重新拼出子彈碎片上的指紋，想不到這樣不可能的手法找出的線索，還是小丑留下的陷阱，蝙蝠俠差點被自己人誤殺，高登隊長為了幫市長擋子彈，也壯烈犧牲。
哈維丹特偷偷劫走小丑留下的共犯，揚言不講出小丑的下落，就要弊了他。由於他是正義的檢察長，不能自行處決犯人，所以他又拿出他的銅板，用正反面來決定犯人的生死，試圖恐嚇共犯坦白，這件事情被蝙蝠俠阻止了，他不希望哈維丹特做出非法的事情，因為他是高譚市幾十年來的希望，如果白色騎士違法了，那以前他所抓的大批犯人都會被釋放出去。
蝙蝠俠告訴哈維丹特，引出小丑的唯一辦法，就是讓蝙蝠俠脫下面具，向警方自首! 然後小丑就會去找他，他把高譚託付給哈維丹特了。
哈維丹特反對這種投降的手段，阿福也是，他跟韋恩說， 忍耐下去，人們會恨你，這是蝙蝠俠的宿命，他可以被唾棄，但是他還是可以選擇繼續做下去，這才是正確決定。
只是韋恩說，蝙蝠俠無法忍受被厭惡，因為高譚市的居民也因為最近治安的敗壞，死了一堆警察，怪罪蝙蝠俠引起黑幫反彈，厭惡蝙蝠俠。韋恩決定不再做蝙蝠俠了。
想不到在自首的記者會上，哈維丹特搶先一步承認他是蝙蝠俠，成為了蝙蝠俠的替身，因為他相信小丑會出來，蝙蝠俠還會再出現救他。
真的，蝙蝠俠搭配出乎意料地蝙蝠摩託車，再加上更出乎意料、死而復生的高登隊長，好不容易在抵擋住小丑對哈維丹特的追殺，並且活捉了小丑。
想不到這又是小丑的陷阱。
小丑故意被抓，為的就是進去警局把前面的劉劫走，同時也讓警方的臥底把哈維丹特、瑞秋綁走，一切都在他的算計之中。
在更巧妙的二選一中，小丑讓一定會去救瑞秋的蝙蝠俠反而去救哈維丹特，在瑞秋被炸死後讓哈維丹特錯怪蝙蝠俠，痛失愛人的他也因此墮入了黑暗，被小丑引誘去報復害死瑞秋的其他人。
劇本設定的很棒的地方是，哈維丹特因為爆炸臉有一半被燒傷，他變成了雙面人，呼應先前提到的」另一個稱呼」。而且，由於銅板已經交給了瑞秋，這是個兩面都長一樣的銅板，當他一面出現了焦黑，代表瑞秋的死，同時也如同現在的他。本來靠自己決定命運的他，現在用這雙面銅板重新靠機率來決定別人的生死。
這段警局審問是整部電影最精彩的設計，還有幾個精彩的地方值得提:
(1)大部分的審問都是玩黑臉、白臉，電影常出現，小丑也猜警察想玩好警察、壞警察的兩面遊戲，高登說」不算是」，因為這是當黑臉揍人的不是警察，是蝙蝠俠
(2)諾蘭版本的小丑雖然被評太過黑暗以至於沒有小丑的幽默，不過這段還蠻好笑的，例如勸蝙蝠俠不要在審問的一開始就打頭……
(3)小丑說了一句名言」You complete me!」 這句話是湯姆克魯斯在甜心先生的名言，這在鋼鐵人2的預告片也出現過。
(4) 小丑說人們的道德觀、原則是爛笑話，麻煩來了他們就什麼都不管，毫無原則只會隨波逐流，我會讓你看，當事情發生時，這些文明人將會互相殘殺。
這句話暗示著後來的爆炸船實驗。
(5) 小丑不怕蝙蝠俠打他，他知道蝙蝠俠沒有任何東西可以威脅他，因為他知道蝙蝠俠的原則是不殺人。
回到故事上，高譚市現在有三個麻煩，第一個是小丑，第二是被小丑引發出來的雙面人，第三個是前面沒提到的芮斯先生。
芮斯在調查韋恩公司的時候發現到公司內部有蝙蝠車的設計圖，曾經跟福克斯威脅要錢反而被福克斯威脅回去，但是他後來又跑到電視臺說要公布蝙蝠俠的身分，結果又被威脅回去。小丑不希望芮斯做出無聊的事情，對整個城市的人說，如果沒有人殺掉芮斯，那一小時後就要隨機炸掉城市中其中一間醫院，所以有家人在醫院的都去追殺他了…到最後，還是韋恩去救他，芮斯才逃過一劫。
晚上，小丑實現了他的爆炸船實驗，這很類似社會心理學實驗，有兩艘船，一艘載一般乘客，另一艘船是由警查扣押的罪犯船，兩艘船上都有炸彈，也都有另一艘船的引爆器，如果有人跳船，就全部一起爆炸，午夜一到也會都爆炸，除非有一艘船先把另一艘船給爆了…於是兩艘船上都陷入了瘋狂又恐怖的混亂…
小丑的賭注輸了，對於人民的考驗輸了，在跟蝙蝠俠的對決也終於輸了，只是他還藏有最後一張王牌，他把白色騎士拉下來了，成功地讓哈維丹特犯罪，並且預告當有一天市民知道哈維丹特現在的真實模樣，高譚好不容易建立的信念又會再次崩潰。
哈維丹特拐走了高登的家人，讓高登重新感受他失去瑞秋的感覺。在哈維丹特要擲銅板殺高登兒子的時候，蝙蝠俠把哈維丹特跟小孩撞飛，哈維丹特不幸地從高樓跌落，蝙蝠俠雖然在最後一刻把孩子交回，自己也跌落下去。
哈維丹特似乎摔死了，但是蝙蝠俠沒死，他自願承擔著哈維丹特殺過人的罪以及殺死哈維丹特的罪，因為人們不能喪失希望，你不是當英雄而死，就是活著看著自己變成壞人」，蝙蝠俠將被警察追緝，他不是英雄，他是沉默的守護者，他是黑暗騎士。