全球首個"萬種原生生物基因組計劃"啟動

2021-01-08 新華網客戶端

       30日，全球首個 「萬種原生生物基因組計劃」正式在漢對外發布。該項目由中國科學院水生生物研究所聯合西藏大學、河南農業大學、中國農業科學院蘭州獸醫研究所、中國科學院北京基因組研究所和華中科技大學等單位共同發起，旨在繪製萬種代表性原生生物基因組圖譜，建立一個大規模的原生生物遺傳資源資料庫。

      原生生物是生物五界之一，主要是由單細胞真核生物組成的一大類群，包括單細胞真核藻類和原生動物等，已描述的物種數超過6萬種，未知種類更難以估量。

      原生生物是水生態系統的重要組分，其中的藻類貢獻了地球上近50%的光合行為；部分甲藻和硅藻的「瘋長」會造成河流和海洋的有毒藻華，帶來嚴重的環境問題。同時，很多原生生物是人、畜禽和水產動物的重要致病性寄生蟲，如造成人瘧疾的瘧原蟲、昏睡病的錐蟲、雞球蟲病的球蟲，造成魚白點病的小瓜蟲等等。在基礎生物學研究方面，一些原生生物作為模式生物作出了重要貢獻。例如在嗜熱四膜蟲中發現的核酶以及端粒和端粒酶分別獲得了1989年和2009年的諾貝爾獎。

      然而，目前已公開發表了基因組數據的原生生物僅400餘種。我國原生生物學研究始於上世紀20年代，中國科學院水生生物研究所（水生所）作為我國原生生物學的發源地，水生所建有保藏了2500餘種株真核藻類和近600種株原生動物的國家藻類和原生動物種質庫，近年來依託原生生物基因組測序和生物信息分析平臺已完成了500餘種原生生物的基因組測序。

      此次水生所牽頭啟動的「萬種原生生物基因組計劃」是國際上首次針對原生生物界的大規模基因組測序計劃。該計劃將以開放聯盟模式運行，將依託各發起單位保藏的3000多種株真核藻類和原生動物的種質資源，通過持續的樣品採集和宏基因組數據挖掘，在未來3年（2020—2022年）完成約一萬種原生生物的基因組測序和分析，將包括原生生物全部26個門/類，覆蓋超過85%的綱、60%的目和30%的科屬。

      「萬種原生生物基因組計劃」的開展，將對理解生物多樣性形成機制、多細胞生物/有性生殖的起源與演化等重大基礎生命科學問題，促進國家科技資源共享服務平臺的信息互聯互通，以及推動與生態環境保護、營養健康和疾病防治相關原生生物種質傳資源的挖掘與應用實踐具有重要意義；在科學發現、決策支撐、資源共享和科普宣傳等方面發揮重要作用。（金雨蒙 熊杰）

相關焦點

  • 全球首個!萬種原生生物基因組計劃啟動
    近日，全球首個萬種原生生物基因組計劃（Protist 10000 Genomes Project， 簡稱P10K）正式發布，旨在繪製萬種代表性原生生物基因組圖譜，建立一個大規模的原生生物遺傳資源資料庫。
  • 我國科學家啟動「萬種原生生物基因組計劃」
    科技日報記者 劉志偉 通訊員 熊奇12月30日，全球首個 「萬種原生生物基因組計劃」（Protist 10,000 Genomes Project， 簡稱P10K）正式發布，旨在繪製萬種代表性原生生物基因組圖譜，建立一個大規模的原生生物遺傳資源資料庫。
  • 前瞻基因產業全球周報第53期:1210萬元!全球首個β地中海貧血基因...
    全球首個β地中海貧血基因療法上市藍鳥生物(bluebird)是一家行業領先的基因治療公司。近日，該公司宣布，在德國推出Zynteglo，這是一種一次性的基因療法，用於適合造血幹細胞(HSC)移植但沒有人類白細胞抗原(HLA)匹配的HSC供體、年齡在12歲以上、非β0/β0基因型輸血依賴性β地中海貧血(TDT)患者的治療。
  • 萬種鳥類基因組計劃第二階段研究結果發表
    萬種鳥類基因組計劃第二階段研究結果發表 2020-11-17 昆明動物研究所 【字體：該研究團隊發表了363種鳥類基因組數據，同時通過這一數據建立了無參考序列下多基因組比對和分析的新方法，並基於這一新方法闡明高密度物種取樣對生物多樣性研究的重要性。　　萬種鳥基因組學計劃旨在構建所有現生約10500種鳥類的基因組圖譜，該項目由深圳國家基因庫、中科院、丹麥哥本哈根大學、美國史密森博物館、深圳華大生命科學研究院以及洛克菲勒大學共同主導。
  • 英國完成「10萬人基因組計劃」精準醫療加速發展
    而且，生物個體脫離了群體是沒有意義，個體基因組的意義也必須放在群體基因組的這個框架來看。這些數據獲得，還可能回答一些我們很關心的群體基因組問題，比如人類的基因池的穩健性。值得一提的是，在人類基因組計劃探索的過程中，仍然面臨著一些問題，丁國徽表示大規模人群隊列的基因組計劃面臨的問題主要有三個。
  • 史上最大生物學研究項目公布:10年內,測定150萬種真核生物基因組序列
    4月24日，《美國科學院院刊》（PNAS）發表文章，正式公布地球生物基因組計劃（Earth BioGenome Project）的細節。這標誌著這項史上規模最大、最具雄心的生命科學項目即將拉開帷幕。該項目計劃耗資47億美元，在接下來的十年間，測出所有已知的150萬種真核生物的基因組序列，並為我們找到尚未發現的全新物種。
  • 中科普瑞發布國內首個十萬人甲基化組計劃 -- 表觀星圖計劃
    同時，中科普瑞發布國內首個十萬人甲基化組計劃 -- 「表觀星圖計劃」（Epigenetics Atlas Project）。參加此次籤約儀式和發布會的嘉賓包括萬利加集團董事局主席兼總裁李偉波先生、麻薩諸塞大學校長Dr. Michael F.
  • ...機制、首個深空天線組陣系統、鳥基因組圖譜、新基因編輯工具誕生
    該研究得到國家自然科學基金、國家重點研發計劃項目和博士後基金等項目的資助。　　——科學網　　4　　我國首個深空天線組陣系統正式啟用　　經過近兩年建設，我國首個深空天線組陣系統在喀什深空站建成並完成各項調試測試工作，於近日正式啟用後投入到天問一號、嫦娥四號測控任務中。
  • 大科學計劃概述:人類基因組計劃
    這一重大成就立刻受到全世界的矚目，各國均給予了高度評價，人們認為人類基因組計劃是斷曼哈頓原子計劃，阿波羅登月計劃之後的第三大科學計劃，它對人類認識自身，提高健康水平，推動生命科學、醫學、生物技、製藥業、農業等的發展具有極其重要的意義，人類基因組工作草圖的完成是該計劃實施的一個裡程碑，標誌著人類在研究自身的過程中邁出其不意關鍵的一步。
  • 什麼是人類基因組計劃?
    &nbsp&nbsp&nbsp&nbsp1986年3月7日，諾貝爾生理學或醫學獎獲得者、美國生物學家雷納託·杜爾貝科在《科學》雜誌上發表了題為《癌症研究的轉折點——人類基因組全序列分析》的文章。
  • 人類基因組計劃:解讀基因的奧秘
    正如同著名的諾貝爾生理學與醫學獎獲得者杜伯克所說：「人類的DNA序列是人類的真諦，這個世界上發生的一切事情都與這一序列息息相關，包括癌症在內的人類疾病的發生都與基因直接或間接有關…」人類基因組計劃揭示生命奧秘人類基因組計劃是繼曼哈頓原子計劃
  • 國際人類基因組計劃重要負責人簡介
    新華網杭州8月30日電（記者李斌張樂）一個幾經爭取最後才得以落戶中國的國際會議——人類基因組計劃第十次國際戰略會議今起在杭州召開。　　來自美國、英國、德國等六個成員國十六個中心的主要負責人參加了這次國際人類基因組計劃的最高協調會議。以下是與會的國際人類基因組計劃重要負責人的簡介。　　弗朗西斯·柯林斯（Francis Collins Ph.D., M.
  • 萬種鳥基因組圖譜提供重要線索
    近十年前，隨著一項覆蓋現生約10500種鳥類的萬種鳥基因組學計劃啟動和研究的深入，科學家有望構建起所有鳥類的基因組圖譜，解析鳥類演化的歷程。11月12日，《自然》雜誌以封面論文形式，同期發表了兩篇文章，報導了該計劃第二階段的研究結果，為深入了解基因組多樣性演化奧秘提供了契機。
  • 中國與澳大利亞啟動樹熊氣候變化生態基因組學聯合科研
    中國與澳大利亞啟動樹熊氣候變化生態基因組學聯合科研 2017-10中央昆士蘭大學提供　　深圳華大生命科學研究院、國家基因庫將聯合中央昆士蘭大學的研究團隊，結合澳大利亞當地氣候變化，研究樹熊的進化史以及全球氣候變化對其生長分布和基因遺傳變異的影響，從而為澳大利亞保護樹熊、防止樹熊瀕危的管理提供策略和科學指導，包括遷移、建立新的棲息地和引入新規定。
  • Nature:三位大牛談人類基因組計劃的經驗教訓
    人類基因組計劃(HGP)在1990年啟動，並在13年的時間內完成了人類基因組測序的創舉。近日，三位頂級科學家在《Nature》雜誌上撰文，談論了人類基因組計劃的經驗和教訓。想當年，這三個機構聯合國際上多個機構開展了人類基因組計劃。他們在文中總結了HGP的六個經驗教訓。　　首先，這種工作鼓勵研究人員去接受夥伴關係，而打破了研究人員單獨工作的常態。HGP匯集了來自不同國家、不同學科的2000多名研究人員。Green、Watson和Collins指出，成功來源於強大的領導、對任務重要性的認知，以及研究人員願意放棄個人成就而實現集體利益。
  • ...人類表型組計劃(一期)上海啟動 全面解讀人類生命密碼,為制定國...
    本報上海3月26日電  （記者姜泓冰）「國際人類表型組計劃（一期）」項目近日在滬啟動。該項目是上海首批市級科技重大專項，也是上海建設具有全球影響力的科技創新中心的重要舉措，由復旦大學牽頭，中國科學院上海生命科學研究院、上海交通大學、上海市計量測試技術研究院的專家共同承擔，將聚集國內外百餘名科學家，通過對人體從宏觀至微觀的多個層次的表型特徵進行跨尺度多維度研究，首次在國際上建立先進的人類表型組學研究平臺，全面制定我國人群健康表型組標準化技術體系，構建中國首例健康人群表型圖譜及資料庫。
  • 與物種滅絕賽跑,頂尖科學家為150萬生物建「基因圖書館"
    2020年5月24日，李文教授接受了WLF獨家採訪截圖李文教授正在進行一項由他牽頭髮起的、命名為「地球生物基因組計劃」（Earth BioGenome Project, EBP）的大科學計劃。為地球生物繪家譜李文教授籌備多年，在2018年11月1日正式向全球宣布的「地球生物基因組計劃（EBP）」正是為了應對生物多樣性急劇消減的挑戰。
  • 華大海洋聯合發表匙吻鱘基因組染色體圖譜
    近日，華大海洋聯合中國水產科學研究院長江水產研究所，首次成功破譯了鱘形目、匙吻鱘科、現存唯一物種匙吻鱘（Polyodon spathula）的全基因組序列，構建了首個匙吻鱘高質量染色體圖譜，揭示了鱘魚特有的全基因組複製事件、早期脊椎動物的染色體進化和骨骼礦化機制
  • 首屆中國昆蟲基因組學及國際「5000種昆蟲基因組」計劃
    2011 年由美國昆蟲學家Gene Robinson 領銜的多位國際著名昆蟲學家更是聯合提出雄心勃勃的5000 種昆蟲全基因組測序計劃（i5K，http://www.arthropodgenomes.org/wiki/i5K）。近年來，我國科學家在家蠶、小菜蛾、飛蝗、稻飛蝨等基因組測序、以及比較和功能基因組學等方面也取得了突出的成績。