NGS建庫方案：Biomek+Echo超高通量自動化整合系統

在過去十多年裡，隨著二代測序技術的發展，測序成本已經下降了幾個數量級，但是二代測序樣品文庫製備成本仍然高昂，過程依舊複雜。微生物及病毒全基因組測序能幫助科學家們確認基因組編輯正確性，解析病原的變異及進化，是高通量基因編輯和調查微生物組、病毒學研究的常規工作。液體處理專家貝克曼庫爾特創新推出Biomek i5+Echo 525超高通量自動化整合系統，幫助研究人員實現二代測序文庫構建中高通量和低成本的需求。

圖1. Biomek i5 +Echo 525整合系統。通過將Echo 525快速、精確的聲波移液技術與Biomek i系列工作站強大而靈活的功能相結合，可以將文庫製備工作提高到超高通量。

研究團隊通過使用Illumina Nextera XT DNA試劑盒，以3種不同的微生物樣品類型（蠟狀芽孢桿菌、大腸埃希氏菌、紅球菌）進行實驗，測試了該微量化方法的有效性。Biomek i5+Echo 525 整合系統的微量化文庫製備方案可將反應體系縮小20倍，降低每次反應的試劑成本；可單次處理384個樣品，提高樣品處理通量。 值得注意的是，根據Illumina的標準推薦實驗流程，手工操作8個樣品的時間約為3小時。利用Biomek i5 +Echo 525整合系統，完成384個樣品的文庫製備僅需4小時，該時間包括了試劑分裝和孵育。試劑分裝利用選擇性吸頭移液功能，可處理靈活多變的樣品數量。微量化文庫製備使更高的通量成為可能，而無需大幅增加時間。

圖2. 微量化Illumina Nextera XT文庫製備的自動化流程。灰色代表Biomek i5完成步驟，藍色代表Echo 525完成步驟，紅色代表手工幹預步驟。Echo用於反應體系構建及Normalization/pooling；Biomek配置384通道加樣器，並具有選擇性吸頭移液功能，用於分裝Echo所需試劑並進行產物純化；可選配臺面整合的PCR儀，用於PCR擴增和孵育，減少人為幹預。

圖3.嚮導式的軟體操作界面（左），和臺面自動校對功能 (右)。如左圖所示，在軟體操作界面上用戶可以選擇樣本數量，是否使用臺面整合的PCR儀，以及運行工作流程的哪個部分。具備臺面自動校對功能（右圖），當操作人員完成耗材擺放後，工作站可自動判定耗材擺放是否正確，對錯誤擺放位置進行提示，確保程序運行前臺面擺放正確。避免由於人為擺放耗材錯誤，導致設備碰撞或試劑、時間損失。

Better together—— Echo + Biomek自動化NGS建庫方案：

· 文庫構建體系縮小20倍相應降低了試劑成本，無需吸頭的納升級聲波介導移液節省了耗材成本。

· 單次384個樣品的處理，在單位時間內實現了超高通量的樣本處理。

· 精準的納升級至微升級移液技術及自動化處理，是獲得真實結果的保障。

· 嚮導式軟體操作界面和臺面自動校對功能可減少人為操作失誤。

· 強大的數據追蹤系統能實現樣本溯源及追蹤，保證數據對接準確性。

進入網址https://beckmancoulter.wjx.cn/jq/87124115.aspx填寫調查問卷，獲取Biomek+Echo整合系統更多信息