下一代測序(NGS),中國市場對新技術具有極大包容性——訪安捷倫副...

2020-12-07 儀器信息網

  我們正在邁進一個人類健康科技蓬勃發展的大好時代,新技術的誕生掀起了精準醫療的革命。下一代測序(NGS)技術使科學家能夠快速、低成本地對整個基因組進行「測序」,使醫生能夠更早、更有效且以更低的成本發現和治療疾病。在測序領域,大眾常把目光放在測序儀上,其實測序前的質控工作同樣至關重要。

  安捷倫自1999年推出第一臺基因樣本質控設備,多年來不斷完善產品性能,拓展應用場景,豐富產品線。目前,安捷倫在測序質控市場佔有量很大,業務開展得非常成功。無論是從客戶資源、市場拓展還是產品技術,安捷倫在測序質控市場的優勢地位毋庸置疑。

  為了解全球測序產業前景及安捷倫對於NGS領域的布局和市場策略,儀器信息網特別專訪了安捷倫副總裁兼生物分子分析事業部總經理Kevin Corcoran先生。

Kevin Corcoran

安捷倫副總裁/生物分子分析事業部總經理

  安捷倫生物分子分析事業部(biomolecular analysis division,B.A.D),隸屬於安捷倫診斷和基因組學事業部(diagnostics and genomics division,DGG),主要負責安捷倫二代測序全流程設備的研發和生產。

  全球NGS產業周期性放緩 中國市場潛力巨大

  人們習慣將測序技術區分為一代、二代或者三代測序技術。事實上,除了一代經典的Sanger測序技術,二代和三代僅是測序原理不同,而非代際關係。儘管三代測序技術已經出現,但短讀長的二代測序仍是主流。且由於二代測序和三代測序技術具有互補性,這兩類技術將在一定時期內長期共存。

  前幾年,基因測序技術在中國掀起投資狂潮,行業年平均增速達15%~18%。近期,二代測序市場增速放緩到11%左右,Kevin表示這與全球經濟形勢的變化有關。「和其他行業一樣,基因測序行業的發展總會出現周期性的波動。」

  的確,對於任何新技術來說,前期一定會出現高速增長,一旦到達某一階段,增速會放緩,基因測序也不例外。已在基因測序行業從業31年的Kevin表示:「從宏觀看來,基因測序市場增長放緩只是暫時現象,未來,該領域一定會出現回升,最終會回到高速增長的狀態。」

  據Kevin介紹,北美基因測序市場已經非常成熟,北美地區的醫院已經開始大量使用基因測序儀,醫院對質控設備需求很大。「北美和歐洲是安捷倫BAD最大的市場,但市場增速在放緩。」

  Kevin曾在PacBio擔任重要職位,他帶領的PacBio在中國市場戰績輝煌。根據據Kevin的市場經驗,雖然中國在基因測序領域仍處於起步階段,但其已然成為增長潛力最大的地區。「所以,在2020年,安捷倫會把目標聚焦在具有強大潛力的中國市場。」

  全自動化Magnis BR是病理科利器

  據Kevin對中國市場的了解,「中國市場對新技術具有極大的包容性,對新技術的吸收能力非常強。」「在中國,一旦一項新技術開始應用,它接下來的發展將會非常迅速。」

  上個月,安捷倫在第九屆中國病理年會上隆重推出了又一個讓人驚豔的創新產品——NGS全自動文庫製備系統Magnis BR。

Magnis BR二代測序文庫製備系統

  Magnis BR是安捷倫燃石醫學強強聯合,共同打造的全自動化的NGS文庫製備系統,也是安捷倫面向臨床病理學市場主推的產品。Magnis BR解決了二代測序前端大量的樣本製備和文庫構建環節的人工操作,能夠將1天的人工前處理工作縮短至9個小時,且過程全自動化,操作簡單。

  隨著靶向藥物的推出,很多優質的醫院都會逐漸開展二代測序檢測。而NGS是一項技術含量高、操作複雜的技術,需要實驗人員較高的素養,而病理科真正能夠操作NGS的人員並不多。Magnis BR 解決了這一用戶痛點。「只需按一下按鈕,就可以完成測序,大大減輕實驗人員的負擔。技術人員可以在一天內完成培訓並上崗。」

  此外,對於晚期癌症病人來說,時間顯得異常寶貴。能否在短時間內拿到準確的檢測報告對於病理科醫生來說是一個至關重要的考量因素。「通常,一個樣本的測序工作流程需要一到兩周時間才能出結果,而利用Magnis BR可以在三天內完成。」

  DNA文庫製備工作一直是NGS工作流程中最複雜、變數最大的步驟之一。從長遠來看,臨床診斷是NGS文庫製備系統最重要的市場。構建NGS工作流程的臨床應用,是安捷倫在二代測序領域的重要戰略布局。

  BAD產品線豐富 涵蓋幾乎所有細分

  近幾年,安捷倫通過收購、整合其他的公司的產品,不斷擴充、完善產品線,覆蓋基因測序幾乎所有細分領域的用戶。除了上文介紹到的Magnis BR二代測序文庫製備系統,B.A.D部門還有生物分析儀、TapeStation系統、片段分析等幾個重要儀器產品。

  2100生物分析儀。2100生物分析儀能進行DNA、RNA和蛋白質量控制和定量分析,其RNA完整值是行業內目前公認的RNA完整性的金標準。「該設備以微流控晶片技術為核心,可用於電泳分離,同時對每一個片段的大小進行精確測定和濃度定量,還能進行細胞螢光參數的流式分析,解析度很高。」該設備於1999年上市,目前,全球裝機量已接近10000臺。

  TapeStation系列。該系列當前有兩種型號產品——4200和4150。4150 TapeStation系統於2018底年上市,是用於DNA和RNA樣品質量控制的自動化解決方案。該系統一大特點是全自動化、靈活量和cfDNA的質控應用。此外,TapeStation推出了DNA完整性參數,是目前很多客戶評估DNA完整性的參考標準。

  片段分析產品線。2018年初,安捷倫以2.5億美元收購以高通量平行毛細管電泳而聞名的AATI公司,獲得高解析度毛細管電泳解決方案,從此獲得能夠滿足高、甚至超高通量毛細管應用的能力。該產品線不僅是針對毛細管電泳,還可以解決二代測序、三代測序中的樣本質控問題。

Kevin Corcoran 展示2100 生物分析儀(右)和4150 TapeStation(左)系統晶片

  「我們計劃開發出這樣一個整合基因測序解決方案,這個方案包括樣本質控、Magnis BR自動化建庫、測序儀、生物信息分析軟體等,涵蓋整個基因測序工作流程,為臨床腫瘤學研究提供整體解決方案。」Kevin向我們透露,預計2021年後,安捷倫會推出一款可以整合安捷倫現有產品線的二代基因測序儀。


  受訪人介紹:

  Kevin Corcoran現任安捷倫副總裁及生物分子分析事業部(B.A.D)總經理,該部門負責為下一代測序(NGS)工作流程和其他應用研究並提供解決方案。生物分子分析事業部負責所有遺傳分析儀器和耗材相關的研發應用,也負責安捷倫診斷與基因組集團(Diagnostics and Genomics Group)基於NGS的集成臨床工作流程解決方案項目。

  Kevin在生命科學領域擁有超過30年的經驗。在加入安捷倫之前,他曾任太平洋生物科學公司(PacBio)市場開發高級副總裁。在PacBio工作的11年裡,Kevin擔任了重要的領導職務,並推動了兩個PacBio SMRT測序平臺的研發和商業發布取得成功。Kevin還曾擔任美國應用生物系統公司的副總裁兼總經理,以及加盟美國林克斯(Lynx Therapeutics)公司的執行長。

  Kevin持有加州州立大學東灣分校的計算機科學學士學位。他和妻子Janet住在加州利弗莫爾的葡萄園中,他們喜歡騎雙人自行車和打高爾夫球。此外,Kevin還是一個狂熱的摩託車愛好者,在聖克拉拉經常可以看到他開著一輛寶馬摩託車。

基因測序設備專場

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