Graphpad Prism 8.0進階篇-繪製小提琴圖

2021-01-12 網易

2019-03-05 14:18:18 來源: 每日生物評論

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  下載了GraphPad Prism 8後,迫不及待的體驗了一下小提琴圖。之前使用傳統的柱狀圖遭遇過的坑,這次一定要一個個爬出來。

  以前作圖是這樣的,這樣的(小編都懷疑人生)

  

  

  再此用了一個動畫來展示這個大坑,傳統的柱狀圖,數據可視化後易擠在一起,分布關係類似差異性不大。

  小提琴圖能夠同時展示數據的集中程度和離散程度,而柱狀圖則會丟失很多有關離散程度的信息。

  

  小提琴圖展示的是數據的分布形式,是箱線圖與核密度圖的結合。下面為大家介紹小提琴圖的繪製詳細步驟:

  1

  打開Graphpad Prism 8.0,新版界面如下,在New table&graph下選擇Column,Data table下選擇Enter or import data a new table,Options下選擇Enter replaced values,stacked into columns,Create:

  

  2

  在Data1中輸入數據:

  

  在Graphs下,點擊Data1,Graph family下Column中選擇Box and violin,選擇小提琴圖:

  

  3

  對小提琴圖進行設置和美化:

  顯示數據散點:

  雙擊小提琴圖,Format Graph下將Plot:Violin plot only改為Violin plot ,Show all points(顯示所有數據點):


  顯示數據點如下:


  雙擊小提琴圖,Format Graph下Symbols可對數據點顏色和形狀以及大小進行設置。

  在Violin plot對填充顏色及邊界厚度及顏色進行設置,Fill pattern為不同的填充模式,同樣在Format Graph下可對四分位數及中位數進行設置,設置參數包括顏色,線條模式,線條厚度最終得到如下效果:

  

  4

  標記差異或文本

  Graphpad Prism 8.0中Draw下可以繪製Lines with text(上周我們提到的新功能),Lines with text有和獨特之處,即在連接線的正中間預設了一些常用的文本例如ns,以及差異標記#及方框,這能夠方便我們在連接線正中間添加文本,提高效率:

  

  5

  導出圖片

  GraphPad Prism 8.0導出tiff圖片最大解析度(dpi)可高達1200 dpi,對於導出圖像的大小GraphPad Prism 8.0也有提高,Prism 7隻能導出最大寬度達到11英寸tiff圖片,而GraphPad Prism 8.0將最大寬度提升至25英寸。

  Graphpad Prism 8.0繪製小提琴的技巧就介紹到這,操作非常簡單,不會使用R語言繪製也可以繪製。

  關於Graphpad Prism 8.0更多使用方法技巧歡迎下方留言討論哦!

  往期回顧

  ●GraphPadPrism 8.0體驗一個月後的分享!

  ●Nature:蛋白質組學鑑定早期肝細胞癌的新治療靶標

  ●ELISA標準曲線之最優選擇

  ●Endnote 使用教程請查收!(附最新正版授權下載)

  

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