編譯 | 雪月
Addgene網站發表了一篇博客，匯總羅列了多個免費在線分子生物學相關工具網站，涵蓋引物設計、質粒圖譜、DNA序列分析等。
質粒圖譜
用於查看、編輯和製作質粒圖譜。
SnapGene Viewer: 免費查看質粒圖譜，付費可查看更多用於質粒設計的工具。
Benchling: 繪製質粒圖譜，對學術用戶免費。
Genome Compiler: 免費基於桌面的設計和繪製質粒的軟體。
Serial Cloner:免費基於桌面的設計和繪製質粒的軟體。
ApE (A plasmid Editor): 由猶他大學的M. Wayne Davis維護的工具，免費的，基於捐贈的質粒分析工具。
DNA/蛋白質資料庫搜索和分析工具
Addgene's analyze sequence tool: 比對、翻譯序列
NEBCutter2:查找酶切位點
Webcutter 2.0:查找酶切位點
Addgene vector database:質粒序列
NCBI BLAST:核苷酸或蛋白質序列比對
ExPASy translation tool: 翻譯DNA序列
UniProt:蛋白質序列和功能信息資料庫
Codon optimization tool:訪問需要設置帳號
引物設計工具
用於常規引物設計和一些應用於不同克隆需求的引物設計的站點
Primer3 and Primer3Plus:常規引物設計。
Design primers for Goldengate cloning
Design primers for In-Fusion Cloning
Design primers for Gibson Assembly and NEB HiFi DNA Assembly
OligoAnalyzer Tool from IDT: 用於髮夾分析，Tm值分析以及引物二聚體分析和其他引物特徵。
克隆連接反應計算器
可以計算出不同類型的克隆方法——restriction enzyme cloning, Gibson assembly, or In-Fusion cloning，所需的插入序列和骨架的數量。
NEB Ligation Calculator: 該工具適用於任何克隆方法。
In-Fusion cloning molar ratio calculator
實驗室數學計算器
可以幫助進行實驗室的常用計算問題。
Molarity calculator
Promega's Biomath Calculators
Primer resuspension calculator
DailyCalcs Science Calculator app for iPhone
更多分子生物工具可查看https://labworm.com/原文連結
https://blog.addgene.org/free-online-molecular-biology-tools?utm_campaign=cgdna_pilot&utm_content=133923458&utm_medium=social&utm_source=twitter&hss_channel=tw-82411462