Addgene網站發表了一篇博客,匯總羅列了多個免費在線分子生物學相關工具網站,涵蓋引物設計、質粒圖譜、DNA序列分析等。
質粒圖譜
1、https://www.snapgene.com/
2、https://www.benchling.com/
3、http://www.genomecompiler.com/
4、http://serialbasics.free.fr/Serial_Cloner.html
5、https://jorgensen.biology.utah.edu/wayned/ape/
示例圖1
DNA/蛋白質資料庫
1、https://www.addgene.org/analyze-sequence/
2、http://nc2.neb.com/NEBcutter2/
3、http://heimanlab.com/cut2.html
4、https://www.ncbi.nlm.nih.gov/orffinder/
5、https://www.addgene.org/vector-database/
6、https://blast.ncbi.nlm.nih.gov/Blast.cgi
7、https://blast.ncbi.nlm.nih.gov/Blast.cgi
8、https://web.expasy.org/translate/
9、https://www.uniprot.org/
10、https://sg.idtdna.com/pages/tools/codon-optimization-tool?11、returnurl=%2FCodonOpt
示例圖2
引物設計工具
1、http://bioinfo.ut.ee/primer3-0.4.0/
http://www.bioinformatics.nl/cgi-bin/primer3plus/primer3plus.cgi
2、https://goldengate.neb.com/#!/
3、https://www.takarabio.com/learning-centers/cloning/primer-design- and-other-tools
4、https://nebuilder.neb.com/#!/
5、https://sg.idtdna.com/site/account/loginreturnurl=%2Fcalc%2Fanalyzer
克隆連接反應計算器
1、http://nebiocalculator.neb.com/#!/ligation
2、https://www.takarabio.com/learning-centers/cloning/primer-design-and-other-tools/in-fusion-molar-ratio-calculator
實驗室數學計算器
1、https://www.graphpad.com/quickcalcs/molarityform.cfm
2、https://www.promega.com.cn/resources/tools/biomath/
3、https://sg.idtdna.com/site/account/login?returnurl= %2Fcalc%2Fresuspension%2F4、https://www.thermofisher.com/cn/zh/home/life-science/lab-data-management-analysis-software/lab-apps/dailycalcs-science-calculator-app.html
博客連結
https://blog.addgene.org/free-online-molecular-biology-tools?utm_campaign=cgdna_pilot&utm_content=133923458&utm_medium=social&utm_source=twitter&hss_channel=tw-82411462
來源:科研貓
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