生物信息學相關網站

2021-02-24 生物信息學習

生物信息學與生物計算:

https://www.weizmann.ac.il/LS_CoreFacilities/bioinformatics-lscf/about

     這是生物信息學和生物計算學的網站,由Weizmann科學研究所,生物服務部和Crown人類基因組學中心支持。研究領域主要涵蓋序列分析,蛋白質組學和基因組學等。該網站提供了資料庫,電子論壇,教育,新聞,軟體,招聘啟事等。該網站還提供了相關連結,包括歐洲分子生物學以色列國家網點,以色列國家基因組基礎設施實驗室以及國際生物信息學合作中心。 

生物信息學專題:

https://www.biosino.org/bmdc/

     中國科學院上海生命科學研究院生物信息中心的網站中的生物信息學專題提供與生物信息學有關的新聞信息,生物信息學文獻的介紹(包括的課題例如:鑑別腫瘤的亞型,細菌中的基因轉移,生物鐘與微陣列--哺乳動物的基因組有節奏,混亂的DNA區分人類與黑猩猩等等),相關軟體下載,與資料庫的連結。 

生物信息學專業網:

http://bioinf.bmi.ac.cn/ 

     生物信息學專業網旨在收集、整理與生物信息學相關的信息和資源。它的站點提供最近新聞;與生物科學相關的論文;與生物信息學相關的資料庫,軟體,公司,大學和期刊;工具的介紹,例如:序列逆向查詢系統。 

生物信息學組織:

http://bioinformatics.org/ 

     生物信息學組織是生物信息學學科的綜合性網站。其涉及的內容有新聞、事件提醒、會議消息、免費FTP工具下載、論文、URL推薦、演示幻燈片等。此外,其還擁有有關生物信息學研究組和軟體的搜尋引擎。 

香港生物信息學中心:

http://www.hkbic.bch.cuhk.edu.hk/ 

      這是香港生物信息學中心(HKBIC)的網站。香港生物信息學中心是由香港技術創新委員會和香港中文大學創辦,為香港生物技術與工業界提供中心數據資源。它為使用者提供計算設備,技術專家意見和分子生物學定向資料庫等。主要致力於核苷酸、醫學、藥物設計、毒理學、生物技術、化學工程、製藥技術等方面的研究。該網站還提供了研究、工具、新聞等方面的。 

耶魯大學蓋斯坦生物信息學實驗室:

http://bioinfo.mbb.yale.edu/ 

      這是耶魯大學蓋斯坦生物信息學實驗室的網站。耶魯大學蓋斯坦生物信息學實驗室主要致力於生物信息學的研究,其研究領域包括基因組序列,大分子結構和表達基因數據,比較基因組學,基因表達分析,大分子幾何學等。該網站還提供研究、工作、演講、論文等方面的信息。 

用於比較基因組學的生物信息學工具:

http://pga.lbl.gov/Workshop/webTools.html

      用於比較基因組學的生物信息學工具是勞倫斯伯克利國家實驗室提供的用於比較基因組學的生物信息學的軟體、資料庫和網址資源。其涵蓋五個大類分別是:基因組數據、注釋、比較基因組、陣列資源、雜集。並且,對每個類別其都有類型、名稱和描述、幫助及信息等方面的說明。 

中國生物信息學資源導航:

http://www.biosino.org/pages/source-bioinfo.htm

      這是中國生物信息學資源導航的網站。該網站主要提供與生物信息學相關的學會、組織和生物計算中心的連結,也包含對網關及網絡資源的連結。

生物信息學探討:

www.seq.cn

     這是生物信息學領域的專家、學者交流討論的平臺。由中國科學院計算研究所生物信息學小組進行精心的維護工作。

NCBI生物信息學研究工具:

http://www.ncbi.nih.gov/Tools/ 

      NCBI生物信息學研究工具網站由美國國家生物技術信息中心支持。該網站提供了許多程序的連結,內容包括數據挖掘、核酸和蛋白質組分析等。同時,網站還提供了許多相關連結和資源。 

歐洲生物信息學研究所:

http://www.ebi.ac.uk/ 

      歐洲生物信息學研究所是一個非盈利學術機構,是歐洲分子生物學實驗室的一部分。它是生物信息學研究和服務的中心。它所管理生物數據的資料庫包括核酸,蛋白質序列和大分子結構。它的使命是保證從分子生物學和基因組研究的日益增長的信息向公眾公開,並且對科學研究團體提供任何方面的免費使用,以促進科學發展。 

歐洲生物信息學研究所Ensembl基因組瀏覽器:

http://www.ebi.ac.uk/ensembl/index.html

歐洲生物信息學研究所Thornton研究組:

http://www.ebi.ac.uk/Thornton/index.html

歐洲生物信息學研究所多序列聯配資料庫: 

http://www.ebi.ac.uk/embl/Submission/alignment.html 

歐洲生物信息學研究所工具箱:

http://www.ebi.ac.uk/Tools/ 

歐洲生物信息學研究所核酸資料庫:

http://www.ebi.ac.uk/Databases/nucleotide.html 

歐洲生物信息學研究所計算基因組研究組:

http://www.ebi.ac.uk/research/CGG/index.html 

歐洲生物信息學研究所完整基因組資料庫:

http://www.ebi.ac.uk/genomes/ 

歐洲生物信息學研究所序列資料庫研究組:

http://www.ebi.ac.uk/seqdb/index.html 

Brutlag生物信息學研究組:

http://motif.stanford.edu/ 

     Brutlag生物信息學研究組是史丹福大學的一個研究團體,主要研究從蛋白質一級結構預測蛋白質結構和功能,其開發了EMOTIF、EMATRIX和3MOTIF軟體應用於非鑑定的基因組序列的功能確定,另外還開發了LOCK和3DSEARCH軟體用於比較蛋白質結構和蛋白質結構資料庫的搜索。 

生物GBF信息學小組主頁:

http://transfac.gbf.de/ 

      生物信息學小組主頁是德國生物技術研究中心的生物信息組的主頁。其提供的資源十分豐富,包括出版物、研究計劃、研究組介紹、五個重要資料庫、十二個工具軟體和資源連結等。 

Pune大學生物信息學中心:

http://bioinfo.ernet.in/ 

     Pune大學生物信息學中心成立於1987年,是生物技術系統的九大中心之一。提供生物工程領域的信息,側重病毒學,蛋白質和核酸序列與結構。其提供的資源豐富,包括資料庫、微生物菌株數據網絡系統、生物信息學中心圖書館、Alpha伺服器的軟體包、生物信息學的有用網址、EBI和PDB的資料庫鏡像等。 

北京大學生物信息學中心:

http://www.cbi.pku.edu.cn/ 

     北京大學生物信息中心(CBI)成立於1997年,是歐洲分子生物學網絡組織EMBnet的中國國家接點。幾年來,已經與多個國家的生物信息中心建立了合作關係。目前是國內資料庫種類最多,數據量最大的生物信息站點。在基因預測、基因組、蛋白質結構等領域都有相應的研究項目。 

加拿大生物信息學資源:

http://cbr-rbc.nrc-cnrc.gc.ca/index_e.php

     這是加拿大生物信息學資源(CBR)的網站。該網站由加拿大國家研究委員會(NRC)創建,旨在為國家研究委員會與其它政府、學術部門的科學家提供廣泛使用的生物信息學工具和共享數據。加拿大生物信息學資源部分由一個專門使用該資源的委員會管理,而且其資源在用於教育和非盈利研究時只需註冊均可免費作用。網站還提供有關新聞、服務與下載等信息。 

結構生物信息學公司:

http://www.strubix.com/ 

     結構生物信息學公司是世界上佔領導地位的、蛋白質組學推動的藥物發現的公司,他們大規模地產生和使用蛋白質結構信息,以期加速發現和優化過程。它提供的軟體主要針對加速藥物發現和優化過程、提高篩選效率和降低成本、極大地重視智慧財產權的地位、提高藥物性能和增加技術和市場成功的可能性。此外,還提供三個藥物資料庫。 

林奈斯生物信息學中心:

http://www.lcb.uu.se/ 

     這是林奈斯生物信息學中心(LCB)的網站。林奈斯生物信息學中心研究非常活躍,隸屬於瑞典Uppsala生物醫學中心。作為一個由Uppsala大學與瑞典農業大學的聯合研究機構,確保了高質量的尖端的研究與教育,其研究範圍從微生物與哺乳動物基因組學經計算機的功能基因組學到分子進化。網站還提供有關入學、新聞時事、研討會、工具、學生計劃等方面的信息。 

曼徹斯特大學生物信息學教育與研究:

http://www.bioinf.man.ac.uk/ 

     曼徹斯特大學生物信息學教育與研究是歐洲分子生物網絡的節點之一,負責維護一些資料庫(如蛋白質模體指紋資料庫,PRINTS)。站點提供蛋白質同源性分析,蛋白質模體指紋分析,系統發生和序列進化分析,以及微陣列分析,並提供生物信息學和PRINTS資料庫數據下載。 

《生物信息學》:

http://www3.oup.co.uk/jnls/list/bioinformatics/etoc.html

     《生物信息學》是由英國牛津大學出版社出版。其主要刊登生物信息和計算生物學方面的研究論文、書評、綜述、讀者來信和述評等文章。其刊載的文章在兩年內供給學術界免費使用。 

生物信息學:

http://biotech.icmb.utexas.edu/pages/bioinfo.html

     生物信息學是印第安納大學分子和細胞生物學研究所提供的生物信息學資源。此資源包括資料庫、基因發現程序、蛋白質模建、生物信息學在線教程、研究基金的來源、研究項目和生物信息學工具軟體等。 

生物信息學的網絡資源:

http://www1.cs.columbia.edu/~cleslie/cs4761/resources.html

     生物信息學的網絡資源是美國哥倫比亞大學的Bill Noble教授建立的有關生物信息學的網絡資源總集。其涉及面廣,包括基因組學和生物信息學中心、生物信息學工具和基因組計劃索引、DNA和蛋白質分析工具、生物信息學課程主頁、生物信息學和生物技術的學術項目、生物信息學文獻參考,以及網上引物。 

生物信息學趨勢導向:

http://www.ped.med.utah.edu/genpedscrr/Trends.htm

     生物信息學趨勢導向主要提供《今天免疫學》雜誌的增刊有關生物信息學的內容。這些內容包括的資源十分豐富,涉及文本格式資料庫,原理和實用資料庫搜索,計算生物學基因發現,多序列聯配和檢索,蛋白質分類和功能歸屬,系統進化分析和比較基因組學,功能基因組學等。 

生物信息學網:

http://starr2.myetang.com/ 

     這是生物信息學的網站,主要是負責中國醫學科學院腫瘤醫院/腫瘤研究所生物信息學研發及服務工作。該網站提供生物統計分析以SAS和R為主,並且設有其他數十種生物信息學分析輔助軟體,如Blast,Phrap, Bioperl, EMBOSS, Hmmer, GO等等。另外也提供論壇,相關論文以及常用生物信息學網址等。 

生物信息學小組:

http://life.anu.edu.au/ 

     生物信息學小組成立於1997年,主要從事分子生物信息學和生物多樣性信息學的研究。其提供豐富的軟體資源,可免費下載使用。軟體種類涉及重組掃描、系統發生分析、聯配、重複片段的檢測和PCR引物設計等。此外,還有許多資料庫資源。

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