生物信息學之 生物資料庫

2021-02-23 開源基因KeGene

NCBI GenBank（http://www.ncbi.nlm.nih.gov/）由美國國家生物技術信息中心（National Center for Biotechnology Information，NCBI）開發並負責維護。

ENA（http://www.ebi.ac.uk/ena/）歐洲核苷酸序列數據集（European Nucleotide Archive，ENA），由歐洲分子生物學研究室（EMBL）開發並負責維護。

DDBJ（http://www.ddbj.nig.ac.jp/），日本DNA資料庫（DNA Data Bank of Japan，DDBJ），由位於日本靜岡的日本國立遺傳學研究所（NIG）開發並負責維護。

基因組資料庫Ensembl（http://www.ensembl.org）由歐洲生物信息學研究所（EBI）和英國桑格研究院（Sanger Institute）合作開發。Ensembl收入了各種動物的基因組，特別是那些離我們人類近的動物（脊椎動物）。這些基因組的注釋都是通過配套開發的軟體自動添加的。

微生物宏基因組資料庫JCYI（http://www.jcvi.orgl），美國基因組研究所（The Institute for Genome Rescarch，TIGR）致力於微生物基因組的研究，也有部分植物基因組項目。它是克萊格凡特研究所的一部分，1995年成立之初只有兩個基因組，至今已擁有超過700個基因組，而且還將更多。TIGR是NCBI基因組資源的有力補充，因為它不僅擁有已完成測序的基因組，還有那些測序中的基因組信息。

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