...信息學,基因晶片相關信息學技術,藥物基因組信息學和系統生物學

導師姓名：李霞　　       導師類別：博士生導師 　

姓名： 李霞       性別： 男       出生年月： 所在院校： 哈爾濱工業大學       所在院系： 計算機應用技術 職稱： 教授       招生專業： 計算機應用技術 研究領域： 複雜疾病基因連鎖定位作圖方法, 生物醫學信息學，基因晶片相關信息學技術,藥物基因組信息學和系統生物學

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個人簡介

　　哈爾濱工業大學生物信息室主任。哈爾濱工業大學計算機專業博士（人工智慧），1993年任副教授，1997年破格晉升為教授，1999年到2001年曾在美國UNC與CWRU生物統計系作訪問教授。
　　多年來一直從事生物醫學信息學、數學與計算機方法及醫學應用等方面的教學和科研工作，曾從事藥物動力學、數量遺傳學、計算分子生物學、基因組信息學和醫學信息學等方面的教學與研究工作，主持與參加國家自然科學基金項目（3項）在內的26項課題的研究工作，發表科研論文100餘篇，其中SCI( 8篇)、EI (2篇), 編著、主編和主審著作9部，曾多次獲得科研獎勵。
　　教學經歷:
　　曾系統講授過 《 醫用高等數學》, 《 線性代數》《 概率論》, 《數理統計》, 並曾為研究生和本科生開設生物信息學相關課程:《醫用模糊數學》、《計量醫學》、《藥物與受體動力學》、《統計遺傳學》、《DNA蛋白質序列分析》、《醫學統計模型與多因素分析》、《生物信息學》、《基因組信息學》、《 生物醫用中的隨機過程》及《醫學計算與仿真分析軟體》等。

獲得獎項

　　1.《複雜疾病基因作圖的模式識別方法研究》獲省高校自然科學一等獎，省政府自然科學2等獎。2005，第1名。
　　2.《PPAP3.0 人類與醫學遺傳學群體與家系資料分析計算機系統》、獲省教委一等獎，省政府三等獎。1996，第3名。
　　3.《自動化藥物動力學分析系統》, 獲省衛生廳二等獎，省政府四等獎。1996，第1名。
　　4.《遺傳優生計算機諮詢、診斷系統的研製與應用》, 獲省計生委一等獎。衛生部優秀醫學視聽教材獎。1997，第5名。
　　5.《生理系統(藥物、受體、酶與免疫)動力學數據分析系統的研製與應用》獲省教委三等獎，1998，第3名。
　　6.《豬囊蟲病系列研究》, 已完成獲省教委一等獎，省政府三等獎。1998，第11名。
　　7.《我國生產要素密集型產業結構及其發展戰略選擇研究》1993年獲航天工業部科技進步二等獎。1993，第5名。

著作及論文

　　發表論文（100篇）：
　　100.Xia Li et al. Gene Mining: A Novel and Powerful Ensemble Decision Approach to Hunting for Disease Genes Using Microarray Expression Profiling. Nucleic Acids Research, 2004；32（9),2685-2694;(2002年影響因子：7.051)（SCI）
　　99.Li X，Zhang T .An ensemble method for gene discovery based on DNA microarray data. SCIENCE IN CHINA (Series C) 2004；34(4).（SCI）
　　98.Li X, Rao S, Moser KL, Elston RC, Olson JM, Guo Z, Zhang T: Genetic mapping of complex discrete human diseases by discriminant analysis. Progress In Natural Science 2002, 12:431-437.（SCI）
　　97.Li X, Rao S, Elston RC, Olson JM, Moser KL, Zhang T, Guo Z: Locating the genes underlying a simulated complex disease by discriminant analysis. Genet Epidemiol 2001,21 Suppl 1:S516-521.（SCI）
　　96.李霞，張田文，郭政，一種基於分類樹的集成特徵基因選擇方法，計算機學報，2004；27(5)（SCI）
　　95.Rao S, Li X. Strategies for genetic mapping of categorical traits. Genetica, 2000; BG51:1-15.（SCI）
　　94.Zheng Guo, Li X Multivariate sib-pair linkage analysis of longitudinal phenotypes by three step-wise analysis approaches, BMC Genetics，2003,4:S68.（SCI）
　　93.Rao S, Li L, Li X, Moser KL, Guo Z,Genetic Linkage Analysis of Longitudinal Hypertensive Phenotypes Using Three Summary Measures, 2002；BMC Genetics 2003 4(Suppl 1):S48（SCI）
　　92.S Rao, X Li, T Zhang, Z Guo, KL Moser, EJ Topol, Q Wang: Mining disease-relevant genes from DNA microarray data by an ensemble decision approach. Genet Epidemiol 2003, 25:267.（SCI）
　　91.S Rao, X Li, T-W Zhang, Z Guo, KL Moser, EJ Topol, Q Wang: An ensemble method for gene discovery based on DNA microarray data. The American Journal of Human Genetics 2003, 73:604.（SCI）
　　90.Li X, Rao S, Moser KL, Elston RC, Olson JM, Guo Z, Zhang T: Sib-pair Linkage Analysis of Complex Diseases via Pattern Recognition. In: Polygenic Diseases and Human Health-Proceedings of the International Symposium for Mapping and Identification of Genes for Complex Traits. Changsa, China; 2002
　　89.Li X, Zhang T, Jiang W, Rao S, Li L, Guo Z: Reverse engineering of multiple time-delayed gene regulatory networks.SNPD Beijing 2004.82.
　　88.X Li, S Rao, RC Elston, JM Olson, KL Moser, T Zhang, Z Guo: Locating the genes underlying a simulated complex disease by discriminant analysis. In: Genetic Workshop 12, International Genetic Epidemiology Society; 2000; San Antonio, TX, USA.
　　87.李霞，張田文，李麗，郭政，決策樹特徵基因選擇方法對SVM有效性的研究,中國生物醫學工程學報；2004, 23(1):66-72
　　86.李霞，張田文，饒紹奇，李麗，特徵基因挖掘的決策森林方法，哈爾濱工業大學學報，2004, 36(4).
　　85.Rao S, Li X, Guo Z, et al: An analysis-of-variance (ANOVA) approach for sib-pair linkage analysis of complex ordinal human diseases. Chinese Journal of Biomedical Engineering, English Edition 2002,11:3;104-112
　　84.Rao S. Li X. and Z.Guo Mapping Quantitative Trait Loci of Ordinal Traits Using a Structural Heteroskedastic Threshold Model: I. Mathematica Applica, 2001,14(3):46-51.
　　83.Rao S. Guo Z. and Li X. Mapping Quantitative Trait Loci of Ordinal Traits Using a Structural Heteroskedastic Threshold Model: II. Numerical Application. Theory. Mathematica Applica, 2001,14(3):3-9.
　　82.Zheng Guo, Qi Wang, Hui Yu, Xia Li. Precise Classification of Cancer Types Based on Decision Tree Analysis of Gene Function Expression Profiles, SNPD Beijing 2004.
　　81.Li L, Jiang W, Rao S, Guo Z, LI X: Feature gene selection based on a hybrid between genetic algorithm and support vector machine. SNPD Beijing 2004.
　　80.Guo Z, Li X, Rao S, Moser KL, Gong B, Shen G, Li L, Cannata R, Zirzow E, Topol EJ, Wang Q: Discriminant sib-pair linkage analysis of longitudinal phenotypes. In: Genetic Workshop 13, International Genetic Epidemiology Society; 2002; New Orleans, LA, USA
　　79.S Rao, L Li, X Li, KL Moser, Z Guo, G Shen, R Cannata, E Zirzow, EJ Topol, Q Wang: Comparison of different summary measures (mean, slope, and principal components) for genetic linkage analysis of longitudinal hypertensive phenotypes. In: Genetic Workshop 13, International Genetic Epidemiology Society; 2002; New Orleans, LA, USA. 128-132.
　　78.S Rao, G Shen, R Cannata, E Zirzow, RC Elston, X Li, L Li, EF Plow, EJ Topol, Q Wang: Heritability and linkage analysis of premature coronary artery disease and related traits based on a study of 428 ascertained multiplex families. Genetic Epidemiology 2002, 23:301.（SCI）
　　77.李麗，李霞，郭政，汪強虎, 兩種過濾特徵基因選擇算法的有效性研究.生命科學研究, 2003, 7(4):369-373.
　　76.李傳星, 李 霞, 調控通路內基因表達的相關性分析，遺傳,2004.
　　75.王海芸,李 霞,郭 政,張瑞傑,四種模式分類方法應用於基因表達譜分析的比較研究,生物醫學工程學雜誌,2004
　　74.宮濱生，李霞，郭政， SAGE遺傳分析系統的功能及應用，中國優生與遺傳雜誌2002－10－1
　　73.徐娜，李霞，郭政，杜磊，李麗，功能驅使的基因表達相似性分析，哈爾濱醫科大學，2003，37(6)183-186.
　　72.郭政，張田文，李霞，屠康，喻輝，徐建震,王辰光.利用GeneHub軟體多角度分析基因功能相關與表達相關的聯繫，生物醫學工程學雜誌，2004。（已接受）
　　71.喻輝，郭政，李霞，屠康．與實驗條件相關的基因功能模塊聚類分析方法．生物物理學報，2004（已接受）
　　70.王磊，郭政，李霞, 屠康，徐建震，喻輝，宮濱生，互作蛋白質對應基因在mRNA水平的表達相關性分析，哈爾濱醫科大學學報,2003.
　　69.朱晶，郭政，李霞，宮濱生，屠康，喻輝，徐建震，編碼蛋白位於同一個信號傳導通路內的基因表達相關性分析，哈爾濱醫科大學學報,2003
　　68.劉帥，郭政，李霞.癌細胞系基因表達譜系統性變異的聚類分析，CCML,2004。
　　67．喻輝，郭政，李霞．基於GO與基因表達譜挖掘挖掘特徵基因功能類．生物信息學．2003，1(1), 15-19.
　　66．王琦 許傑 郭政 李霞. 基因表達譜信息分析軟體IDEA與WebGEA. 生物信息學, 2003.1(1):33-36
　　65．屠康，喻輝，郭政，李霞．GO功能類與基因差異表達的關聯規則挖掘算法．生物化學與生物物理進展．(已接受)
　　64.高廣信,李霞,郭政.遺傳異質性問題的統計方法與程序,中國衛生統計2001，18（3），169.
　　63李霞 郭政 何穎，人類與醫學遺傳學群體與家系資料分析計算機系統的功能與菜單結構(II) 中國優生與遺傳雜誌1997；5(1)
　　62．李霞 郭政 何穎，人類與醫學遺傳學群體與家系資料分析計算機系統的功能與菜單結構(Ⅲ)中國優生與遺傳雜誌1997；5(1)
　　61．李霞 郭政 何穎，遺傳諮詢中復發風險估計方法中國優生與遺傳雜誌1997；5(2)　(P92)
　　60.張瑞傑, 郭政,李霞,基於基因表達譜分析的一種非參數得分算法及其界值確定方法,2002; 數理醫藥學雜誌
　　59.郭政, 李霞, 用仿真方法對用基因晶片檢測基因突變類型可行性的研究, 2002; 數理醫藥學雜誌
　　58.宮濱生, 李霞, 郭政.SAGE系統簡介及應用,中國優生與遺傳學雜誌,2002
　　57.許傑,郭政,李霞.，通過表達譜區分基因突變類型的可行性的仿真分析，數理醫藥學雜誌，2002。
　　56.許傑, 郭政,李霞. 具有單隱含層與雙隱含層神經元的神經網絡進行蛋白質二級結構預測的效果比較 哈爾濱醫科大學學報 第35卷 第6期 2001-12
　　55.張瑞潔，許傑, 郭政,李霞.微陣列差異表達基因識別的一種非參數方法，數理醫藥學雜誌，2002，
　　54．江榮才 浦佩玉 許傑 郭政 李霞 等 不同類型膠質瘤基因的表達譜分析，癌症雜誌 2002-10
　　53．張瑞傑 許傑 郭政 李霞 李康, 利用基因表達譜對組織樣品分類方法的研究,中國衛生統計 2002，
　　52．王慕潔，郭政，李霞按一級吸收(一級並行)米氏過程消除藥物的給藥方案設計：血管外給藥，生物數學學報，2002
　　51．張世謙，李霞，郭政, 心血管疾病遺傳連鎖分析及發病風險因子的研究，哈爾濱醫科大學2002
　　50．(李霞 郭政 何穎) (根據藥物動力學設計按(一級並行)米氏過程消除藥物的給藥方案：靜脈注射, 醫藥信息處理與研究1997；5(1)(P7)
　　49．( 郭政 何穎 李霞)遺傳異質性研究的若干統計方法及其程序應用, 醫學研究與實踐 1996；4(5)(P395)
　　48．李霞 郭政 何穎)群體藥物動力學分析系統與藥物動力學仿真系統, 醫學研究與實踐1996；4(5)(P437)
　　47．(李霞 郭政 何穎)應用藥物動力學評價按(一級並行)米氏過程消除藥物的給藥方案：靜脈點滴, 生物數學學報1996；11(4)（P131）
　　46．(郭政 李霞)按(一級並行)米氏過程消除藥物的穩態性質分析的數值解法, 生物數學學報1996；11(4)(P210)
　　45．(李霞 郭政 張瑞傑)遺傳度估計的計算方法, 疾病監測1996；11(3-A)(P222)
　　44．（李霞 郭政 王宏志）遺傳學研究中的通徑分析方法及其程序與應用, 中國初級衛生保健1996；10(11)(P41)
　　43．(李霞 郭政 何穎)吡喹酮治療腦囊蟲病的給藥方案設計與評價, 中國現代醫學雜誌1996;6(3)(P11)
　　42．(李霞 郭政 王慕潔)應用藥物動力學評價按(一級並行)米氏過程消除藥物的給藥方案：靜脈注射, 數理醫學雜誌1996；9(3)(P198)
　　41．(何穎 高治文 李霞)阿苯噠唑治療腦囊蟲病的給藥方案分析, 數理醫藥學雜誌1996;9(4)　(P343)
　　40．（李晶 李霞 郭政）B超圖像定量分析及在肝疾患中醫辨證中的應用, 中醫藥學報 1996；1　(P56)
　　39．(李霞 郭政 王宏志)應用藥物動力學設計按一級過程消除藥物的給藥方案：靜脈點滴, 傷殘醫學雜誌1996；4（3）（P118）
　　38．（李霞 郭政 何穎）單體型關聯與連鎖分析, 國外醫學遺傳學分冊 1996;19(6)(P293)
　　37．（郭政 何穎 李霞）人類與醫學遺傳學群體與家系資料分析計算機系統的功能與菜單結構(Ⅰ), 中國優生與遺傳雜誌1996;4(6)（P7）
　　36．（郭政 李霞 劉權章）畸形症候群的計算機輔助診斷與查詢系統簡介, 中國優生與遺傳雜誌1995；3（5）（P2）
　　35．(高廣信,李霞,郭政)疾病遺傳度估計的程序與應用, 中國初級衛生保健；2001，15（6）(P55)
　　34．(郭政 李霞 何穎)一個中國人群中血清尿酸濃度的混合分析, 中國優生與遺傳雜誌1995；3(6)(P48)
　　33．(郭政 李霞 何穎) 評價給藥方案計算機系統, 醫藥與計算機 1995；3(P290)
　　32．(李霞 郭政 何穎) 通用藥物動力學計算機分析系統, 醫藥與計算機 1995；3（P288）
　　31．(何穎 郭政 李霞) 應用藥物動力學設計按一級過程消除藥物的給藥方案：靜脈點滴, 醫藥與計算機 1995；4（P286）
　　30．(郭政 李霞) 遺傳性疾病的發病年齡分布與發病風險分析, 國外醫學遺傳學分冊 1995；18(2)(P98)
　　29．(郭政 李霞) 數量性狀主效應因素成分檢測的混合分析法, 國外醫學遺傳學分冊1995；18(3)（P128）
　　28．(郭政 王慕潔 李霞)按一級過程消除藥物的血管外給藥與靜脈注射給藥方案設計, 醫藥信息處理與研究 1995；3（2）(P13)
　　27．(郭政 何穎 李霞)我國北方人群中血糖濃度分布的混合分析, 中國衛生統計 1995；2(2)(P49)
　　26．(李霞 王慕潔 郭政)遺傳方式分析的AGFAP法及其程序應用, 數理醫藥學雜誌1995；8（2）(P145)
　　25．(何穎 郭政 李霞)多位點單倍型頻率及連鎖不平衡參數估計：程序與應用, 數理醫藥學雜誌1995；8(3)(P269)
　　24．(郭政 李霞 王慕潔)個中國人群血清甘油三脂濃度分布的混合分析, 哈爾濱醫科大學學報 1995;29(1)(P9)
　　23．( 郭政 李霞 何穎)群體藥物動力學非線性混合效應模型方法與程序, 臨床醫學工程雜誌 1994；2(1)(P24)
　　22．(何穎 郭政 高治文)遺傳方式分析的MASC法及其電腦程式, 臨床醫學工程雜誌 1994；2(1)(P24)
　　21．(郭政 李霞 何穎)家庭資料的相關性分析方法, 臨床醫學工程雜誌 1994；2(1) (P43)
　　27．(郭政 李霞)疾病遺傳方式分析：AGFAP法與APS法, 生物數學學報 1994；9(5)P71）
　　20．(郭政 李霞)一個中國人群血清膽固醇濃度分布的混合分析, 生物數學報1994；9(5) (P92)
　　19．（郭政 李霞 何穎）我國人群中體重指數分布的混合分析, 中華流行病學雜誌 1994;15(特)(P412)
　　18．（郭政 李霞）遺傳性疾病的發病年齡分布與發病風險的生存分析方法, 中華流行病學雜誌 1994;15(特)(P435)
　　17．（李霞 郭政 何穎）結合珠蛋白的遺傳多態性與肝硬化的發病風險, 中華流行病學雜誌1994；15(特)(P451)
　　16．(郭政 李霞 何穎)轉鐵蛋白及α1抗胰蛋白酶遺傳多態性與幾種疾病的關係, 哈爾濱醫科大學學報 1994；28(4)(P283)
　　15．(郭政 李霞 吳帆)On the Identification of M-M Elimination Parameters Based on Two Sets of Dose-Response Date, 生物醫學工程學雜誌1994；11(2)(P133)
　　14．(郭政 李霞 何穎)基因頻率的最大似然估計及電腦程式設計, 數理醫藥學雜誌 1994；7(1) (P75)
　　13．(何穎 王軍 李霞) 親緣係數與近交係數的計算, 數理醫藥學雜誌 1994；7(3)（P249）
　　12．(郭政 李霞 王慕潔)遺傳學研究中疾病關聯分析方法及其程序與應用, 中國衛生統計 1994；11(5)(P51)
　　11．(郭政 何穎)受累親屬對連鎖分析, 中華醫學遺傳學雜誌 1994；11（5）(P288)
　　10．(郭政 張仲 王慕潔)免疫反應動力學的幾個數學模型, 生物數學學報 1993；8(1)(P57)
　　9．(郭政 李霞 何穎)中國十二個民族的遺傳分化(I), 生物數學學報 1993；8(3)(P103)
　　8．(何穎 郭政 李霞)中國十二個民族的遺傳分化(II)南方六個民族, 生物數學學報 1993；8(4)(P93)
　　7．(李霞 張仲 王慕潔)利用血藥濃度的標準差計算藥物動力學參數標準差的傳遞方法研究, 數理醫藥學雜誌1993；6(3)(P9)
　　6．（Guo zheng, Li xia）Commingling anaiysis of two hemerrheoiogic indics in a chinese population, 哈爾濱醫科大學學報 1993；27
　　5．(郭政 李霞 郝翠霞)酶動力學與受體動力學計算機分析系統, 中國病理生理學雜誌1993；9(7)(P803)
　　4．(郭政 何穎 李霞)Commingling Analysis of two Hemorrheologic Indecis in a chiness Population, Journal of Harbin Medical University（P142）
　　3．(郭政 李霞)豬帶絛蟲生態循環的數學模型--對防治措施的定量評價, 生物數學學報1992；7(3)(P44)
　　2．(李霞 郭政 張慶普)大樣本Fuzzy聚類分析的速算法及在微機上實現, 中國衛生統計 1992；9(6)(P38)
　　1．(李霞 李晶 王宏志)阿魏酸鈉體內動力學參數的研究, 中醫藥學報 1992；4（P53）
　　主要著作:
　　1.《藥物、受體、酶與免疫反應動力學數據分析》,黑龍江省科技出版社,第一著者,1996；
　　2.《計算分子生物學與基因組信息學》,黑龍江省科技出版社, 第二著者, 1998；
　　3.《醫學遺傳學與遺傳流行病學數據分析》,黑龍江省科技出版社,第二著者, 1996；
　　4.《醫用模糊數學》,哈爾濱工業大學出版社,第二著者, 1993；
　　5.《醫用高等數學》,黑龍江省科技出版社,主審, 2000；
　　6.《醫學統計學習題集》,黑龍江省科技出版社,主審, 2000；
　　7.《醫學信息分析方法》，哈爾濱出版社，第二著者, 2001；
　　8.《醫用高等數學》，哈爾濱出版社（主編2001）；
　　9．《概率論與資訊理論基礎》，哈爾濱出版社，（主審2003）；
　　10．《現代生物信息學理論與實踐》，科學出版社，主編，2005年11月出版。

承擔項目

　　主持與參加項目26項：
　　在研項目9項（國家自然科學基2項，863高科技2項）：
　　1.國家自然科學基金：多基因複雜遺傳疾病基因作圖的模式識別與特徵提取技術（30170515），主持(第一名),2001。
　　2.國家自然科學基金：人類複雜疾病基因表達譜特徵基因識別的數據挖掘技術。主持(第一名)，2003。
　　3.國家高技術研究發展計劃（863計劃），中藥抑癌分子機理基因晶片技術平臺, 副組長，2003。
　　4.省科學計劃項目：基因功能和藥物靶點發現的整合生物信息學分析平臺，主持(第一名)，2003。
　　5.哈醫科大211項目：生物信息學開放實驗室與整合生物信息學分析平臺，主持(第一名)。
　　6.國家高技術研究發展計劃（863計劃），原位合成基因晶片技術的研發, 參加，2003。
　　7.市科學計劃項目：中藥有效成分篩選的高效生物信息學分析技術，主持，2003。
　　8.省教育廳：應用數值系統分類技術尋找複雜疾病基因，參加。
　　9.省衛生廳：基於神經網絡和基因晶片表達譜的人類疾病分類技術，參加。
　　完成項目17項
　　1．國家自然科學基金：人類複雜疾病基因定位的方法與優化策略（39970397）, 第二名。
　　2.省科學計劃（攻關）項目：人類基因定位、識別的計算機方法與應用。第二名。
　　3.省自然科學基金：人工神經網絡多基因複雜疾病基因作圖技術的研究。主持(第一名)。
　　4.市科學計劃（攻關）項目：基因連鎖定位分析數學計算機方法及應用。主持(第一名)。
　　5.省自然科學基金：DNA與蛋白質序列分析的方法、程序與應用，主持(第一名)。
　　6.省科學計劃（攻關）項目：人類基因定位、識別的計算機方法與應用，第二名。
　　7.市科學計劃項目：基因連鎖定位分析數學計算機方法及應用，第二名，已完成。
　　8.省教委課題：人類遺傳群體與家系資料計算機分析系統, 第二名，已完成。
　　9.省衛生廳課題：自動化藥物動力學分析軟體包,主持(第一名)，已完成。
　　10.省科委青年課題：治療囊蟲病藥物的定量研究及個體最優化給藥方案設計,主持(第一名)，已完成。
　　11.省計生委課題:優生優育計算機輔助診斷與查詢系統, 第四名，已完成。
　　12.省教委課題:酶與受體動力學計算機分析系統的開發與應用研究，第三名，已完成。
　　13.省中醫管理局課題:B型超聲圖象定量分析及其在肝疾患中醫辨證中的應用，第三名，已完成。
　　14.市科委課題:骨科專用醫學影像計算機處理系統的開發，第三名，已完成。
　　15.省教委課題:遺傳病復發風險估計計算機分析，主持(第一名),已完成。
　　16．航天工業部課題：《我國生產要素密集型產業結構及其發展戰略選擇研究》，第5名。
　　17．省衛生廳課題：利用小家系資料進行基因定位。省衛生廳課題：利用小家系資料進行基因定位，第2名。