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【中國科學報】科學家繪製出腦前額葉發育單細胞圖譜
近日,中科院生物物理所王曉群課題組、北京大學未來基因診斷高精尖創新中心湯富酬課題組、北京大學第三醫院喬傑課題組和首都醫科大學附屬安貞醫院張軍課題組合作,繪製出人腦前額葉胚胎發育過程的單細胞轉錄組圖譜,並對其中關鍵的細胞類型進行了系統功能研究,為繪製完整的人腦細胞圖譜奠定重要基礎。相關研究成果已發表在《自然》上。
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科學家繪製出腦前額葉發育單細胞圖譜
近日,中科院生物物理所王曉群課題組、北京大學未來基因診斷高精尖創新中心湯富酬課題組、北京大學第三醫院喬傑課題組和首都醫科大學附屬安貞醫院張軍課題組合作,繪製出人腦前額葉胚胎發育過程的單細胞轉錄組圖譜,並對其中關鍵的細胞類型進行了系統功能研究,為繪製完整的人腦細胞圖譜奠定重要基礎。相關研究成果已發表在《自然》上。
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Nature:研究繪製出人腦前額葉發育的單細胞圖譜
近日,中國科學院生物物理研究所王曉群課題組、北京大學未來基因診斷高精尖創新中心湯富酬課題組、北京大學第三醫院喬傑課題組和首都醫科大學附屬安貞醫院張軍課題組合作,繪製出人腦前額葉胚胎發育過程的單細胞轉錄組圖譜
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生物物理所等繪製出人腦前額葉發育的單細胞圖譜
近日,中國科學院生物物理研究所王曉群課題組、北京大學未來基因診斷高精尖創新中心湯富酬課題組、北京大學第三醫院喬傑課題組和首都醫科大學附屬安貞醫院張軍課題組合作,繪製出人腦前額葉胚胎發育過程的單細胞轉錄組圖譜,並對其中關鍵的細胞類型進行了系統功能研究,為繪製完整的人腦細胞圖譜奠定重要基礎。
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科學家繪製出人類肺臟的單細胞RNA測序圖譜
科學家繪製出人類肺臟的單細胞RNA測序圖譜 作者:小柯機器人 發布時間:2020/11/22 23:41:19 美國史丹福大學Mark A. Krasnow、Stephen R.
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研究人員通過單細胞測序繪製首個人胚胎造血和免疫系統發育圖譜
,首次報導了由胎肝驅動的人胚胎造血和免疫系統發育過程的單細胞圖譜。在該項研究中,作者首先製備了受孕後4周至17周的人胚胎肝臟、卵黃囊、腎臟和皮膚組織單細胞懸液,隨後利用流式細胞術和單細胞測序技術對其進行了轉錄組基因表達定量分析,從而構建了完整的人胚胎造血和免疫系統發育圖譜。基於這一單細胞圖譜數據集,作者主要利用了基於力導向圖算法的數據降維方法,以高維度基因表達譜為依據,推測了造血和免疫細胞的發育路徑。
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基於單細胞RNA測序繪製人類肺組織分子細胞圖譜
RNA-seq技術已經在繪製器官基因表達譜研究中發揮了關鍵作用,但目前很難系統地鑑定和定位單個器官中所有分子細胞的類型,並創建完整的分子細胞圖譜。該研究利用10x Chromium發現罕見細胞類型 ,再通過SmartSeq2獲得更深入的轉錄信息。通過基於液滴和孔板的單細胞RNA測序(droplet- and plate-based single-cell RNA sequencing),研究團隊對所有肺組織間室和循環血液中的約75,000個細胞進行了測序,結合多種細胞注釋方法,最終繪製了一個全面的人肺分子細胞圖譜。
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【學術前沿】王曉群/薛天等合作繪製人類視網膜發育的單細胞圖譜並...
【學術前沿】王曉群/薛天等合作繪製人類視網膜發育的單細胞圖譜並解析了細胞命運決定和黃斑形成的細胞和… 2020-05-10 03:22 來源:澎湃新聞·澎湃號·政務
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從單細胞窺探生命奧秘!新技術揭開人類細胞生長發育之謎
11月20日,《科學》刊登了其獲獎短文,描述了有助於研究生命產生奧秘的4項高通量單細胞測序技術。近幾年,單細胞測序技術,尤其是單細胞轉錄組測序技術,通過同時檢測單細胞幾萬種基因的表達,精確定義了細胞的分子學狀態,從而被廣泛應用於檢測新的細胞種類,以及研究發育和疾病對細胞狀態的影響。
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從單細胞窺探生命奧秘 新技術揭開人類細胞生長發育之謎
近幾年,單細胞測序技術,尤其是單細胞轉錄組測序技術,通過同時檢測單細胞幾萬種基因的表達,精確定義了細胞的分子學狀態,從而被廣泛應用於檢測新的細胞種類,以及研究發育和疾病對細胞狀態的影響。但目前的單細胞測序技術只能檢測幾千個細胞,遠遠低於正常人體組織包含的細胞數目(百萬級),同時耗材費用昂貴,因此無法全面檢測人體組織中的細胞種類和變化。
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單細胞RNA測序技術的研究進展
單細胞RNA測序已成為解剖細胞異質性並將組織分解成細胞類型和/或細胞狀態的必不可少的工具,這為從頭發現提供了巨大的潛力。單細胞轉錄組圖譜提供了前所未有的解析度,可揭示複雜的細胞事件並加深我們對生物系統的了解。在本綜述中,簡要簡紹了單細胞RNA測序技術及相關應用。我們預計單細胞RNA測序在生物學中的作用將日益增強,在提供空間信息和與細胞形態的方面將進一步提高。將來,能夠更好地應用於科研領域。
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類器官體單細胞測序揭示人類大腦發育特徵
類器官體單細胞測序揭示人類大腦發育特徵 作者:小柯機器人 發布時間:2019/10/17 14:17:36 德國馬克斯·普朗克進化人類學研究所J.
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科學家繪製出單細胞解析度下人類腸道發育的時空圖譜
科學家繪製出單細胞解析度下人類腸道發育的時空圖譜 作者:小柯機器人 發布時間:2021/1/6 17:36:06 英國牛津大學Alison Simmons、HashemKoohy等研究人員合作繪製出單細胞解析度下人類腸道發育的時空圖譜
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2018單細胞測序應用領域突破性成果盤點
Cell:以色列研究團隊使用單細胞轉錄組測序揭示黑色素瘤腫瘤浸潤T細胞的轉錄組異質性和分化途徑 2018年12月,以色列Ido Amit實驗室李漢傑博士等通過對25名黑色素瘤患者腫瘤中免疫細胞的單細胞轉錄組測序和單細胞TCR測序分析,繪製黑色素瘤詳盡的免疫細胞圖譜。
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利用高精度單細胞轉錄組測序技術首次繪製食蟹猴卵巢單細胞衰老圖譜
該研究利用高精度單細胞轉錄組測序技術首次繪製了食蟹猴卵巢的單細胞衰老圖譜,同時利用人類卵巢細胞研究體系,發現增齡伴隨的抗氧化能力的下降是靈長類卵巢衰老的主要特徵之一。 卵巢結構複雜,細胞組成具有高度異質性,其中包含處於多個不同發育階段的卵泡,還有其它為卵泡發育提供必要營養和支撐的多種細胞類型。。
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單細胞測序技術「遍地開花」 精準醫療「如虎添翼」!
相比於群體細胞測序,更適用於解決少量特殊樣本的研究、異質性群體的分析及同時或互斥發生的基因組變化的查找等問題。單細胞測序技術在腫瘤、發育生物學、神經科學等領域有重要應用,是現今生命科學研究的焦點。單細胞測序技術的應用單細胞測序技術助力腫瘤研究1.Cell:以色列研究團隊使用單細胞轉錄組測序揭示黑色素瘤腫瘤浸潤T細胞的轉錄組異質性和分化途徑。
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科學家繪製人類巨噬細胞發育圖譜
科學家繪製人類巨噬細胞發育圖譜 作者:小柯機器人 發布時間:2020/5/22 13:37:02 中國人民解放軍總醫院第五醫學中心劉兵、新加坡免疫協作組Florent Ginhoux、暨南大學基礎醫學院蘭雨等研究人員合作繪製了人類巨噬細胞的發育圖譜
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單細胞測序繪製人類肺組織細胞圖譜
同時作者利用多用細胞注釋分析方法,全面分析肺部不同細胞類型的組成、功能、細胞間相互通訊,形成了較為完整的人類肺組織細胞類型和轉錄組圖譜。通過小鼠肺組織細胞進行同源比對,解析了肺組織在進化上的改變情況,並探討了在醫學研究中的意義。
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單細胞測序技術「遍地開花」,精準醫療「如虎添翼」!
2015年以來,10X Genomics、Drop-seq、Micro-well、Split-seq等技術的出現,徹底降低了單細胞測序的成本門檻。自此,單細胞測序技術被廣泛應用於基礎科研和臨床研究。 單細胞測序是從單個細胞水平對基因組和轉錄組進行的研究。
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【綜述】盤點單細胞測序研究——續篇
單細胞測序在腫瘤、發育生物學、免疫學、神經科學、大規模細胞圖譜構建、細胞亞群細化&稀有細胞類型鑑定等領域有重要應用,是目前研究的焦點。Frolov的實驗室採用了一種稱為Drop-seq的技術,該技術可使研究人員分離單細胞並對其進行基因測序。Drop-seq可以同時對數千個單個細胞進行測序。他們的結果發表在《自然通訊》上。