看到師弟論文裡辣眼睛的統計圖,我實在忍不住了……

2020-12-05 騰訊網

成功發表一篇高分 SCI 是很多人孜孜以求的目標，而製作精良的統計圖在發表 SCI 的過程中起著不可或缺的作用。

儘管市面上繪製統計圖的軟體很多，但 SCI 期刊普遍承認的統計繪圖軟體只有一個 ——GraphPad Prism。

Graphpad Prism 是由 Graphpad 公司推出的一款非常實用的醫學繪圖軟體。集生物統計、曲線擬合和科技繪圖於一體，可用於 Windows 和 Mac 電腦，在生物學界得到廣泛使用。

圖片來源：Graphpad 官網

GraphPad Prism 的優點主要有：

1、可繪製高解析度的統計圖

統計圖解析度（dpi）高達 1200，可大幅度放大，且圖形輸出格式多達 9 種，適用於各種需求。

2、系統實用，功能強大

適用的統計方法非常多，幾乎所有的統計圖都可以繪製。

3、操作簡便，易於掌握

別的軟體製作一些統計圖過程非常複雜，而使用 GraphPad Prism 卻極為簡便。

如累積發病率統計圖，使用 SAS 軟體需要編寫代碼繪製，在 GraphPad Prism 中只需要將數據錄入，然後進行點擊操作即可。

而最新的 GraphPad Prism 8.0 更是在數據可視化、提高效率、統計等方面做了長足的改進，有諸多新功能出現。

教程合集

學霸菌整理了過往的 GraphPad Prism 教程，希望可以幫助到各位正在寫論文的同學們。

1、用 GraphPad Prism 製作火山圖

作為一個只做溼實驗的生物汪，拿到公司給的 RNA-Seq 分析結果時是開心的，然而感覺離 published figure 差一點點，作為精益求精的汪必須要親自上手。

求教了一下會生信的同學，他說：「R 就可以作圖。」

「我不會，我也不想學啊！」

他又說:「Excel 就可以作圖，散點圖即可。」

哇，既然是散點圖，那 GraphPad Prism 就可以做啊！......

2、用 GraphPad Prism 製作藥物抑制擬合曲線圖

以藥理學中經常用到的藥物劑量依賴的抑制擬合曲線圖為例給大家做講解，作圖軟體是 GraphPad Prism，使用 GraphPad Prism 作藥物抑制擬合曲線圖不僅圖片優美，而且可以計算藥物的半抑制濃度 IC50......

3、用 GraphPad Prism 製作漂亮的小提琴圖

我們都知道，小提琴圖能顯示數據的集中與離散程度，數據越集中圖形越胖。另外，其箱線圖可用來展示中位數和四分位數。

一般來說呢，R 語言繪製小提琴圖更佳，但是 R 語言學習代價太高，科研小白難以掌握，所以我們該如何繪製小提琴圖呢？

4、用 GraphPad Prism 搞定多因素方差分析

應小夥伴們的要求，給大家繼續介紹強大的 graphpad prism 8.0 是如何進行多因素方差分析的。我們以雙（多）分析中的析因分析為例來介紹......

5、Graphpad 的統計分析功能之非配對 / 獨立樣本 t 檢驗

在統計學分析裡，最重要的元素是數據，因為數據的屬性決定了用什麼樣的方式來比較數據，不同的數據比較方式就決定了統計分析方法以及對應的統計圖。

今天繼續給大家介紹一下 Graphpad 的統計分析功能之非配對 / 獨立樣本（unpaired）t 檢驗......

6、用 GraphPad Prism 繪製「森林圖」

森林圖 (forest plots) 是以估計模型 (固定效應模型或是隨機效應模型) 結果為基礎繪製出的圖型。我們以 Graphpad Prism 8.0 為例，教大家如何繪製回歸分析結果的森林圖......

7、用 GraphPad Prism 搞定卡方檢驗

卡方檢驗是一種常用的假設檢驗方法，屬於非參數檢驗，主要是比較兩個及兩個以上樣本率（構成比）以及兩個分類變量的關聯性分析。它包括兩個率或兩個構成比比較的卡方檢驗；多個率或多個構成比比較的卡方檢驗以及分類資料的相關分析等。

今天繼續給大家介紹 graphpad 統計分析系列教程中的卡方檢驗......

8、用 GraphPad Prism 繪製 cleveland 點圖

大家在閱讀文獻的時候一定看到過這種形似火柴或者棒棒糖的統計圖，行話叫 Cleveland 點圖，用來反映各分組中某指標平均值......

9、用 GraphPad Prism 繪製組合圖

在 SCI 論文中經常見到組合圖。

為什麼會用到組合圖呢？那是因為在投稿時可能會遇到對 figure 數量的 requirements。這樣就要求我們將多幅圖片組合排版到一起，即條理清晰，又能突出重點，何樂而不為呢。

但是組合圖 dpi 的要求比較高，除了應用主流的 PS 處理之外，今天給大家示例別的方法......

10、用 GraphPad Prism 繪製面積填充顏色的誤差棒圖

很多小夥伴們在閱讀文獻的過程中偶爾會看到下圖這樣的統計圖片，很漂亮，叫做面積填充顏色的誤差棒圖，筆者更願意叫它「彩帶圖」。

圖片來源：PLOS Biology

每條曲線中間為均值、均值上下方的淺色區域為數據誤差。

很多人應該會問了，強大的 graphpad 軟體能不能做這種圖呢？

答案是肯定的，接下來筆者就給大家演示如何製作...

11、用 GraphPad Prism 繪製折線圖

折線圖可以顯示隨時間（根據常用比例設置）而變化的連續數據，因此非常適用於顯示在相等時間間隔數據的變化趨勢。

今天給大家講解 Graphpad 繪製折線圖，話不多說，直接進入教程。

12、用 GraphPad Prism 繪製柱形圖

今天給大家介紹 GraphPad Prism 如何繪製柱狀圖。

柱狀圖通常表示均值 ± 標準差的數據，數據要求符合正態分布，描述數據的特點或者比較各組數據間的差異，多數情況下採用方差分析和 T 檢驗。

13、GraphPad Prism 生存曲線繪製指南

腫瘤專業的小夥伴一定經常用到生存曲線，1928 年生存曲線（又稱存活曲線）首次由美國生物學家雷蒙·普爾提出，它可以反映不同種群在每個年齡段生存的數目。

1958 年，Edward L. Kaplan 和 Paul Meier也首次在臨床研究中提出了生存曲線的概念，又被稱作 Kaplan-Meier 曲線，主要用來對各組患者的生存狀況進行描述。

而作圖神器 graphpad prism 8.0 也可以做生存曲線，接下來給大家介紹步驟...

如何安裝？

大家看了這麼多教程是不是心痒痒了？

官網：https://www.graphpad.com/

圖片來源：Graphpad 官網

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封面來源：圖蟲創意

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