首先，作物受到真菌感染後，會出現不同形狀的病斑，而且病斑上會產生不同顏色的黴狀物或粉狀物，無異味。而受到細菌傷害後，葉片上的病斑無黴狀物或粉狀物，由此可以來判斷，作物是受到真菌感染髮病還是細菌感染，從而來採取不同的應對措施。除此之外呢。
細菌性病害還有幾個特點，就是病斑處很薄，容易破裂或穿孔；根莖葉很容易腐爛，有異味；果實上面受到細菌感染以後，有瘡痂，表面有突起。在農作物侵染性病害中，其中有80%以上都屬於真菌性病害。
除了細菌和真菌的危害之外，還有病毒性病害和生理性病害以及藥害，病毒性病害一般是表現在嫩葉上，種類不是很多，但是危害較大，而且不好防治；而生理性病害一般不具有傳染性。
那麼真菌性病害有哪些呢？
根腫菌病和粉痂菌病、霜黴病、白粉病、黑粉菌和鏽菌誘發的黑粉病、銹病，根腐病和莖基腐病，芽孢綱病原引起的枯萎病、黃萎病，黑盤孢菌引起的炭疽病、球殼菌引起的幹腐病，等等，都屬於真菌性病害。真菌性病害在潮溼環境條件下，會有菌絲和孢子產生。
細菌性病害有哪些？
細菌性病害出現的病症是膿狀物，會造成壞死、腐爛、畸形等症狀，病斑多呈角斑狀。
咯菌腈是目前世界上殺菌最廣，殺菌最高效，也是價格最高的拌種劑殺菌性成分，咯菌腈目前折百噸價位150萬元人民幣左右。
其實通過抑制葡萄糖磷醯化有關的轉移，並抑制真菌菌絲體的生長，最終導致病菌死亡。可以高效的防治小麥腥黑穗病、雪黴病、紋枯病、根腐病、全蝕病、穎枯病、稈黑粉病；玉米青枯病、莖基腐病、猝倒病；棉花立枯病、紅腐病、炭疽病、黑根病、種子腐爛病；大豆花生立枯病、根腐病；水稻惡苗病、立枯病；油菜黑脛病；馬鈴薯立枯病。
除了用咯菌腈防治真菌性病害之外呢，百菌清、代森錳鋅對猝倒病、霜黴病療效顯著；甲託、多菌靈、咪鮮胺可高效防治立枯病、枯萎病、褐斑病；有機銅、無機銅、鏈黴素、中生菌素可以防治黑粉病、白粉病、葉枯病、青枯病等。
細菌性病害則一般使用農鏈、葉枯唑、三氯、中生、銅製劑、新直黴素、甲基硫菌靈等進行防治。梧寧黴素（四黴素）防治細菌性病害活性高，同時對人畜無毒，是比較有競爭力的生物殺菌劑。噻菌銅在防治蔬菜、瓜果上的細菌性病斑時，稀釋500-600倍液，防治效果較佳。乙蒜素也是比較常見的一種防治細菌病害的藥劑。
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