新冠肺炎疫情爆發初期,醫護人員在抗疫,科學家們在做什麼?時至今日,它帶來了什麼啟示?除了今年的國際基因組學大會(International Conference on Genomics,簡稱ICG),我們很難找到這樣一個權威科學界雲集場合和機會,一起回顧科學家如何應對未知和恐懼。
ICG是由華大基因主辦的生命科學學術交流會議,始於2006年,到今年已是第15屆。放大燈團隊(ID:guokr233)受邀參加了本屆大會,並在現場給各位帶來實況報導。
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放大燈團隊丨策劃
先重點看一下本屆大會與往屆的些許不同:
圖丨放大燈
今年ICG-15移師武漢,其來有自。
一方面,武漢疫情初期,中國科學家快速測定病毒基因序列,為抗疫的決策措施贏得了寶貴時間,本屆會議在武漢召開,無論對抗疫還是對科研而言,紀念與象徵意味濃厚;
另一方面,也得來點實在的。主辦方之一華大基因與武漢市政府,也在ICG期間宣布了重大合作項目:誕生於武漢光谷,在疫情期間發揮了重大作用的快速核酸檢測設施——華大「火眼」實驗室的核心能力和生產製造產業將落地武漢;華大智造智能製造及研發基地項目也將在武漢光谷開工,該項目總投資預計達到24億元人民幣,預計2022年完成一期建成投產。
根據武漢市委書記王忠林在開幕式上介紹,預計2020年武漢生物醫藥產業規模可超2500億元。
新冠肺炎是會議主要話題之一。會議首日(10月26日),放大燈團隊(ID:guokr233)自現場發回專業人士高福(中國疾病預防控制中心主任)和張永振(上海公共衛生臨床中心研究員)的演講精粹。
在新冠疫情期間陷入「搶發論文爭議」[1],並建議CDC進行改革的中疾控主任、中科院院士高福,在開幕當日以連線形式作了演講。高福認為,對病原體基因組的研究非常重要,並特別強調:
第一,新冠疫情是挑戰,此前科學家已預測到類似疫情的暴發。此前科學家就預測人類會遭遇冠病毒或流感病毒引發的(全球性)疫情,這次就是新冠病毒。新冠疫情是黑天鵝事件,我們都沒做好準備,但是科學們此前已經在呼籲要做好準備。
第二,合作很重要。今年1月8日時,包括CDC、中國醫學科學院等五六個小組就合作找到了新冠病毒的全基因組,實現了非常快的數據分享。
第三,數據分享是關鍵。要戰勝像新冠這樣的重大挑戰,「基因組數據的分享是一切工作的開始,尤其是對病原體控制而言。」
第四,疫苗是關鍵。有疫苗才能夠控制像這樣的一些造成公眾緊急事件的病毒傳染。通過疫苗——種牛痘,人類幾乎已經解決了天花。疫苗的製備、準備研發都非常重要。我們已以史無前例的速度,緊鑼密鼓地研發疫苗。
第五是團結。「政治家、科學家、學者們要做好合作的準備。沒有一個國家、沒有一個人能夠在像新冠疫情這樣的大挑戰面前獨善其身。」
高福最後強調,還是要尋找冠狀病毒和SARS病毒的中間宿主。人們現在認為中間宿主可能是蝙蝠或者果子狸等,但實際上還沒有在蝙蝠身上發現同樣的病毒,不同蝙蝠之間攜帶的病毒也有所不同。因此,還必須做更多的科學工作和數據分享。
此前,武漢病毒所石正麗團隊研究表明,新冠病毒來源指向蝙蝠[2]。本屆ICG大會上,石正麗也將做主題演講,歡迎和放大燈團隊一起緊跟議程,關注石正麗的演講。
與張文宏、石正麗、高福等人不同,在疫情期間,復旦大學附屬上海公共衛生臨床中心張永振教授相對低調,受到公眾關注不多。張永振是首先測得新冠病毒基因序列的人(也因此被《時代》周刊評為「2020年最具影響力的人物」之一[3])。
張永振團隊發現了多種新型RNA病毒(WhenZhou Virus、JingMenVirus等),已經證明這些病毒可感染人類。迄今為止,國際病毒分類委員會(ICTV)確定了病毒的14個目,其中就包括張教授團隊發現的3個目。
在「我們何時能像天氣預報那樣預測疫病爆發」(When could we predict the the emergence of the infectious diseases like weather forecast?)的主題演講中,張永振表示,目前對病毒的了解還十分有限。同時披露了疫情初期,他的團隊參與新冠病毒(SARS-CoV-2)基因序列測定的細節。
復旦大學附屬上海公共衛生臨床中心張永振教授 圖丨放大燈團隊攝
今年1月3日下午1點30分,自武漢採集的肺支氣管肺泡灌洗液被送往張教授所在的上海公共衛生中心所在的實驗室。
1月5日早上7時,這種SARS樣病毒的全基因組序列被破解。
張永振教授和武漢中心醫院的同行討論後,得出了初步結論:這種病毒是類似於SARS的一種新型冠狀病毒;引發的病症比高致病性禽流感更嚴重;它會通過呼吸系統傳播。
包含著這些判斷和控制措施建議的報告隨即被送往北京和上海有關部門。同日,張永振教授團隊向美國國家生物技術信息中心(National Center for Biotechnology Information ,NCBI)建立的DNA序列資料庫GenBank釋放了這種新型冠狀病毒的基因序列。
張教授把這段經歷總結為:「常規科研,偶然發現。事關重大,立即上報。」
張永振團隊於1月5日完成新冠病毒測序,推測病毒可以通過呼吸系統傳播,並將結果上報有關部門
此外,大會首日,許多專家都提及了基因組學的研究在於疫情防控、疾病治療乃至生育篩查等方面的重要性,這也正呼應了本次國際基因組學大會的主題:Omics & Global Health(組學與人類健康)。
本屆ICG大會將持續至10月30日,在接下來幾天,放大燈團隊將持續跟進和記錄石正麗、張文宏等人的演講。歡迎讀者們關注!
References:
[1] 中國科學報:「搶發論文」?趙國屏院士:莫用隨意「推理」攻擊抗疫勇士
http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2020/1/435282.shtm
[2] Zhou, P., Yang, X., Wang, X. et al. A pneumonia outbreak associated with a new coronavirus of probable bat origin. Nature579, 270–273 (2020).
https://doi.org/10.1038/s41586-020-2012-7
[3] Time: The 100 Most Influential People of 2020
https://time.com/collection/100-most-influential-people-2020/5888191/zhang-yongzhen/