氨氮廢水處理有折點氯化法、化學沉澱法、離子交換法、吹脫法和生物脫氨法等多種方法，這些技術可分為物理化學法和生物脫氮技術兩大類。
微生物去除氨氮過程需經兩個階段。第一階段為硝化過程，亞硝化菌和硝化菌在有氧條件下將氨態氮轉化為亞硝態氮和硝態氮的過程。第二階段為反硝化過程，汙水中的硝態氮和亞硝態氮在無氧或低氧條件下，被反硝化菌(異養、自養微生物均有發現且種類很多)還原轉化為氮氣。在此過程中，有機物(甲醇、乙酸、葡萄糖等)作為電子供體被氧化而提供能量。常見的生物脫氮流程可以分為3類，分別是多級汙泥系統、單級汙泥系統和生物膜系統。
1.1多級汙泥系統
此流程可以得到相當好的BOD5去除效果和脫氮效果，其缺點是流程長、構築物多、基建費用高、需要外加碳源、運行費用高、出水中殘留一定量甲醇等。
1.2單級汙泥系統
單級汙泥系統的形式包括前置反硝化系統、後置反硝化系統及交替工作系統。前置反硝化的生物脫氮流程，通常稱為A/O流程與傳統的生物脫氮工藝流程相比，A/O工藝具有流程簡單、構築物少、基建費用低、不需外加碳源、出水水質高等優點。後置式反硝化系統，因為混合液缺乏有機物，一般還需要人工投加碳源，但脫氮的效果可高於前置式，理論上可接近100%的脫氮。交替工作的生物脫氮流程主要由兩個串聯池子組成，通過改換進水和出水的方向，兩個池子交替在缺氧和好氧的條件下運行。該系統本質上仍是A/O系統，但其利用交替工作的方式，避免了混合液的回流，因而脫氮效果優於一般A/O流程。其缺點是運行管理費用較高，且一般必須配置計算機控制自動作業系統。
1.3生物膜系統
將上述A/O系統中的缺氧池和好氧池改為固定生物膜反應器，即形成生物膜脫氮系統。此系統中應有混合液回流，但不需汙泥回流，在缺氧的好氧反應器中保存了適應於反硝化和好氧氧化及硝化反應的兩個汙泥系統。
物化除氮常用的物理化學方法有折點氯化法、化學沉澱法、離子交換法、吹脫法、液膜法、電滲析法和催化溼式氧化法等。
2.1折點氯化法
不連續點氯化法是氧化法處理氨氮廢水的一種，利用在水中的氨與氯反應生成氮氣而將水中氨去除的化學處理法。該方法還可以起到殺菌作用，同時使一部分有機物無機化，但經氯化處理後的出水中留有餘氯，還應進一步脫氯處理。
在含有氨的水中投加次氯酸HClO，當pH值在中性附近時，隨次氯酸的投加，逐步進行下述主要反應：
NH3+HClO→NH2Cl+H2O①
NH2Cl+HClO→NHCl2+H2O②
NH2Cl+NHCl2→N2+3H++3Cl-③
投加氯量和氨氮之比(簡稱Cl/N)在5.07以下時，首先進行①式反應，生成一氯胺(NH2Cl)，水中餘氯濃度增大，其後，隨著次氯酸投加量的增加，一氯胺按②式進行反應，生成二氯胺(NHCl2)，同時進行③式反應，水中的N呈N2被去除。
其結果是，水中的餘氯濃度隨Cl/N的增大而減小，當Cl/N比值達到某個數值以上時，因未反應而殘留的次氯酸(即游離餘氯)增多，水中殘留餘氯的濃度再次增大，這個最小值的點稱為不連續點(習慣稱為折點)。此時的Cl/N比按理論計算為7.6;廢水處理中因為氯與廢水中的有機物反應，C1/N比應比理論值7.6高些，通常為10。此外，當pH不在中性範圍時，酸性條件下多生成三氯胺，在鹼性條件下生成硝酸，脫氮效率降低。
在pH值為6～7、每mg氨氮氯投加量為10mg、接觸0.5～2.0h的情況下，氨氮的去除率為90%～100%。因此此法對低濃度氨氮廢水適用。
處理時所需的實際氯氣量取決於溫度、pH及氨氮濃度。氧化每mg氨氮有時需要9～10mg氯氣折點，氯化法處理後的出水在排放前一般需用活性炭或SO2進行反氯化，以除去水中殘餘的氯。雖然氯化法反應迅速，所需設備投資少，但液氯的安全使用和貯存要求高，且處理成本也較高。若用次氯酸或二氧化氯發生裝置代替液氯，會更安全且運行費用可以降低，目前國內的氯發生裝置的產氯量太小，且價格昂貴。因此氯化法一般適用於給水的處理，不太適合處理大水量高濃度的氨氮廢水。
2.2化學沉澱法
化學沉澱法是往水中投加某種化學藥劑，與水中的溶解性物質發生反應，生成難溶於水的鹽類，形成沉渣易去除，從而降低水中溶解性物質的含量。當在含有NH4+的廢水中加入PO43-和Mg2+離子時，會發生如下反應：
NH4++PO43-+Mg2+→MgNH4PO4↓④生成難溶於水的MgNH4PO4沉澱物，從而達到去除水中氨氮的目的。採用的常見沉澱劑是Mg(OH)2和H3PO4，適宜的pH值範圍為9.0～11，投加質量比H3PO4/Mg(OH)2為1.5～3.5。廢水中氨氮濃度小於900mg/L時，去除率在90%以上，沉澱物是一種很好的複合肥料。由於Mg(OH)2和H3PO4的價格比較貴，成本較高，處理高濃度氨氮廢水可行，但該法向廢水中加入了PO43-，易造成二次汙染。
2.3離子交換法
離子交換法的實質是不溶性離子化合物(離子交換劑)上的可交換離子與廢水中的其它同性離子的交換反應，是一種特殊的吸附過程，通常是可逆性化學吸附。沸石是一種天然離子交換物質，其價格遠低於陽離子交換樹脂，且對NH4+-N具有選擇性的吸附能
力，具有較高的陽離子交換容量，純絲光沸石和斜發沸石的陽離子交換容量平均為每100g相當於213和223mg物質的量(m.e)。但實際天然沸石中含有不純物質，所以純度較高的沸石交換容量每100g不大於200m.e，一般為100～150m.e。沸石作為離子交換劑，具有特殊的離子交換特性，對離子的選擇交換順序是：Cs(Ⅰ)>Rb(Ⅰ)>K(Ⅰ)>NH4+>Sr(Ⅰ)>Na(Ⅰ)>Ca(Ⅱ)>Fe(Ⅲ)>Al(Ⅲ)>Mg(Ⅱ)>Li(Ⅰ)。工程設計應用中，廢水pH值應調整到6～9，重金屬大體上沒有什麼
影響;鹼金屬、鹼土金屬中除Mg以外都有影響，尤其是Ca對沸石的離子交換能力影響比Na和K更大。沸石吸附飽和後必須進行再生，以採用再生液法為主，燃燒法很少用。再生液多採用NaOH和NaCl。由於廢水中含有Ca2+，致使沸石對氨的去除率呈不可逆性的降低，要考慮補充和更新。
2.4吹脫法
吹脫法是將廢水調節至鹼性，然後在汽提塔中通入空氣或蒸汽，通過氣液接觸將廢水中的游離氨吹脫至大氣中。通入蒸汽，可升高廢水溫度，從而提高一定pH值時被吹脫的氨的比率。用該法處理氨時，需考慮排放的游離氨總量應符合氨的大氣排放標準，以免造成二次汙染。低濃度廢水通常在常溫下用空氣吹脫，而煉鋼、石油化工、化肥、有機化工有色金屬冶煉等行業的高濃度廢水則常用蒸汽進行吹脫。
2.5液膜法
自從1986年黎念之發現乳狀液膜以來，液膜法得到了廣泛的研究。許多人認為液膜分離法有可能成為繼萃取法之後的第二代分離純化技術，尤其適用於低濃度金屬離子提純及廢水處理等過程。乳狀液膜法去除氨氮的機理是：氨態氮NH3-N易溶於膜相油相，它從膜相外高濃度的外側，通過膜相的擴散遷移，到達膜相內側與內相界面，與膜內相中的酸發生解脫反應，生成的NH4+不溶於油相而穩定在膜內相中，在膜內外兩側氨濃度差的推動下，氨分子不斷通過膜表面吸附、滲透擴散遷移至膜相內側解吸，從而達到分離去除氨氮的目的。
2.6電滲析法
電滲析是一種膜法分離技術，其利用施加在陰陽膜對之間的電壓去除水溶液中溶解的固體。在電滲析室的陰陽滲透膜之間施加直流電壓，當進水通過多對陰陽離子滲透膜時，銨離子及其他離子在施加電壓的影響下，通過膜而進入另一側的濃水中並在濃水中集，因而從進水中分離出來。