全世界愛科研的人,都關注我了
原創:Dan D. & Hayley R.
翻譯整理:一茗驚人
科學實驗中,養細胞怕是每個做生命科學實驗的研究生必須get的技能了。養細胞看似簡單易上手,師姐師兄僅需花3分鐘就可以把養細胞術傳授給師弟師妹,但很多人養了3年的細胞也沒整出個名堂。
大家知道嗎?在所有實驗室裡,大約有18-36%細胞株是錯誤識別或與另一個細胞系交叉汙染的。錯誤識別或交叉汙染的細胞株在雜誌和臨床試驗中已變成了非常不確定因素,以至於在發表之前常被要求進行再驗證。
幸運的是,有一個簡單的解決方案——STR分析,你可以輕鬆鑑定目前你的培養皿裡生長的是否還是當初的細胞株。
STR’s,或稱為短串聯重複序列,是一段短的DNA序列,它可以用來創建一個遺傳檔案。通過將我們質疑的樣本進行STR分析,並與該細胞系的參考數據進行比較,就可以確定我們的細胞系是否正確。STR分析的參考數據可在細胞存儲庫的網站獲取(比如https://www.atcc.org/services/testing_services/cell_authentication_testing_service/str_cell_authentication_frequently_asked_questions)。
有許多途徑可以幫你做細胞的STR分析。首先,找一家提供該服務的信譽良好的公司,然後收集一小部分細胞樣本,大多數外包實驗室可接受冷凍、新鮮或乾燥的細胞團塊或基因組DNA樣本。甚至還有更簡單的選擇,就直接把細胞點在信封裡,這樣也方便分析結果的寄回。最後,你可以選擇讓公司為你分析數據,也可以自己解析。
值得注意的是,STR分析僅適用於人源細胞系。有一些檢測機構有個別鼠源細胞標誌物,雖然他們沒有標明是何種鼠源細胞,但它至少可以確定鼠源細胞是否出現在不該出現的地方。
STR分析技術非常重要,因為僅僅是不斷傳代細胞系就能導致遺傳漂變和環境適應,以至於細胞不再是它們曾經的樣子。以下總結了需要鑑定你的細胞系的重要階段:
在建立細胞系鑑定的早期在開始一項新研究之前和在發表之前在凍存並建立一個新的工作庫之前當細胞系表現不符合預期時
為了支持對可重複性的承諾,CST多年前就引入了對細胞系的認證。客戶可以放心,我們的驗證工作已到細胞級別。
細胞系認證非常有必要,它可以讓你避免因細胞交叉汙染和錯誤識別使得你幾小時、幾個月甚至幾年的實驗結果被翻案,進而導致你的辛苦付之東流。要現在!立即!採取措施檢測你的細胞,不要等到你的研究無法重複或無法進展時才後悔莫及。
如果你仍然不相信這是一個嚴重的問題,test一下世界各地實驗室中正在生長的各種HeLa細胞,它們理論上應該是一樣的……但……你會驚奇地發現,並不是的!
五個注意事項,快收藏
確定了細胞株正確後,養好細胞則變得尤為重要。細胞養的好不好,直接決定你實驗結果是否可重複、可靠不可靠。這裡送你幾個小建議,有助於你在細胞培養之旅中避免時間浪費和細胞汙染。
工作檯整潔有序/Be organized
在您的細胞操作臺中,只能放處理你細胞的必備耗材或試劑。這包括細胞培養液、培養皿、離心管、移液槍、移液管、吹吸管、槍頭等。讓移液槍、移液管和培養液放在右手邊方便拿的位置,其他暫時用不到的東西推到最後面或者左手邊的位置。將所有物品放在距離操作區10-15cm外,並將材料分成兩組放在25-30cm外,這樣可以減少交叉汙染的可能性,同時也消除空氣波動造成的汙染。每次你的手或手臂經過打開瓶蓋的瓶子上方、細胞培養品或燒瓶上方時,空氣中就會有成千上萬的微粒在附近,這些微粒最終可能會進入你的培養皿,所以儘量保持緩慢、從容的操作。
做好充分準備/ Be prepared
當你解凍細胞時突然意識到還沒準備好細胞培養皿和培養液,簡直沒有什麼比這更糟糕的了,如果非要舉例,怕就是當同時解凍幾種細胞時突然發現你還沒正確地給細胞培養皿標記或貼標籤,手忙腳亂且容易出錯。所以做細胞實驗前,都要先想好流程,比如你要不要計數?要不要鋪12孔板?要不要加藥?要不要做梯度實驗?這一切都在實驗前想好並準備好,最好能放一本筆記本,記錄好你要做的事情,以便可以有條不紊的進行實驗的每一步操作。任何事先的準備都能減少在實驗室工作時出錯機率。
不要一口吃個大胖子/ Don’t stock pile
在同一時間、同一細胞操作臺,限定自己只處理一個細胞系。雖然看起來浪費了你多任務處理能力的機會,也降低了你的工作效率,但它大大降低了你的生物安全櫃中的汙染或犯錯的風險。
無菌是關鍵/Sterility is key
做實驗前,使用足夠的70%乙醇清潔您的細胞操作臺,當不確定用量時,越多越好。每個放進操作臺裡的東西,比如培養皿、移液槍和其他耗材,都應該用70%的乙醇徹底清洗消毒。記住這一點的一個方法是「噴進去,噴出去」。所有進出操作臺的東西——包括你戴著手套的手——都應該消毒。確保您沒有攜帶任何汙染物進入細胞操作臺的窗框。開始前和結束後都要把操作臺和窗框擦乾淨。通常,細胞操作臺是大家共用的,你不想上一位留給你的是髒髒的臺子,當然也不能去禍害下一位。
定期徹底清潔細胞操作臺,您的實驗室可能有一個清潔輪班表,操作臺中的通風系統需定期拆卸並徹底清潔,以保持你的操作空間不受汙染。
最後/Finally
不要著急!享受這個過程!這似乎是顯而易見的一點,但細胞有一個天生的「滯後期/遲滯期」。匆忙完成任何過程都可能導致錯誤,從而阻礙您的進度,這只會增加項目的進展難度。你需要時常關注你的細胞,太過匆忙的心態不會讓你的細胞養得很好。