1、南通市不動產登記中心
主要職責：受市自然資源和規劃局及市自然資源確權登記局委託，承擔市區（不含通州區）不動產登記事務工作。
內設機構：辦公室、組織人事科、財務科、法規科、受理科、審核科、登記發證科、產籍管理科、權籍調查科、質量監督科、信息技術科、土地評估科、交易服務科、崇川辦事處、港閘辦事處。
負 責 人：姜志清
通訊地址：南通市躍龍路32號
郵政編碼：226001
聯繫電話：0513-59009655
傳真號碼：0513-59009655
2、南通市土地儲備中心
主要職責：負責研究擬制有關土地儲備的政策措施，具體承辦土地儲備的各項業務；承擔編制土地儲備規劃和土地儲備年度計劃擬制工作；通過收回、收購、置換和徵收等方式實施土地儲備；承辦儲備土地出讓的前期準備工作；承辦市區國有土地使用權租賃（用）工作。內設機構：辦公室、計劃科、收儲科、資金科、資產科。
負 責 人：丁曉明 主任
通訊地址：南通市躍龍路32號
郵政編碼：226001
聯繫電話：0513-59009615
傳真號碼：0513-59009625
3、南通市自然資源監察支隊（中國海監南通市支隊、南通市林業執法支隊、南通市林業指導和檢疫防治站）
主要職責：
（一）貫徹落實國家、省有關自然資源工作的方針政策、決策部署及法律法規。對全市執行和遵守自然資源法律法規情況開展監督檢查。協助擬定全市自然資源執法監察工作制度並實施。
（二）受市自然資源和規劃局委託，開展全市自然資源重大違法案件的查處、督辦，負責國家、省交辦自然資源違法案件以及縣（市）區移送市級自然資源違法案件查處。組織實施全市耕地破壞程度等自然資源違法鑑定工作，做好自然資源行政執法與刑事司法銜接工作。
（三）受市自然資源和規劃局委託，查處市區土地違法違規案件。
（四）受市自然資源和規劃局委託，開展全市土地、礦產、海洋和林業衛片執法監督檢查工作，協助做好國家自然資源派駐地方督察機構對我市執法監督檢查的聯絡工作。
（五）受市自然資源和規劃局委託，開展全市自然資源執法監察動態巡查工作。
（六）受市自然資源和規劃局委託，組織、指導和監督全市林業有害生物監測、檢疫和防治，開展溼地、野生動物保護和林業技術推廣等工作。
（七）承擔全市自然資源執法監察隊伍建設、業務培訓及信息化建設工作，承擔全市自然資源執法監察相關績效考核及執法模範縣（市）區創建工作。
（八）負責涉及自然資源執法監察範圍內的信訪、舉報的處置工作。
（九）完成上級交辦的其他任務。
負 責 人：陸建新
通訊地址：南通市工農南路101號
郵政編碼：226008
聯繫電話：0513-59009601
傳真號碼：0513-59009601
4、南通市土地復墾開發整理中心
主要職責：參與全市耕地佔補平衡項目庫的立項、管理、指導、檢查和驗收；承擔耕地開墾費動作的具體工作，落實市區佔補平衡項目；參與對全市國家、省投資土地開發整理項目的申報和管理；對縣（市、區）做好基本農田保護工作進行業務指導；負責全市農用地後備資源調查，參與編制全市土地開發整理規劃；做好補佔用耕地耕作層的剝離管理；負責土地開發整理有關的政策、法律、信息諮詢服務工作。
負 責 人：張屹
通訊地址：南通市躍龍路32號
郵政編碼：226001
聯繫電話：0513-59009666
傳真號碼：0513-59009666
5、南通市土地徵收服務中心
主要職責：承擔統一徵地中的徵地調查、勘測定界、整理資料、政策諮詢、徵地批後實施等事務性、技術性、服務性工作；負責市區範圍內調集農村集體經濟組織成員資料庫，核准並安置失地農民，籌集並撥付安置資金；調查核實農用地臺帳；編制徵地報省一書四方案，參與組織徵收土地聽證會，擬制徵地預公告、徵收土地公告、徵用土地安置補償方案公告、徵地補償安置費用撥付到位的公告。
負 責 人：周志軍
通訊地址：南通市躍龍路32號
郵政編碼：226006
聯繫電話：0513-83511068
傳真號碼：0513-83511068
6、南通市自然資源和規劃信息中心
主要職責：
（一）負責制定全市自然資源和規劃系統信息化建設總體規劃。
（二）負責制定全市自然資源和規劃系統應用軟體、電子數據、網絡安全等方面的規範和制度。
（三）負責全市自然資源和規劃系統各類業務應用、綜合事務處理、監測監管、政務服務和輔助決策等系統的開發建設和維護管理工作。
（四）負責市自然資源和規劃局各類公共業務電子數據和電子檔案的歸集、存儲、更新、維護、共享與管理工作。
（五）負責組織建設市、縣、鄉三級自然資源主幹網，承擔市自然資源和規劃局機關硬體、網絡及安全防護設施的建設與維護工作。
（六）負責市自然資源和規劃局機關網站、移動新媒體等各類政務信息公開平臺的建設、技術支撐和維護工作。
（七）負責全市自然資源和規劃系統信息化培訓工作。
（八）對各縣（市）區局、分局和所屬事業單位的信息化建設提供技術指導。
（九）完成上級交辦的其他任務。
負 責 人：陳繼忠
通訊地址：南通市工農南路101號
郵政編碼：226008
聯繫電話：0513-59009569
傳真號碼：0513-59009570
7、南通市規劃編制研究中心
主要職責：
1、負責南通市城市化、城鄉一體化和城市規劃的中長期發展戰略研究；
2、負責南通市域城鎮體系規劃、總體規劃、分區規劃、詳細規劃、村鎮規劃及專項規劃的編制研究；
3、負責城市空間結構及重點節點、重點地區的規劃研究；
4、負責南通市重大項目選址的規劃研究與諮詢服務；
5、負責的各類詳規、重要單體設計方案的技術評審組織；
6、承擔各類規劃設計要點的前期研究及編制任務；
7、承擔城市經營土地等控制性詳規的編制工作；
8、承擔各類規劃技術服務工作。
負 責 人：莊曉捷
通訊地址：南通市工農南路101號
郵政編碼：226008
聯繫電話：0513-59009805
8、南通城市博物館
主要職責：
1、收集、整理和展示南通城市規劃和建設的歷史資料、現有規劃方案；
2、向公眾公示規劃方案，徵集公眾意見；
3、開展規劃方案論證、評審和評議；
4、與國內外城市開展規劃技術交流,與國內外同行開展展品互換展示。
負 責 人：吳亞琴 副館長（主持工作）
通訊地址：南通市環城南路1號
郵政編碼：226001
聯繫電話：0513-85158188
9、南通市海洋監測服務中心
主要職責：
（一）負責全市海域使用動態的監視監測，做好用海分析與評價，編制監視監測報告。
（二）開展全市海岸線動態巡查，掌握海岸線保護與利用現狀，編制海岸線巡查報告和圖集。
（三）負責全市用海項目審核、海域動態評價與決策的技術支持。
（四）承擔全市海洋經濟運行監測與評估工作，負責全市海洋經濟統計、核算與信息發布。
（五）承擔市級海洋站和觀測點的建設，指導全市海洋監測網和預警報能力建設。
（六）統籌協調全市海洋水文、氣象等觀測工作，負責市級海洋預報和海洋災害預警報等信息發布。
（七）完成上級交辦的其他任務。
負 責 人：簡慧蘭
通訊地址：南通市躍龍路32號
郵政編碼：226008
聯繫電話：59003259
10、南通市自然資源會計服務中心
主要職責：
（一）對市自然資源和規劃系統所屬單位實施會計人員委派，組織開展會計集中核算、代理記帳、財務業務諮詢與培訓。
（二）協助市自然資源和規劃系統所屬單位重大項目資金管理，組織收支核算，保障項目資金運行。
（三）參與市自然資源和規劃系統所屬單位內部控制制度建設，協助編制內部控制報告。
（四）執行國有資產管理規定，做好資產實時更新管理。
（五）協助做好市自然資源和規劃系統所屬單位非稅收入徵收工作。
（六）協助市自然資源和規劃系統所屬單位編制部門預決算報告及財務報告，協助組織預算指標的申請與調整，配合做好部門預決算公開，指導部門預算執行。
（七）定期編制市自然資源和規劃系統所屬單位的財務分析報告，提出財務管理建議。
（八）參與對市自然資源和規劃系統所屬單位的內部審計及其他專項審計。
（九）完成上級交辦的其他任務。
負 責 人：李元芬
通訊地址：南通市工農南路101號
郵政編碼：226008
聯繫電話：0513-59009577
傳真號碼：0513-59009577