施一公:低年級研究生應該如何讀英文文獻?

2020-12-05 中國生物技術網

本文轉載自施一公科學網博客,作者施一公

序:此文針對本科生和一、二年級的博士、碩士生,對高年級的博士生和博士後也應該有參考價值。

從小到大,我感性思維多一些,不善於讀書。85至89年在清華生物系讀本科期間,從未讀過任何一種英文專業期刊。我受到的與英文閱讀相關的訓練一共只有兩個。

一是我在1986年暑假期間選修的時任系主任的蒲慕明老師開設的《生物英語》系列講座,隱隱約約記得蒲先生讓我們閱讀一些諸如DNA雙螺旋發現之類的科普性英文文章,很有意思。但時間較短,暑假過後也沒有養成讀英文文章的習慣。

二是《生物化學》這門課。與現在的清華生命學院形成鮮明對比,我上大學期間的所有基礎課和專業課都是採用中文教材、中文講課,只有鄭昌學老師講授的《生物化學》採用了Lehninger的《Principles of Biochemistry》,而且鄭老師要求我們每個學生每次課後閱讀10-20頁教材。我們同學大多感覺到專業英文閱讀有所提高。

1990年4月至7月初,我在依阿華州Ames小鎮的Iowa State University度過了初到美國的前三個月,其中大部分時間在Herbert Fromm教授的實驗室做輪轉(rotation),跟隨劉峰和董群夫妻兩人做研究(劉峰現在University of Texas Health Science Center做教授)。當時感覺最困難的就是讀專業論文。有一次,Fromm教授要求我在組會上講解一篇《Journal of Biological Chemistry》的文章,我提前兩天開始閱讀,第一遍花了足足六個小時,許多生詞只能依靠英漢詞典,文章中的有些關鍵內容還沒有完全讀懂,當時的感覺是JBC的文章怎麼這麼長、這麼難懂?!真有點苦不堪言。為了能給Fromm教授和師兄師姐留下好印象,第二天又花了好幾個小時讀第二遍,還做了總結。第三天我在組會上的表現總算沒有給清華丟臉。但是,前前後後,真搞不清楚自己為了這一篇文章到底花了多少時間!

90年7月我轉學到約翰霍普金斯大學以後,與本科來自北大的虞一華同在IPMB program。虞一華大我一歲,來巴爾地摩之前已經在夏威夷大學讀了一年的研究生,對於科研論文的閱讀比我強多了。他常常在IPMB的辦公室裡拿著《科學》和《自然》周刊津津有味地閱讀,看得我很眼饞,也不理解其中那些枯燥的文章有什麼意思。他告訴我:他在讀很有意思的科學新聞。科學新聞能有什麼意思?虞一華給我講了好幾個故事:洛克菲勒大學校長諾貝爾獎得主David Baltimore如何深陷泥潭、人類基因組測序如何爭辯激烈、HIV病毒究竟是誰發現的等等。我還真沒有想到學術期刊上會有這麼多我也應該看得懂的內容!

從那時起,每一期新的《科學》和《自然》一到,我也開始嘗試著閱讀裡面的新聞和研究進展介紹,這些內容往往出現在「News & Comment」「Research News」「News & Views」「Perspectives」等欄目,文筆平實,相對於專業的科研論文很容易讀懂。有時,我還把讀到的科研新聞講給我的同事朋友們聽,而同事的提問和互動對我又是更好的鼓勵。除了《科學》和《自然》,我也常常翻看《科學美國人》(「Scientific American」)。

與《細胞》(Cell)、《生物化學期刊》(JBC)等非常專業的期刊不同,《科學》和《自然》裡面有相當一部分內容是用來做科普教育的。《科學》周刊的「Perspectives」和《自然》周刊的「News & Views」欄目都是對重要科學論文的深入淺出的介紹,一般1-3頁,讀起來比較通俗易懂,較易入門。讀完這些文章後,再讀原始的科學論文,感覺好多了!而且可以把自己的體會與專家的分析比較一下,找找差距,有時甚至也能找回來一點自信!

從1998年在普林斯頓大學任職到現在清華大學做教授,我總是告訴自己實驗室的所有年輕人(包括本科生、碩士生、博士生、博士後)下面這幾點讀科研論文的體會,也希望我的學生跟我學:

1.請每位學生每周關注《科學》和《自然》。(生命科學界的學生還應該留心《細胞》)。如果時間有限,每周花一個小時讀讀這兩種周刊裡的文章標題以及與自己研究領域相關的科研論文的abstract,即可!這樣做可以保證一個學生基本上能夠跟蹤本領域最重要的發現和進展,同時開闊視野,大概知道其它領域的動態。2.在時間充足的情況下,可以細讀《科學》和《自然》裡的新聞及科研論文。如果該科研論文有「News & Views」或「Perspectives」來介紹,請先讀這些文章,這類導讀的文章會提煉問題,就好比是老師事先給學生講解一番論文的來龍去脈,對學生閱讀原始論文有很大幫助。3.在讀具體的科研論文時,最重要的是了解文章的主線邏輯。文章中的所有Figures都是按照這個主線邏輯展開描述的。所以,我一般先讀「introduction」部分,然後很快地看一遍Figures。大概知道這條主線之後,才一字一句地去讀「results」和「discussion」。4.當遇到一些實驗或結果分析很晦澀難懂時,不必花太多時間深究,而力求一氣把文章讀完。也許你的問題在後面的內容中自然就有解答。這與聽學術講座非常相似!你如果想每個細節都聽懂,留心每一個技術細節,那你聽學術講座不僅會很累,而且也許會為了深究一個小技術環節而影響了對整個講座邏輯推理及核心結論的理解。5.對個別重要的文章和自己領域內的科研論文,應該精讀。對與自己課題相關的每一篇論文則必須字斟句酌地讀。這些論文,不僅要完全讀懂,理解每一個實驗的細節、分析、結論,還必須聯想到這些實驗和結論對自己的課題的影響和啟發,提出自己的觀點。6.科學論文的閱讀水平是循序漸進的。每個人開始都會很吃力,所以你有這種感覺不要氣餒。堅持很重要,你一定會漸入佳境。當你有問題時或有絕妙分析時,應該與師兄師姐或找導師討論。7.科研訓練的一個重要組成部分就是科研論文的閱讀。每一個博士生必須經過嚴格的科研論文閱讀的訓練。除了你自己的習慣性閱讀外,你應該在研究生階段選修以閱讀分析專業文獻為主的一至兩門課,在實驗室內也要有定期的科研論文討論(Journal Club)。如果你的實驗室還沒有這種討論,你們學生可以自發地組織起來。8.前面幾條都是討論如何提高科研論文的閱讀能力,但是一旦入了門,就要學會critical reading。不要迷信已發表的論文,哪怕是發表在非常好的期刊上。要時刻提醒自己:該論文邏輯是否嚴謹,數據是否可靠,實驗證據是否支持結論,你是否能想出更好的實驗,你是否可以在此論文的基礎上提出新的重要問題?等等。

天外有天,讀科研論文是一件很簡單、但也很深奧的事情。一般的學生常常滿足於讀懂、讀透一篇好的論文,優秀的學生則會舉一反三、通過查找references縱深了解整個領域的歷史、現狀,並展望該領域未來的可能進展。

我從1990年對學術論文一竅不通到96年博士後期間的得心應手,還常常幫助同事分析,自以為水平了得。但是有一件事讓我看到了自己的嚴重不足,頗為羞愧。1996年,是SMAD蛋白發現及TGF-b信號轉導研究的最激動人心的一年,哈佛醫學院的Whitman實驗室在十月份的《自然》雜誌上以「Article」的形式發表了一篇名為「A transcriptional partner for MAD proteins in TGF-b signaling」的文章。讀完之後,正好遇到TGF-b領域的著名學者Joan Massague,我對Joan評論說:

I’m not so sure why this paper deserves a full article in Nature. They just identified another Smad-interacting protein, and the data quality is mediocre.

完全出乎我的意料,Joan馬上回應我:

I disagree! This paper links the cytoplasmic Smad protein into the nucleus and identifies a transcription factor as its interacting protein. Now the TGF-b signaling pathway is complete. It is a beautiful Nature article!

這件事對我觸動極大:原來大師的視野和品位遠遠在我之上。從那以後,我也開始從整個領域的發展方面來權衡一篇文章的重要性,這件事對我今後為國際重要學術期刊審稿、自己實驗室選擇研究課題都起到了相當重要的作用。

如今,我閱讀一篇本領域內的科研論文,非常順利,而且常常可以看出一些作者沒有想到或分析到的關鍵點。回想從前,感慨萬千,感謝蒲慕明、鄭昌學、虞一華、John Desjarlais、Jeremy Berg、Joan Massague等一批老師和同事對我的幫助。我很留心,也很用心。

希望所有的學生也能通過努力和堅持對英文科研論文的閱讀得心應手!

相關焦點

  • 施一公:學生如何提高專業英文閱讀能力?
    此文針對本科生和一、二年級的博士、碩士生,對高年級的博士生和博士後也應該有參考價值。從小到大,我感性思維多一些,不善於讀書。1985至1989年在清華生物系讀本科期間,從未讀過任何一種英文專業期刊。我受到的與英文閱讀相關的訓練一共只有兩個。
  • 施一公:從迷茫的研究生到優秀的科學家
    一名優秀的研究生應該有「脾氣」26日上午,城關校區西區大學生活動中心禮堂裡座無虛席,掌聲頻起,不少師生站著聽完了講座。施一公以《從迷茫的研究生到優秀的科學家》為題,與在場師生交流分享了自己的經歷和體會。
  • 如何提高英語閱讀和寫作能力?清華施一公有獨門之法
    如何提高英語閱讀和寫作能力?一直是困擾同學們的一大難題,我今天分享清華原副校長、西湖大學校長施一公教授獨特方法,他堅持做了幾年,效果非常明顯。建議大家看看。,他的英文閱讀和寫作能力能超過90%的人,這份自信源於平常的積累和練習。
  • 施一公:如何成為一名優秀的博士生?
    近日,研究生新生已開始陸續開學,很多同學問:如何成為一名優秀的博士生?對這個問題,施一公院士曾進行深入的思考,他結合自己的親身經歷,專門寫了兩篇長篇博文進行總結,樸實精闢,流傳甚廣,得到很多導師及學長學姐們的極力推薦,以下為完整版,分享給大家。
  • 如何閱讀一篇英文文獻?
    對於大四寫畢業論文的學生以及研究生來說,查閱大量的英文文獻是非常有必要的。曾經我也不愛看英文文獻,看不懂,看不進去,直到後來寫畢業論文,10分鐘看完一篇,一宿查閱完四五十篇英文文獻並且撰寫緒論引用文獻,慢慢地掌握了閱讀英文文獻的方法。為什麼看不進去英文文獻?剛上研究生的時候,導師的要求是每周至少精讀一篇英文文獻。
  • 研究生怎麼做?才能在學校期間有所收穫?看看施一公如何建議
    小編今天要和大家討論一下關於研究生的問題,讀研其實是挺不容易的。研究生到底該怎麼做,才能在讀研期間有所收穫?我們一起來看看施一公給出什麼樣的建議!不止如此,前幾年每年研究生報考的時候,選擇學術型碩士的考生還很多,但是近幾年的研究生報考,選擇專業學位碩士的人數逐漸增加,甚至超過了選擇學術型碩士的人數。如今已經到了12月份,距離2021年的研究生考試只剩不到一個月的時間,不知道備戰2021年研究生考試的考生們準備的如何了?
  • 施一公:如何提高英文科研寫作能力?六點建議送給大家
    本文原發表在施一公的科學網博客,原標題:如何提高英文科研寫作能力?原本英語也很差的著名的科學家施一公院士,在文中總結了自己十幾年來寫作英文科研文章經驗心得,並給出了6點具體的建議。
  • 看到英文文獻就頭痛,如何克服文獻閱讀中的語言障礙?
    下圖為本文的思維導圖:Emmmm,每次提到英文文獻閱讀,不知道大家是什麼感覺,反正榮格格是倒吸了一口冷氣,因為看到這堆蛛蛛爬的東西,就感覺人生頓時迷茫了。找到文章重點是真的很難!雖然我也聽到過好多理論,說文章一定不要全篇讀完,應該迅速找到文章的重點,可是真的沒人告訴我怎麼做啊,我做不到啊啊啊啊。
  • 一起讀文獻 | 科研小白如何檢索英文文獻
    當你對某個研究問題PICO中各個要素的英文檢索詞所知甚少時,可以先檢索相關中文文獻,查看其摘要下方的key words(關鍵詞),或是看其參考文獻清單中的英文文獻,從這兩方面入手都可以迅速找到一些英文詞彙,你可以通過這個方法檢索出一些相關英文文獻,但這樣檢索出來的文獻特異性並不高。在檢索文獻時,一般聯合使用主題詞和關鍵詞。
  • 如何閱讀文獻、整理文獻綜述?通讀文章前你需要準備這些
    閱讀文獻,整理文獻綜述可以說是每一個學寫論文的研究生必不可少的技能,那麼,到底應該怎麼讀文獻呢?看看下面的技巧能不能幫到你~一、選擇高質量的文獻現在,很多資料庫都對我們開放,檢索文獻變得十分方便。但是文獻的質量良莠不齊,那怎麼選擇查找質量相對較高的文獻呢?在檢索時,縮小範圍。
  • 研究生英文論文發表之路如何開啟?
    儘管有越來越多的呼聲要求不能硬性規定研究生必須發表論文,但筆者認為,發表論文只是一種形式,背後所包含的能力和素質訓練絕對是必要的,比如文獻閱讀和總結的能力、發現科學問題的能力、語言表達能力、組織材料的能力、邏輯思維能力、學術規範的訓練等。所以應該辯證地看待論文的作用,不宜過分誇大,或者簡單機械地根據論文數量和刊物級別進行評價,但也不能一概而論,全面否定。
  • 清華超級學霸每周讀3000頁英文文獻?知乎網友集體質疑
    除了集體膜拜學習學霸之外,也有人開始質疑答辯會裡的一個小細節:現場有一位清華大學人文學院主修歷史的候選人,宣稱自己每周英文文獻閱讀量超過3000頁。清華大學官方微信推送一開始是微博上有人質疑,這有點誇張。之後關於每周讀3000頁英文文獻是否可能的討論,登上了知乎熱榜前三。這個話題為什麼會引起爭議?讓我們從頭來捋一捋。
  • 隔離在家中研究生們如何全面提升科研實力?
    研究生們如何「宅」在家裡搞好科研國家空間中心李暉研究員一站式分享基礎科研的十八般兵器當前,新型冠狀病毒感染肺炎的疫情防控工作正處於關鍵時期。為了幫助中國科學院大學的研究生們(尤其是低年級研究生)更好的「宅」在家裡搞好科研,本文將一站式回顧基礎科研的基本流程,從自身體會出發分享各個階段用到的十八般兵器,以期提升科研效率。希望大家利用好這段寶貴時光,精通各式兵器,修煉科研內功,用知識武裝頭腦,以科研報效國家。
  • 研究生文獻綜述應該這樣寫
    對於研究生論文來講,論文的內容上面是有著比較高的要求的,畢竟對學術水平要求會比較高,所以好的研究生論文是有著一定的可參考的學術價值。因此,研究生論文寫作是整個專業學習的最終的課題研究總結,同學們必須要認真的準備和撰寫。這次,我們就研究生文獻綜述該如何寫的問題一起來探討一下。
  • 如何快速高效率閱讀高檔次SCI英文論文?
    研究生和科技工作者閱讀文獻是一項基本工作內容。特別是剛入學的研究生面對英文文獻不知如何下手,下手了,讀了半天也不知所云。主要還是沒有掌握好方法。接下來就應該完成的事是對文章進行精讀,吸取精華。二、精讀文章獲取精華1.文章的introductionIntroduction一般包含以下部分內容。
  • 閱讀文獻克服三大問題:坐不住、記不住、想不開!
    想像自己看文獻的能力提高之後,可以津津有味地閱讀Science,Nature(參見施一公老師博文《學生如何提高專業英文閱讀能力》點擊標題即可查看),輕鬆愉快地獲取科研信息,提高科研水平,享受科研。這樣的想像也可以增強興趣。第六,用想像力增強看文獻的興趣。文獻的內容雖然是死的,但是可以把它想像成活的東西,可以對它編故事。
  • 常用基金用英文應該如何表述?
    輕鬆科研 | 趣讀文獻 | 前沿資訊 | 實用技巧距離2017年項目申請書開始提交已經只剩兩個月多一點了,申請指南也即將公布
  • 【畢業論文】【研究生】如何下載國外碩博士論文
    【技巧】如何隨心所欲下載外文文獻/書籍【經驗分享】如何應對朋輩壓力顏寧:講講如何記實驗記錄科研方法 |
  • 施一公教授:我是如何提高英文的科研寫作能力的
    初到美國之時,對英文環境適應得很差,讀一篇JBC的文章要五、六個小時,還常常不理解其中一些關鍵詞句的意思,心裡壓力極大。 很幸運,我在約翰霍普金斯大學(Johns Hopkins University)攻讀博士學位時,1991年4月遇到了學兄和啟蒙老師John Desjarlais。
  • 英國留學讀研究生預科你了解嗎?
    反觀那些就讀過國際預科課程的學生,其入讀主課後的適應性和通過率遠遠要高於沒有上過預科的學生。到底是什麼原因呢?讓我們通過就讀過英國碩士預科學生的真實體驗來了解一下。什麼是碩士預科?讀完這個就可以直接讀碩士了嗎?研究生預科課程主要包括兩方面內容:一是英語的進一步提高;二是專業課的適應課程。