十幾年前,Jim Carrey主演過一部喜劇電影《冒牌天神》(Bruce Almighty)。在劇中,不停抱怨命運不公的主角布魯斯突然被允許做一天無所不能的「上帝」,負責管理整個世界的運行。很快,布魯斯就被寫著所有人願望的便利貼淹沒了。
圖片來源:《冒牌天神》
不得不說,布魯斯在劇中領到的這個任務可能只算得上是「上帝簡單模式」。如果想要給布魯斯一些真正的考驗,不如把他的任務推回到生命起源的階段,畢竟生命的那些最初時刻才是最神秘、最吸引人的。(當然,電影也可能就成了一部科幻片。)
雖然電影和故事只是一種虛構和暢想。但不可否認,生命的起源和早期進化一直是現代科學中最受關注的大問題之一。想要了解生命的起源,必須找到許多問題的答案,從生命起源的天體物理和行星背景,到前生命化學越來越複雜的發展,到第一批細胞的組裝,再到達爾文進化論中的進化以及後來越來越複雜的生命形式的出現。
生命起源和早期進化的大致「時間軸」(橫軸時間單位:十億年)。| 圖片設計:雯雯子;參考來源:《進化》
目前,我們已經對生命起源和早期進化的大致時間軸有了一定了解。主流學說認為,地球被認為在大約45億年前形成,而生命很有可能起源於地球最後的主要增長階段(約40億年前)和最早的已知化學化石形成(約38億年前)之間的2億年中。
在過去的半個多世紀裡,有關生命起源的研究蓬勃發展。但科學的進程從來不是直線發展的,其中有一些關鍵發現突破了我們的認知,也有一些發現顛覆了以往的觀點,但它們的共同之處在於,它們都讓我們越來越靠近生命的開端。
時間:1953年
代表論文:A Production of Amino Acids Under Possible Primitive Earth Conditions
代表科學家:Stanley L. Miller et al.
可以這麼說,現代對生命起源的研究始於1953年。那一年,諾貝爾化學獎得主、化學家Harold Urey的博士生Stanley L. Miller進行了迄今為止最著名的生物發生實驗,改變了人們對前生命合成的看法。
生物發生的第一步,首先需要大量「零件」,這是最容易理解的一步。這些零件包括胺基酸、脂類、糖等等分子。Miller設計了一個簡潔的儀器來模擬早期地球環境。沸水代表著冥古宙的海洋,簡單的氣體混合物模擬著地球原始的大氣,電火花則模擬了閃電。在這種條件下,僅僅幾天後,密封儀器中無色的水就變了顏色,其中開始含有許多複雜的有機分子混合物。原本透明的玻璃變得汙跡斑斑,沾滿了粘稠的黑色有機汙泥。
Miller-Urey實驗裝置簡單示意圖。| 圖片來源:Wikicommons
Miller對這些化合物進行了分析,發現其中含有豐富的胺基酸等物質。隨後,科學家在相似的條件中創造了一系列有機分子,這些實驗確鑿地表明,早期地球一定富含著生命的基本分子。這類實驗成功建立起了一種範式,將生命的起源追溯到這樣一種「原始湯」中,仿佛就是達爾文筆下的那個「溫暖的小池塘」。
時間:1977年
代表論文:Clustering of Suspension-Feeding Macrobenthos Near Abyssal Hydrothermal Vents at Oceanic Spreading Centers
代表科學家:Peter Lonsdale et al.
事實上,一些科學家認為,1953年的實驗在某種程度上來說是「過於成功」,以至於不少專家曾一度認為,生命起源之謎已經基本被解開了。米勒的影響力一直很大,許多「米勒派」的科學家相信,閃電帶來了「原始湯」,生命就是從這樣的環境中誕生。
但答案顯然沒有那麼簡單。很快,新的發現似乎為生命誕生提供了另一種方案。
全球海底熱液活動區的大致分布圖。| 圖片來源:Wikicommons
20世紀七八十年代,科學家在不見天日的深海海底,發現了充滿生命的「黑煙囪」生態系統。這裡富含礦物質的流體與熾熱的火山地殼相互作用,形成噴口。這些噴口噴出的熱流接觸冰冷的海水時,會產生礦物沉澱,就好像冒著黑煙的大煙囪。在化學能的推動下,生命在這種不見陽光、遠離地球表面的地方蓬勃發展。
現在我們已經知道,這些「煙囪」廣泛地分布在海底,噴口附近的生態系統豐富多彩。人們也越來越意識到,在各種極端環境中,無論在酸性的池塘,還是沸騰的火山附近,或是冰凍的極地巖層中,生命比我們想像的更頑強和豐富,許多微生物甚至依賴來自礦物的微弱化學能就可以生存。一些科學家因此提出,為什麼一定要假設生命就誕生於「溫暖的小池塘」呢?事實上,生命的「零件」散落在宇宙的各個角落。
時間:1982年
代表論文:Self-Splicing RNA: Autoexcision and Autocuclization of the Ribosomal RNA Intervening Sequence of Tetrahymena
代表科學家:Thomas Cech et al.
在對生命早期演化的研究中,長期以來隱藏著一個「先有雞還是先有蛋」的問題。
現如今,所有細胞生物都在使用DNA作為遺傳物質,DNA攜帶的遺傳信息能構造出蛋白質,從而實現生物的功能。DNA編碼著合成蛋白質的信息,而DNA的複製又需要蛋白質的催化——那麼,哪個先出現的?在生命的早期,是如何發展出這樣複雜而完整的閉環的呢?
20世紀60年代,Francis Crick提出了一種可能的猜想,其中的關鍵就是RNA。在生命早期,RNA可能同時作為信息的載體和催化劑。這樣的猜想不無道理,RNA與DNA很相似,它們同樣可以承載遺傳信息,但結構比DNA更簡單,似乎帶著更多「原始」的影子。
在不久之後,一些關鍵的線索出現了。1978年,Sidney Altman首次發現RNA在一種催化反應中是必需的。1982年,Thomas Cech首次證明RNA分子本身可以起到催化作用。Cech把一個未經處理的RNA分子放入沒有蛋白質的試管中後,它開始了自我剪接。也就是說,RNA分子可以將自身切成碎片,並將遺傳上重要的RNA片段重新連接在一起。目前,已知的RNA酶(也叫核酶)已有百種。Altman和Cech也因此被授予1989年諾貝爾化學獎。
這些證據有可能指向,在生命早期很有可能是一個RNA世界。那時,RNA是唯一的編碼分子,它們隨後在自我複製中進化出了更為穩定DNA分子,並讓生命邁入了蛋白質世界。但這段故事的細節目前仍然很模糊,畢竟生命分子很難留下動植物那樣的化石線索。現在,還有許多研究都在追尋這種從RNA到DNA的變化是如何產生的,並希望找到最古老蛋白質的線索。
時間:1999年
代表論文:2-Methyhopanoids as biomarkers for cyanobacterial oxygenic photosynthesis
代表科學家:Roger E. Summons et al.
在探索生命起源的研究中,還有一些化合物被作為「分子標記」。比如,如果某一類化合物在活細胞之外很少出現,而在特定巖層中找到了它們的蹤跡,就可以被看作是一種有說服力的生命證據。
藿烷類化合物在穩定細胞膜方面具有重要作用。| 圖片來源:Wikicommons
藿烷類化合物(Hopanoids)就屬於這樣一類有機物。每個藿烷都有一個獨特的骨架,藿烷類化合物在穩定保護性的細胞膜方面發揮著重要作用,這類物質可能是所有分子生物標記物中最具說服力的之一。
1999年,Roger Summons和團隊在西澳大利亞25億年前的黑色頁巖中發現了藿烷分子變體。這裡的巖石几乎沒有受到過熱量的改變,也沒有受到地表生物或者地下水的汙染,因此有可能讓古老的生物分子保留下來。這些被稱為2-甲基藿烷(2-Methyhopanoid)的分子只在光合藍藻中被發現,而藍藻是古地球上最主要的氧氣製造者。
Summons認為,地球上的光合作用在25億年前就開始了。這個年代與當時已知的氧氣的增加是一致的。這項研究也為古生物學開闢了新的道路,科學家可以在保存下來的分子碎片中尋找光合作用的起源。
但對持懷疑態度的人來說,儘管樣本所在的巖層條件優越,但汙染仍會是個大問題。藿烷類化合物在地球上四處都是,在如此長久的地球歷史中,我們並不能確定這些藿烷究竟是何時以何種方式到達那裡的。
在生命起源的研究中有太多不確定性,因此類似的爭論比比皆是,它們雖然看起來激烈,甚至針鋒相對,但也總是很有趣,總能帶來新的發現。
生命的起源只是第一步,非生命系統產生原始的生命形式,隨後演化出成生物個體,並最終在地球上步入自然選擇驅動的進化和多樣化的軌道。這個過程經歷了數十億年,相關的研究自然也不是幾篇論文就能囊括。也許有一天,我們或許能用一個更完整、更可靠的故事,最終回答生命起源的問題。但這個答案中的每一個字、每一句話的背後,一定都包含了無數的爭論、推翻與重建。
本文轉載自公眾號「原理」(ID:principia1687)