Hortic Res 綜述 | 八倍體草莓的研究路線圖

栽培草莓（Fragaria×ananassa）是一種異源八倍體物種，馴化於近300年前來自美洲的野生祖先。從那時起，草莓已成為世界上種植最廣泛的水果作物，並由於其感官品質和健康益處而廣受歡迎。第一個高質量的染色體規模的八倍體草莓基因組（品種為Camarosa）的最新報導正在推動遺傳學的快速發展，激發科學辯論並引發新的研究問題。

來自美國佛羅裡達大學的Vance M. Whitaker和來自美國加州大學戴維斯分校的合作者一道，已在Horticulture Research發表了題為A roadmap for research in octoploid strawberry的前瞻性綜述文章。該文提出了研究途徑，以尋求新的生物學見解並將其應用於農業。文章概述了包括基因組的起源、遺傳變異的表徵以及大數據育種方法。草莓分子生物學研究的關鍵領域將包括控制開花、果實發育、果實品質以及植物與病原體的相互作用。作者提出，為了實現作為全球社區的潛力，必須不斷增加對基因組資源的投資。

圖1：草莓開花和匍匐莖的分子機制

圖2：草莓未來研究的路線圖

栽培草莓的第一個高質量染色體級組裝是未來激動人心的研究路線圖的起點。關於八倍體基因組起源的爭論將繼續。同時，新的「FanaSNP」陣列將促進遺傳和育種方面的進步，包括增加DNA檢驗的可用性。作者期望對複雜性狀的基因組預測的使用將迅速增加，與對草莓陣列基因分型的質量提高和預測方法的進步成正比。基因功能的基礎研究將加速許多表型生物學的發現，尤其是果實發育、果實品質和植物與病原體相互作用的性狀。特別是，在了解芳香族揮發性化合物的生物合成方面的進展可以幫助選育更美味的草莓的基礎。最激動人心的前景之一是八倍體全基因組的開發，該基因組揭示了栽培草莓及其直接祖先的表型變異潛在的DNA變異。為了最大限度地利用這些機會，至關重要的是草莓研究社區必須繼續在薔薇科的基因組資料庫和其他合作基因組資源中進行投資，並在全球範圍內努力。

文章連結：

https://www.nature.com/articles/s41438-020-0252-1

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關於園藝研究

Horticulture Research 是由南京農業大學與自然出版集團（現Springer Nature）合作創辦的英文期刊，是Nature旗下唯一的園藝領域專刊。所有關於園藝作物的基礎和理論研究都可以投稿。Horticulture Research 科睿唯安JCR2019影響因子：5.404，位於園藝一區（第1/36名），植物科學一區（第16/234名），遺傳學一區（第24/177名）。2019年中科院期刊分區（基礎版）：位於園藝小類一區，植物科學小類一區，農林科學大類一區（Top期刊）。