揭秘英國變異病毒的真相

2020-12-24 李雷博士

新冠病毒在英國變異後傳播力高出 70%,這到底該怎麼防範?變種病毒會導致更高的死亡率嗎?

下面來說一下這個新病毒株到底是什麼東東。

之前已經發現了該變異可以導致新冠傳染性加強,但是致病性變化方面尚無證據。

一不小心寫的太晦澀了,大家酌情食用吧。

新病毒株是N501Y,是指在蛋白編碼區的501位,由天冬醯胺(Asparagine,N) 突變成了酪氨酸 (Tyrosine,Y)。

這個毒株的關鍵變異,在今年5月份的時候我國科學家就研究過了(後來發到了9月的science上了)。

當時的結論就是這個變異會增強傳染~~~

In sum, these data indicate that the increased infectivity by adapted SARS-CoV-2 (MASCp6) in mice might be due to the enhanced binding affinity between its mutant RBD containing N501Y mutation and mACE2 receptor

如圖,所示位置是N501的位置,新冠的23603位置,鹼基由A變成了T,最後導致胺基酸由N變成了Y。

而這個位置,是新冠的S蛋白,也就是大家熟知的新冠用來結合細胞ACE2受體所在的位置。

眾所周知,對於突變來說,總是要實現效果的,一般情況下,密碼子有簡併性,意思就是一個胺基酸可以對應多個密碼子。

因此大部分情況下,基因變異並不會影響到病毒的特性,所以變異可以分為以下幾個層次:

1,單純的簡併性

密碼子簡併性改變,並不影響基因特點,大部分新冠病毒的變異都是這種。

2,偏好性變化

不同生物對於密碼子的使用是有偏好性的, 如果基因變異影響了密碼子偏好性,那麼即便胺基酸沒有改變,但是也會導致基因的表達受到影響。

3,密碼子改變

這種情況下就會導致蛋白質本身也受到了改變。

當然,有的時候改變是中性的,但是有的時候改變就會影響蛋白質的特性。

今年的D614G,一個月內從出現變成全球主流病毒株就是改變了蛋白的特性導致了快速傳播。而且其感染性能也增強。

這次的N501Y目前觀察到的是傳染性變強,但是研究發現,可能病毒的其他特性也改變了。

病毒的結合能發生了一點改變,這個可能是引發該病毒株傳播能力改變的重要因素。

在小鼠上,N501Y突變可增加小鼠ACE2(mACE2)與SARS-CoV-2 S蛋白RBD之間的結合親和力,這意味著更容易的感染細胞。

residue 501 (N501Y) of RBD in the S protein of SARS-CoV-2. This mutation was predicted to increase binding affinity to mACE2, potentially contributing to broad infectivity of the adapted MASCp6 strain in mice.

當然作者做了一個細胞感染實驗,的確有類似的情況,

但是需要指出的是,作者當時的病毒株變異不只是N501Y一個,還有剩下4個,位於開放閱讀框1ab(ORF1ab),S和N基因上,不過由於S蛋白是新冠的核心蛋白,所以可能意味著這個影響大概率是N501Y造成的。

ref:Gu, Hongjing, et al. "Adaptation of SARS-CoV-2 in BALB/c mice for testing vaccine efficacy."Science369.6511 (2020): 1603-1607.

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