副粘病毒Tianjin株NP、P、M及L蛋白的生物信息學分析

2021-02-08 生物谷

微生物學通報 SEP 20, 2008, 35(9): 1433~1438

副粘病毒Tianjin株NP、P、M及L蛋白的生物信息學分析

石立瑩  李  梅  李曉眠*  何健民  袁立軍

(天津醫科大學基礎醫學院微生物學教研室  天津  300070)

摘  要: 為了進一步明確副粘病毒Tianjin株的來源和種系進化地位, 探討其高致病性的機制。對Tianjin株NP、P、M及L蛋白進行了生物信息學分析。進化樹顯示：Tianjin株屬於副粘病毒亞科呼吸道病毒屬, 且很可能為仙臺病毒新的基因型。相似性比較表明, P蛋白變異最大, 相似性僅為78.7%~91.9%; L蛋白相似性最高, 為96.0%~98.0%。序列比對顯示：NP蛋白胺基酸序列中存在15個獨特的變異位點, P蛋白存在29個, M蛋白存在6個, L蛋白存在29個。這些獨特變異位點的存在很可能是導致Tianjin株在宿主來源和致病特點等方面與已知仙臺病毒株具有較大差異的原因。

關鍵詞: 副粘病毒, 仙臺病毒, 狨猴, 生物信息學

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