這是來自於粉絲的提問,最近一直忙得很,拖了很久一直沒有回覆。今天咬牙抽時間,居然在兩個小時回答了她的問題還順路整理成了教程,-_-||。
本教程適合於圖片文件名具有明顯規律,可以區分不同通道的灰度圖片的批量處理。
一
批量偽彩
0、把需要處理的一萬多張圖片放在一個文件夾(這裡命名為Input)裡,新建一個名為Output(可以是其他名字)的文件夾用來放置添加偽彩之後的圖片。
1、打開Image J批量處理裡面的宏代碼,Process-Batch-Macro。
2、在批量處理對話框的Input和Output裡面定位到第0步設定的兩個文件夾;
在File names contains裡面輸入區分不同通道圖片的文件後綴,這裡是-ch1sk1fk1fl1;
在下面的代碼框裡面輸入兩行代碼(注意在英文輸入法下輸入):
run("Blue");run("RGB Color")
這裡的Blue和-ch1sk1fk1fl1對應(事先已知ch1要對應藍色偽彩),表示所有含有這個後綴的圖片都加藍色偽彩。然後點擊Process即可完成藍色偽彩處理。
3、同樣的方式,把-ch2sk1fk1fl1處理成綠色Green,把-ch3sk1fk1fl1處理成紅色Red,修改File names contains和下面第一行代碼中的單詞即可;
4、這麼三次操作下來,即可完成所有圖片的三種偽彩處理;
二
批量Merge
1、通過Plugin來運行宏代碼「batch RGB merge.ijm」文件;這是別人已經編寫好的代碼文件,直接拿來用即可。公眾號後臺回復1211獲取下載地址;
2、在打開的宏代碼對話框中,將紅、綠、藍設置對應的文件名後綴,下面的堆棧Open as Stack不要勾選;
3、找到剛才存放做好偽彩圖片的文件夾Output;也可以選擇原始文件夾Input,不過這樣會慢一點,因為這個插件會再做一次偽彩;
4、選擇(Select)之後會跳出輸出文件夾設置對話框,這裡繼續選擇Output,讓所有圖片都在一個文件夾(也可以選擇其他文件夾);
5、得到所有圖片的RGB Merge結果。
Fiji軟體下載
鑑於有些同學說F iji 很難下載,下面我把 Fiji 的 win64 版和 mac 版放在了網盤裡面,有需要的請自行下載。
連結:https://pan.baidu.com/s/1JCEtW0jMwnB3mV6jiXlatw
提取碼:xol8(請複製粘貼使用提取碼,我知道你們分不清1和I和l)
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Image J系列教程,建議萌新按照以下順序閱讀
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16、本文
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