目前醫學微生物研究中，無論是人類自身還是為人類服務的實驗動物，腸道糞便樣本的微生物研究佔比都超過50%，這其中如何正確進行糞便標本採集就成為最基礎也是最重要的環節。
An assessment of US microbiome research. Nature Microbiology, 2016, 1(1).
目前關於糞便樣本採集的方法有很多，那麼哪個才是最值得借鑑的呢，今天小編就參考Human Microbiome Project, HMP（人類微生物組計劃）中的「Core Microbiome Sampling Protocol A」把糞便標本收集的方法給大家整理一下，希望對進行腸道微生物研究的您們有所幫助！
提起馬桶座圈。把糞便收集架放在馬桶的後方（圖1）。收集框的四個角應該由馬桶支撐，將收集容器放入收集框中（圖2）。
放下馬桶座圈（圖3）。不要在收集容器中小便，把糞便直接放進收集容器裡（建議：用新鮮糞便的中段，不要糞便表面，不少於3克，建議多備份）。如果發生意外排尿，扔掉糞便，用第二個備用容器重新收集新的樣本。
收集標本後，從框架中取出容器（圖4），將容器放在平面上（圖5），用力壓蓋子，蓋緊，謹防汙染（圖6）（建議：採樣後先用液氮速凍）。
將封閉容器放入拉鏈袋子（圖7），密封好袋子。
丟棄收集框。
將標本編號、收集日期和時間寫在外包裝標籤上，立即按照下列指示包裝樣品（建議：如果不能立即按照下面指示進行標本包裝寄送，先將標本立即放置在-80度保存） 。
在收集標本之前，請7個凝膠袋在冰箱中放置至少12小時（圖1）。
從冰箱中取出冰凍凝膠袋，將兩個冰凍凝膠袋放在泡沫盒底部（圖2）。
將包有糞便標本的密封拉鏈袋放置在泡沫盒冰凍凝膠袋上面（圖3）。
將四個冰凍凝膠袋放在標本容器周圍，使容器完全被包圍（圖4和圖5）。
把一個冰凍凝膠袋放在標本容器的頂部（圖6）。
將泡沫盒蓋好（圖7），放在紙箱中。
使用膠帶密封紙箱的中部和兩側（圖8和圖9），樣品在泡沫盒中存儲不超過24小時（建議：如果24小時內無法寄送到實驗室，建議用乾冰運輸）。
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