近年來,使用MALDI-TOF飛行時間質譜進行微生物鑑定的方法已經普及,並廣泛用於臨床微生物鑑定、食品和藥品工業領域質量控制以及微生物研究領域。然而這種常規方法,也有個別菌種鑑定起來有局限性,例如鑑定混合菌或孢子形成的細菌。我們嘗試換種方法來進行微生物的鑑定。通過MS/MS檢測胰蛋白酶消化的細菌蛋白和資料庫檢索的肽段來鑑定蛋白,鎖定菌種種類,且可以從多個峰中選擇特定的峰,用於蛋白混合物鑑定。我們使用胰蛋白酶珠進行蛋白質的快速酶解,使用島津MALDImini-1數字離子阱MS/MS功能來鑑定芽孢桿菌。
MALDImini-1基質輔助雷射解吸電離數字離子阱質譜儀。數字離子阱(DIT)技術是島津獨有的原創技術,緊湊迷你的體積,僅佔用A3紙大小面積,即可實現MS多級的檢測。數字離子阱是由數位訊號驅動的四極離子阱,使用矩形波RF捕獲離子,更容易調諧頻率,無需使用高壓即可捕獲高質量離子。質量範圍上限可達70000m/z,可拓展更廣泛的應用。
將已形成芽孢的枯草芽孢桿菌取樣,按上圖工作流程製備樣品。胰蛋白酶珠2ul,在溼潤環境和37℃溫度下,30分鐘,對芽孢蛋白進行酶解。通過使用胰蛋白酶珠可縮短通常需要數小時以上的酶解時間。酶解完成後,添加基質溶液1ul,乾燥後MALDImini-1即可開始MS,MS/MS檢測。
MS/MS離子資料庫檢索結果
通過MALDImini-1的MS/MS功能與能夠快速酶切的胰蛋白酶珠消化芽孢蛋白質方法組合,特異性多肽序列可以對芽孢桿菌進行快速鑑定。也有報導對食物中毒菌蠟狀芽孢桿菌和高傳染性炭疽芽孢桿菌進行了相同的研究。
新聞稿內容來源:島津應用新聞NO.B112
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