《普羅米修斯》中最有意思的角色，私以為要數機器人大衛。這個角色有兩個源頭，其一是《異形》系列裡的機器人角色，連名字都是斯科特故意按字母排列的——前幾任的名字分別是Ash、Bishop和Call；其二則是《銀翼殺手》中的反派複製人羅伊貝提，麥可法斯賓德扮演的這個「機器管家」和貝提一樣，情感上更接近人類，具有反思和質疑的精神。在漫長的星際旅行中，他負責照顧休眠的船員，同時學習古人類的語言，因此在登陸之後成了唯一可以與外星人交流的使者。影片最大的轉折就發生在他與人類創造者的一句對話中，可惜沒人能聽見，這也成為了影片中眾多謎團中最引人推究的一個。
正是在大衛這個角色上，斯科特將《銀翼殺手》中對生命的思考引入了《異形》系列。作為追尋人類起源計劃的重要參與者之一，大衛自然而然地也對自己的來歷產生了疑惑：「你們為什麼要造我？」查理的回答顯然令他失望：「不為什麼，只因為我們能造。」對生命喪失了敬畏或許可以解釋複製人此後各種「犯上作亂」的舉動。而這其實也正是人類的處境：我們給自我的起源編造出了各種美妙的傳說，賦予了無比重大的意義，而在創造者面前，或許都只是個笑話而已——他們創造了我們，只因為他們能，並沒有什麼深意。影片從此由科幻躍入了形而上的神話領域。
斯科特在一次訪談中曾如此解釋前傳與《異形》第一集之間的關係：西格妮薇佛在行星LV426上發現的飛船與《普羅米修斯》末尾起飛的飛船誕生於同一時代（前後相差一百年左右），前一艘飛船隨大隊從中繼站LV233行星起飛後，船上的「貨物」出了點問題，駕駛員遇難，於是隕落在LV426，千萬年後才被地球人發現。聯繫到LV233基地中外星人驚惶失措避難的殘影，以及甦醒的外星人怒氣衝衝地要毀滅人類的舉動，整個故事無疑蘊含著重重曲折。
影片上映後，影迷們都在議論「異形從哪裡來？」，「外星人為何要消滅自己創造出來的人類？」等無解的問題，箇中答案，老斯科特承認自己心裡也只有個大概的數。影片末尾，奴米扮演的伊莉莎白劫後餘生，卻不肯回地球，駕著飛船直奔外星人的母星而去，「冒險」也好，「復仇」也好，個人行為一下被提升到了叩問生命起源的高度，正是人類早期神話史詩的格局。類型片的外形至此與哲理電影的內涵交匯到一處，顯示出了創作團隊的勃勃野心。
平心而論，影片的劇情並不新鮮，「太空探險-發現異形-內外危機爆發-消滅異形」的情節線與第一集基本一致，單看故事梗概的話，更像是第一集的高科技升級版。然而33年的時光，已經足以改變許多事情。當年「異形」這一形象的走紅，與冷戰和高科技突飛猛進的社會背景聯繫密切，故事如同一則寓言，集中反映了時代的恐懼。而今日捲土重來的異形，則被納入了更為恢宏的故事背景中，承載了著年逾古稀的導演對生命和世態的思考。在西方人執意要將生命追溯到一尊人格神那裡的基督教背景下，斯科特依然難能可貴地在孜孜表達著一些他所珍視的人文價值觀，例如《角鬥士》中的「家庭」，《天國王朝》中的「良心」，以及《普羅米修斯》中的「質疑」——對權威的質疑，還有對科技的質疑。
依我的理解，「普羅米修斯」在影片中並非某個超級英雄的名字，目前而言，只是飛船的名稱，所謂的「天火」也不是什麼終極兵器，而是既能造福也能惹禍的科技。正如黑液中孕育的抱臉蟲必須通過人類宿主才能完成二次孵化，成為「異形」一般。科技的威權也必須通過誘惑人心才能主宰人類。它將把生命帶到什麼方向？斯科特也沒有答案，但可貴的是，他從未放棄過質疑和思考：「我們的生活比五十年代更好嗎？當然！比1850年代呢？沒有可比性。比1900年呢？也沒有可比性。但我們現在面臨著更大的問題嗎？毫無疑問！」一直「有話要說」，而且「說」得流暢動人，或許這才是貌似商業的斯科特電影始終能打動人心的奧秘所在。