科學網—小葉茶染色體級別基因組圖譜首次完成

2020-11-23 科學網

 

染色體級別的「碧雲」茶樹參考基因組圖譜 高立志供圖

本報訊 近日，生物學預印本伺服器（www.biorxiv.org）在線發表了中美科學家聯合研究團隊的最新成果，該團隊採用單分子實時測序（SMRT）和 Hi-C技術，在20多個代表性小葉茶品種中選用雜合度較低的小葉茶良種「碧雲」，將組裝獲得的約2.85Gb 的基因組序列掛載到了15 條假染色體上，在國際上首次獲得了達到染色體級別的茶樹中國茶變種的參考基因組序列。

論文通訊作者高立志告訴《中國科學報》，通過與基於基因組二代測序技術發表的小葉茶舒茶早基因組草圖比較基因組學分析表明，該研究獲得的基因組圖譜scaffold N50長度高達195.68 Mb，在組裝準確性與完整性上都得到了極大的提升；解析獲得了包括茶多酚、茶氨酸和咖啡因生物合成相關基因在內的40812個蛋白編碼基因的準確序列，首次及時地為全世界茶學研究者提供了準確的茶樹基因信息。

「染色體級別的茶樹『碧雲』參考基因組圖譜的獲得，讓我們第一次看到了茶樹基因組大小變異的動態歷史與成因的真實面目。」高立志表示，利用三代測序技術獲得的「碧雲」茶樹參考基因組使我們追溯到，在過去100萬年中迅速擴增導致了龐大的茶樹基因組。

這張圖譜的繪製，將進一步推進決定茶葉適制性、風味和品質以及茶樹全球生態適應性遺傳基礎的認識；加速茶樹功能基因組學研究、性狀解析、優異新基因發掘以及旨在提高茶葉品質和適應性的茶樹新品種培育，為茶葉深加工產業又快又好地發展提供科技支撐；也將促進茶樹起源與馴化這一重大科學問題的回答並推動全球野生茶樹種質資源的遺傳保護。（韓天琪）

相關論文信息：https://doi.org/10.1101/2020.01.02.892430

《中國科學報》 (2020-01-07 第3版 農業科技)

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