首個鯉魚全基因組序列圖譜完成-光明日報-光明網

2020-11-30 光明數字報

    本報北京9月22日電（記者李慧）由中國水產科學研究院首席科學家孫效文研究員牽頭，中國水產科學研究院聯合黑龍江水產研究所、中科院基因組研究所、哈佛大學、奧本大學等單位組建的國際合作研究團隊，完成了鯉魚全基因組序列圖譜繪製，成為國際上首個完成全面解析的異源四倍體硬骨魚類基因組圖譜。該研究成果於21日在國際生物學權威期刊《自然-遺傳學》雜誌在線發表。

    據孫效文介紹，鯉魚是全球分布和養殖範圍最廣泛的經濟魚類之一，同時是我國最具代表性的淡水養殖魚類之一，也是我國最有條件利用基因組資源進行品種改良的水產養殖物種之一。鯉魚基因組由100條染色體組成，是迄今完成全基因組測序的脊椎動物中染色體數目最多的物種，其基因組經歷了四輪複製，因此也是迄今為止完成解析的最為複雜的四倍化脊椎動物基因組之一。

    專家表示，鯉魚全基因組序列圖譜的完成，標誌著鯉科魚類重要經濟性狀的遺傳解析和遺傳選育研究全面進入基因組時代，對於解析鯉科魚類生長、品質、抗病、抗逆等重要經濟性狀的分子機制具有重要意義，同時也為研究脊椎動物基因組進化和基因衍化機制提供了寶貴的數據和模型，為開展全基因組選擇育種，培育品質優良的鯉魚新品種奠定了堅實基礎，具有重要的理論意義和應用價值。

    據悉，該研究團隊還開展了全球10個代表性品系（種群）33尾鯉魚的基因組重測序研究，首次繪製了全球鯉魚的單鹼基解析度基因組遺傳變異圖譜。此外，通過全基因組多態性掃描和比較轉錄組分析等手段，識別和定位了鯉魚鱗被缺失、體色決定等性狀相關的遺傳位點、功能基因和調控通路。

相關焦點

  • 鯉魚全基因組序列精細圖譜繪製完成
    原標題：鯉魚全基因組序列精細圖譜繪製完成 　　本報記者 馬愛平 　　日前，鯉魚全基因組序列精細圖譜已繪製完成，該基因組覆蓋約為16.9億鹼基，包含52610個功能基因，功能基因數目是大多數硬骨魚類基因數目的兩倍。
  • 全球首個藥用昆蟲基因組圖譜繪製完成-光明日報-光明網
    日前，由四川大學和好醫生藥業集團共同承擔的課題——美洲大蠊全基因組研究取得階段性成果，揭示出全球首個藥用昆蟲美洲大蠊的基因組圖譜。     嶽碧松介紹說，美洲大蠊的基因組十分複雜，經過測序估算，其基因組的大小約為3.2Gb，重複序列高達75%左右，雜合率約為0.7%左右，遠高於大部分其他已測序昆蟲，為基因組測序和組裝帶來極大困難。
  • 【科技日報】小麥A基因組序列精細圖譜完成
    【科技日報】小麥A基因組序列精細圖譜完成 2018-05-11 科技日報 趙漢斌 【字體：A基因組序列精細圖譜。　　中國科學院遺傳與發育生物學研究所植物細胞與染色體國家重點實驗室的小麥基因組研究團隊與遺傳發育所的梁承志課題組等合作，通過構建A基因組測序，結合全基因組單分子測序以及最新物理圖譜構建技術，完成了烏拉爾圖小麥材料G1812的基因組測序和精細組裝，繪製出了7條染色體的序列圖譜，注釋出了41507個蛋白編碼基因，實現了小麥基因組研究的重大突破。
  • 北京市農林科學院完成首張西瓜基因組序列圖譜與破譯
    近日，北京市農林科學院宣布完成了世界首張西瓜基因組序列圖譜繪製與破譯，該研究成果於2012年11月25日在國際學術刊物《自然·遺傳學》（影響因子為35.53）上在線發表。
  • 世界首張西瓜基因組序列圖譜完成
    中國首次將磷光熱圖技術   成功應用於型號試驗   中國空氣動力研究與發展中心超高聲速研究所11月28日宣布，該所利用磷光熱圖技術在φ0.6米激波風洞順利完成某型號測熱試驗，得到不同狀態下模型表面的大面積熱流分布特徵
  • 蒙古族人全基因組序列圖譜繪製完成
    2011年12月19日，由內蒙古農業大學、內蒙古民族大學和深圳華大基因研究院合作開展的第一個蒙古族人的全基因組序列圖譜繪製工作已經完成。科學家們將此圖譜譽為「天驕一號」，這標誌著我國的人類學、民族學、人類遺傳學及醫學健康研究進入基因組水平。    基因採樣的成年蒙古族男子系成吉思汗黃金家族的34代孫，具有完善的家族系譜記錄，且沒有和外族通婚史。科學家們利用新一代高通量測序技術，採取了從頭測序和重測序兩種方法分別獲得全基因組序列。
  • 我國科學家繪製出世界首個石斑魚類基因組序列圖譜
    3月18日，中山大學和深圳華大基因研究院召開新聞發布會，宣布石斑魚基因組序列圖譜繪製完成。這是中國完成的第三個魚類基因組測序項目和全基因組序列圖譜，也是世界上首個鱸形目鮨科石斑魚類基因組序列圖譜。圖譜的建立，對建立魚類性別控制的生物技術途徑和揭示整個脊椎動物性別決定機制的形成及進化途徑具有重要的理論價值。
  • 我國率先繪出石斑魚全基因組序列圖譜
    本報訊 中山大學和深圳華大基因研究院日前聯合宣布，石斑魚基因組序列圖譜繪製完成。中國工程院院士、中山大學生命科學學院林浩然表示，這是我國完成的第三個魚類基因組測序項目和全基因組序列圖譜，也是世界上首個鱸形目鮨科石斑魚類基因組序列圖譜。 石斑魚類隸屬鱸形目（Perciformes），鮨科（Serranidae），石斑魚亞科（Epinephelinae），石斑魚屬（Epinephelus），為暖水性礁棲魚類，廣泛分布於印度洋和太平洋的熱帶、亞熱帶海域。
  • 海洋所科研人員繪製完成牡蠣全基因組序列圖譜
    近日，牡蠣基因組計劃（Oyster Genome Project，OGP）項目組宣布，歷時兩年的牡蠣基因組序列圖譜終於繪製完成。這是世界上第一張養殖貝類的全基因組序列圖譜，標誌著基於短序列的高雜合度基因組拼接和組裝技術獲得了重大突破。據悉，目前的基因組圖譜已達到國際領先的基因組圖譜標準。近年來，我國的海水養殖業取得了長足發展。
  • 科學網—華中農業大學繪出最完整甜橙全基因組序列圖譜
    3月21日，甜橙全基因組序列圖譜在華中農業大學宣告完成。
  • 科學網—穀子全基因組序列圖譜構建成功
    本報訊（記者高長安 通訊員全志武）近日，河北省張家口市農科院和深圳華大基因研究院等單位的科研人員成功完成了穀子全基因組序列圖譜的構建
  • 中國科研人員繪製完成民豬首部全基因組序列圖譜
    原標題：中國科研人員繪製完成民豬首部全基因組序列圖譜新華網哈爾濱11月7日電（記者王建、潘祺）7日，由黑龍江省農業科學院和中國農業大學共同組建的科研團隊對外宣布，已完成民豬的全基因組從頭測序工作，並成功繪製民豬的首部全基因組序列圖譜。專家表示，這有利於更好地保證中國豬品種的多樣性。
  • 西藏完成世界首個裂腹魚類基因組圖譜
    9月25日，記者從自治區農牧學院水產科學研究所（以下簡稱「區農科院水產所」）了解到，該所牟振波研究員團隊，繪製完成了世界上首個染色體水平的高原特有典型四倍體魚類——異齒裂腹魚的基因組圖譜，為其他高原魚類進化
  • 揭秘首個中國人基因組圖譜繪製過程(組圖)
    我國科學家昨日對外宣布，他們已經成功繪製完成第一個完整中國人基因組圖譜(又稱「炎黃一號」)，這也是第一個亞洲人全基因序列圖譜。該項目是我國科學家繼承擔國際人類基因組計劃1%任務、國際人類單體型圖譜10%任務後，用新一代測序技術獨立完成的100%中國人基因組圖譜。
  • 科學網—我國科研人員成功構建穀子全基因組序列圖譜
    穀子遺傳連鎖圖 【科學網 高長安 全志武報導】近日，河北省張家口市農科院和深圳華大基因研究院聯合成功完成穀子全基因組序列圖譜的構建。這些特性使穀子能夠成為基因組分析和研究的一個很好的新的模式作物。 在本研究中，科研人員通過新一代測序技術對一株來自中國北方的穀子品系進行了全基因組測序和從頭組裝，獲得了穀子的全基因組序列圖譜（組裝得到的基因組大小約為423Mb，N50達到了1.0Mb）。通過基因組注釋和分析發現，穀子基因組中的重複序列約佔整個基因組的46%，大約含有38,801個蛋白質編碼基因。
  • 中國首次完成梅花全基因組序列
    中國首次完成梅花全基因組序列，為水果改良育種奠定基礎　　【搜狐科學信息】據國外媒體報導，中國的科研團隊在世界範圍內首次測定了梅花的基因組序列。但其高度雜合性也增加了基因組整合的難度。研究人員採用新一代的測序技術（NGS）和全基因組映射技術（WGM），對西藏的一個野生種構建出高密度的遺傳圖譜。最終成功得到了長達237Mb的梅花基因組參考序列。　　通過研究與抗病性相關的基因將有利於培育抗病的梅花品種。研究發現在梅花基因組中存在和抗病相關的基因—PR基因家族。
  • 倭黑猩猩基因組測序完成-光明日報-光明網
    英國《自然》雜誌網站刊登報告說，德、美、英等國研究人員完成了對倭黑猩猩的基因組測序，這是科學界繼紅毛猩猩、大猩猩和黑猩猩之後，獲得的又一份人類「近親」的基因組圖譜，有助於對比研究哪些基因導致了人類與各種猩猩的區別。    該研究組完成了對一隻18歲的雌性倭黑猩猩的基因組測序。
  • 全球首個藥用昆蟲基因組圖譜發布
    全球首個藥用昆蟲基因組圖譜發布     四川擬在昆蟲類藥品引入全基因組測序    本報訊（記者 寇敏芳）12月10日，好醫生藥業集團和四川大學共同在北京發布了美洲大蠊全基因組研究的階段性成果
  • 華大基因幫丹麥人構建了基因組序列與變異圖譜
    （原標題：中丹合作構建丹麥人泛基因組圖譜） 科技日報訊
  • 首份個人DNA圖譜 60億對鹼基序列全破譯
    中國日報網環球在線消息：54年前，美國生物學家詹姆斯沃森與弗朗西斯克裡克共同發現了脫氧核糖核酸（DNA）分子結構的雙螺旋模型，並因這項基因研究領域的重大突破在1962年獲得諾貝爾獎。今天，沃森成為自己研究的受益者——他將成為世界第一份完全破譯的「個人版」基因組圖譜的擁有者。