空氣微生物研究,不可錯過的DNA提取和宏基因組學測序新方法!!!

2021-01-20 美吉生物

清華大學生命學院朱聽課題組於2015年4月23日在Nature Protocols在線發表了題為Optimized DNA extraction and metagenomic sequencing of airborne microbial communities(空氣微生物DNA提取及宏基因組測序方法)的論文,報導空氣微生物宏基因組測序新技術。

大氣生物圈是一個與其它環境生物圈密切相關,且與人類呼吸系統及皮膚直接作用的重要生物圈。目前DNA測序和宏基因組學方法雖已被廣泛用於其它環境微生物研究,但將其應用於空氣微生物的研究一直存在樣品DNA含量少,傳統方法難以獲得足夠DNA進行測序等技術困難。

朱聽課題組建立了一套從空氣顆粒物樣品中提取、純化DNA、測序及宏基因組學分析的技術。這套新技術的建立使得對空氣微生物的全面宏基因組研究成為可能,也為其它環境微生物研究提供了一種通用方法。因此,該技術的實驗方法被約稿在Nature Protocols上進行了詳細報導。

朱聽課題組的主要科研方向是研究、開發與核酸相關的生物新技術。自2012年初建立,朱聽課題組開始進入環境微生物領域,重點開展針對空氣微生物宏基因組測序技術的研究,2014年1月即在權威環境科學雜誌ES&T發表了題為Inhalable microorganisms in Beijing’s PM2.5 and PM10 pollutants during a severe smogevent的研究論文,該論文報導了北京市霧霾天氣中大氣懸浮顆粒物的微生物組分。首次完成對空氣微生物的宏基因組測序,並在「種」的水平上鑑別空氣中複雜的微生物組分。此項研究結果及其使用的新技術得到了包括Nature,Scientific American, Los Angeles Times, 參考消息、科技日報、北京日報等國內外學術、社會媒體的廣泛報導,同時也使關於大氣生物圈的研究逐漸成為環境微生物學的一個新興領域。

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